| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,277,418 | 0 | G | T | 5.4% | 351.4 / 2.9 | 109 | A402D (GCC→GAC) | PP_2007 | P‑47‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/49); new base T (3/3); total (57/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CAGGGTCTGGCGCGCGGTTTCATTGAGGTGATCGAGGCGCAGCGAGATGGGTTGGGCAAACCCGGACAGCATGACCTTGCTTTCATTGCTCATGATACGGCTCCTTGTGTTGGTGGGGTCACACGTAGTTGATGACAAGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCAGGCTGA > NC_002947/2277272‑2277565 | cAGGGTCTGGCGCTCGGTTTCATTGAGGTGATCGAGGCGCAGCGAGATGGGTTGGGCAAACCCGGACAGCATGACCTTGCTTTCATTGCTCATGATACGGCTCCTTGTGTTGGTGGGGTCACACGTAGTTGATGACAAGGGCCTCGGCGa < 1:313972/150‑1 (MQ=255) aGGGTCTGGCGCGCGGTTTCATTGAGGTGATCGAGGCGCAGCGAGATGGGTTGGGCAAACCCGGACAGCATGACCTTGCTTTCATTGCTCATGATACGGCTCCTTGTGTTGGTGGGGTCACACGTAGTTGATGACAAGGGCCTCGGCGAg < 2:567376/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGCGCGCGGTTTCATTGAGGTGATCGAGGCGCAGCGAGATGGGTTGGGCAAACCCGGACAGCATGACCTTGCTTTCATTGCTCATGATACGGCTCCTTGTGTTGGTGGGGTCACACGTAGTTGATGACAAGGGCCTCGGCGAGGt < 1:2123287/150‑1 (MQ=255) 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aCAAGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTg > 2:2250048/1‑150 (MQ=255) cAAGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGa > 2:226887/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTcc > 1:1386467/1‑50 (MQ=255) aaGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTcc < 2:1386467/50‑1 (MQ=255) aaGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGt < 1:403316/147‑1 (MQ=255) aaGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGt > 2:403316/1‑147 (MQ=255) aaGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGCTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGAGCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGAt > 2:1136464/1‑150 (MQ=255) gCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCTTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCCgg < 1:1290443/150‑1 (MQ=255) gCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCAgg < 1:850943/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCAGGCt > 1:565019/1‑150 (MQ=255) cGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCAGGCTGa < 1:393034/150‑1 (MQ=255) | CAGGGTCTGGCGCGCGGTTTCATTGAGGTGATCGAGGCGCAGCGAGATGGGTTGGGCAAACCCGGACAGCATGACCTTGCTTTCATTGCTCATGATACGGCTCCTTGTGTTGGTGGGGTCACACGTAGTTGATGACAAGGGCCTCGGCGAGGTAGCTCGACGAAGCGGTATGGGTGTCGTTGCTCCAGGACACGCAATCGATGGTGTCGGCCTTGACCGAGCCGCCACGCGCGGCGATGGCGCTGATCAGGTCATCGGAGATCACAGCGGCGACGATGTGGGTGATCAGGCTGA > NC_002947/2277272‑2277565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |