| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,273,702 | C→G | 7.8% | R236R (CGG→CGC) | PP_2004 ← | AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,273,702 | 0 | C | G | 7.8% | 321.7 / 14.6 | 103 | R236R (CGG→CGC) | PP_2004 | AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/54); new base G (4/4); total (45/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GAAAGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGTGCTGCAAAG > NC_002947/2273554‑2273851 | gAAAGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCAccc > 1:321276/1‑150 (MQ=255)gAAAGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCAccc > 2:1991251/1‑150 (MQ=255) aaGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCcgc < 1:13945/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGt < 1:1724480/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTgcgc < 1:1229772/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTg < 1:260035/150‑1 (MQ=255) cTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgca > 2:2252953/1‑150 (MQ=255) cTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgca < 2:1781123/150‑1 (MQ=255) ttgcgccGCAAGCTCGCGGAGGAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgcag > 2:1008749/6‑150 (MQ=255) tcctccGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgcagc > 1:1735687/1‑150 (MQ=255) tggaccTTGCGCCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTgca < 1:917915/137‑1 (MQ=255) cTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTc < 1:1214183/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTc < 2:679711/150‑1 (MQ=255) gcgcAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACaa > 1:958179/1‑150 (MQ=255) cAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTg > 1:903409/1‑150 (MQ=255) aaGGTCCAGCTTGGTAGCTGCACGTGCCGAGCAGTTTGCGCCGTGGTCAGG‑TCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGCCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGc < 1:2339837/150‑1 (MQ=255) aGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCa > 1:74971/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCg > 2:1725254/1‑138 (MQ=255) gTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCg < 1:1725254/138‑1 (MQ=255) cAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGTTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAgg > 1:56214/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgcagt > 2:39234/1‑117 (MQ=255) cAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACGCGGGTgcgcagt < 1:39234/120‑4 (MQ=255) cAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAgg < 1:389123/150‑1 (MQ=255) gCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCCGAACGTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtg < 1:1643183/150‑1 (MQ=255) ttGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGtgct > 1:648025/1‑150 (MQ=255) aGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAg < 2:903409/150‑1 (MQ=255) aGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAg < 1:1991251/150‑1 (MQ=255) tGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTCCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTa > 2:2271585/1‑150 (MQ=255) gCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCa > 2:1083275/1‑145 (MQ=255) 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ccACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGcc > 1:169805/1‑150 (MQ=255) aCTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCg < 2:599388/150‑1 (MQ=255) ctt‑cttCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCgg < 2:895881/150‑1 (MQ=255) ctt‑cttCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCgg < 2:576528/150‑1 (MQ=255) t‑cttcCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCgggg < 1:1429363/150‑1 (MQ=255) tcCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTg < 2:648025/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTgg < 2:309788/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGc < 1:1903569/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGcc > 2:1580606/1‑150 (MQ=255) aGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGcc > 2:840026/1‑150 (MQ=255) 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cccAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCa < 2:8886/145‑1 (MQ=255) cccAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGa > 1:203479/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGAt > 1:986356/1‑150 (MQ=255) gcagGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCa < 2:2372967/141‑1 (MQ=255) gcagGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCa > 1:2372967/1‑141 (MQ=255) cagGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGcc < 2:492412/150‑1 (MQ=255) ggtgggtgATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCggg > 2:1999128/1‑103 (MQ=255) ggtgggtgATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCggg < 1:1999128/103‑1 (MQ=255) ggtgggtgATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGt < 1:2252953/150‑1 (MQ=255) gtgggtgATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTc < 1:2271585/150‑1 (MQ=255) tgggtgA‑GCGCATCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGATTCCCACAACTGCAACAGGTGCTGCGAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGGcg > 2:1371603/1‑150 (MQ=255) 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cACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGca < 2:2135558/150‑1 (MQ=255) cccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGcaca < 1:85579/150‑1 (MQ=255) tgctgcagcgcACGCGGGTGCGCAGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAg > 2:1904789/8‑150 (MQ=255) ccAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAg > 2:482088/1‑150 (MQ=255) aGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGc < 1:529511/150‑1 (MQ=255) aGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGc < 1:210203/150‑1 (MQ=255) tgcagcgcACGCGGGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCg > 1:1277484/5‑150 (MQ=255) aCTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGt < 1:1605017/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGt < 2:169805/150‑1 (MQ=255) gcgcACGCGGGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGtt < 2:1927600/81‑1 (MQ=255) gcgcACGCGGGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGtt > 1:1927600/1‑81 (MQ=255) 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GAAAGCGCGTGCCTTCCTCCGCGAGCTTGCGGCGCAAGGTCCAGCTTGGTAGCTGCAAGTGCAGCGCCACTT‑CTTCCAGGTCCGGTTCACGGCCGCCATTGAGCAGCGGGCCCAGCAGGTGGGTGATGCGC‑TCACCCAGACTGCGCACCCGCGTGCGCTGCAGCAGCTCTGCTTCGCACAACTGCAACAGGTGCTGCCAGGTACTCGGGCAATGCCCGGGGTTGGCCAGTTGCAAGGTAGCGCGGCTCAGACGCAGCTGATTGCCGTCGGCGGCGAACTGCACAGGCGTGCTGCAAAG > NC_002947/2273554‑2273851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |