| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,294,064 | T→A | 7.1% | L6M (TTG→ATG) | PP_2020 → | lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,294,064 | 0 | T | A | 7.1% | 257.9 / 7.3 | 82 | L6M (TTG→ATG) | PP_2020 | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/37); new base A (3/3); total (42/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 | |||||||||||
GGGCCTGATGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCACTGTC > NC_002947/2293916‑2294210 | gggCCTGATGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCAtt < 2:653666/150‑1 (MQ=255) ccTGATGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAACATAATGGACAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTTCg > 2:1770909/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGc < 1:1438884/150‑1 (MQ=255) aTGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCAATGCGGccc > 2:28599/1‑150 (MQ=255) tGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcctc < 1:2194934/150‑3 (MQ=255) tGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCAATGCGGcccc < 2:473184/150‑1 (MQ=255) cTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCAATGCGGccccct < 1:28599/150‑2 (MQ=255) gACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCgg < 2:2157785/150‑1 (MQ=255) aCCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGt > 2:377258/1‑150 (MQ=255) cATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTg > 1:2261548/1‑133 (MQ=255) cATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTg < 2:2261548/133‑1 (MQ=255) tgctgcTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTg > 2:2354285/1‑150 (MQ=255) ctgctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGTTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCTCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGcc < 2:361729/150‑1 (MQ=255) ctgctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGAAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGcc > 1:780971/1‑150 (MQ=255) tgctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCg < 1:51345/130‑1 (MQ=255) tgctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCg > 2:51345/1‑130 (MQ=255) tgctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCa > 1:1634745/1‑150 (MQ=255) gctTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAg > 2:1376089/1‑150 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGGGGGGGCCGCAATGCGGccccctcc < 2:1049316/136‑4 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGGGGGGGCCGCAATGCGGccccctcc > 1:1049316/1‑133 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccc < 1:726664/132‑1 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccc < 2:448823/132‑1 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccc > 1:448823/1‑132 (MQ=255) tttGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccc > 2:726664/1‑132 (MQ=255) cATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCgg > 2:1153577/1‑121 (MQ=255) cATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCgg < 1:1153577/121‑1 (MQ=255) ttgggTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATg > 1:2403033/4‑150 (MQ=255) tgGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATgg > 1:1626095/1‑139 (MQ=255) tgGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATgg < 2:1626095/139‑1 (MQ=255) gctgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATgg > 1:693887/1‑137 (MQ=255) gctgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATgg < 2:693887/137‑1 (MQ=255) gctgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTc > 1:180584/1‑150 (MQ=255) tgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccccc < 2:75341/107‑1 (MQ=255) tgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGcccccc > 1:75341/1‑107 (MQ=255) tgctACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTccc < 2:2403033/150‑1 (MQ=255) tACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGc > 2:910009/1‑115 (MQ=255) tACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGc < 1:910009/115‑1 (MQ=255) cGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCg > 1:1410875/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGCGGTTCCTGTTCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGAACGTGTAGTGGAGGGGACCGCATTGCGCCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTAc < 1:1376089/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGc > 1:932357/1‑88 (MQ=255) ttGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCgg > 1:1514881/1‑98 (MQ=255) ttGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCgg < 2:1514881/98‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGTTCCGGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGc < 2:932357/88‑1 (MQ=255) gcgcGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCg > 1:685429/1‑86 (MQ=255) gcgcGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCg < 2:685429/86‑1 (MQ=255) cgcgGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGccc < 2:1603584/150‑1 (MQ=255) ccTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTc < 2:180584/150‑1 (MQ=255) gATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTg > 1:948048/1‑150 (MQ=255) aTCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGc > 1:2018062/1‑150 (MQ=255) aTCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGc < 2:1410875/150‑1 (MQ=255) aTCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGc > 1:1759788/1‑150 (MQ=255) gCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCa > 1:22591/1‑89 (MQ=255) gCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCa < 2:22591/89‑1 (MQ=255) cTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCgg < 2:1973296/76‑1 (MQ=255) cTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCgg > 1:1973296/1‑76 (MQ=255) gaagaTGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCtttt < 2:780971/150‑1 (MQ=255) agaTGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACGGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGa < 2:1634745/150‑1 (MQ=255) agaTGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGa < 1:1190128/150‑1 (MQ=255) ggaggGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGt < 2:2030935/58‑1 (MQ=255) ggaggGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGt > 1:2030935/1‑58 (MQ=255) gtgggtCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTCCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCt > 1:2295479/1‑150 (MQ=255) gggtCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTc > 1:842714/1‑150 (MQ=255) ggtCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCg > 1:2094532/1‑150 (MQ=255) gtCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGa < 2:2094532/150‑1 (MQ=255) gtCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGAGATGCTTTTTATCGACGGCCTGCACGCCTTCGa < 1:1770909/150‑1 (MQ=255) tCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATTGCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCATTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGAt < 2:420589/150‑1 (MQ=255) tCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGAt > 1:2071155/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTc > 2:1782440/1‑150 (MQ=255) tCTTCGCCCATTGATTGGAGGGTGTCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCATATGGGTACCCCTATGTCCTCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCa < 2:569045/150‑1 (MQ=255) gCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGAt > 1:152969/1‑141 (MQ=255) gCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGAt < 2:152969/141‑1 (MQ=255) gCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGtt > 2:122484/1‑150 (MQ=255) attgattgGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTtgatg > 1:132157/1‑150 (MQ=255) ttgGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGGTCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGcc < 1:122484/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGc < 2:948048/150‑1 (MQ=255) ggggCCGCAATGCGGCCCCCTGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTc > 2:513017/1‑150 (MQ=255) ggCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCAc > 2:564854/1‑150 (MQ=255) ggCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCAc < 2:2348138/150‑1 (MQ=255) gCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCACt > 1:1511050/1‑150 (MQ=255) gCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCACt < 2:2018062/150‑1 (MQ=255) ccGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTAcccc > 2:2229035/1‑52 (MQ=255) ccGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTAcccc < 1:2229035/52‑1 (MQ=255) gCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCACTGTc > 1:1581435/1‑150 (MQ=255) | GGGCCTGATGCTGACCTTCATGCTGCTTTGGAACATGTTTGGTGCGCTGTGGCTGCTACCGGCATTGGCGCGGTTCCTGATCAAGCCTGAGAAGATGGTGGGCAAGGAGGGTGGGTCGATCTTCGCCCATTGATTGGAGGGGGCCGCATTGCGGCCCCCCGGTTATACTGCCAGCTCATTTCAGATGGGTACCCCTATGTCCCCCCTCGCTACCGCCCTGCAGTCCTGCGATATGCTTTTGATCGACGGCCTGCACGCCTTCGATTTCACCGTTGATGAAGCCGGCCTCACTGTC > NC_002947/2293916‑2294210 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |