| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,318,705 | C→T | 5.3% | R302C (CGC→TGC) | PP_2039 → | acyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,318,705 | 0 | C | T | 5.3% | 226.2 / 2.5 | 78 | R302C (CGC→TGC) | PP_2039 | acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/36); new base T (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
CCCCACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCTGCGT > NC_002947/2318560‑2318854 | ccccACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACgcag > 1:8387/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCAt > 2:187699/1‑150 (MQ=255) aCCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATg < 2:8387/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATg < 2:319317/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATg < 1:2234300/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCGTGCAGCATgcag < 1:1103923/150‑4 (MQ=255) ttGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTc > 1:2397064/1‑150 (MQ=255) ggCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCa < 2:2397064/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACgg > 1:1535111/1‑150 (MQ=255) gccggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCa > 1:2299886/1‑150 (MQ=255) ggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCcgcg > 1:959960/1‑150 (MQ=255) ccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCAc > 2:280972/1‑141 (MQ=255) ccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCAc < 1:280972/141‑1 (MQ=255) tGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGTTGCGTGCAGCATgc > 1:2164808/1‑128 (MQ=255) tGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGTTGCGTGCAGCATgc < 2:2164808/129‑2 (MQ=255) ggCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGaa < 2:1535111/150‑1 (MQ=255) gCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 2:959960/150‑1 (MQ=255) gCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 2:89982/150‑1 (MQ=255) tGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACg > 1:2296535/1‑150 (MQ=255) ccTCTCGATCGACTATGCCGGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAATCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGATCTGCATGCTGCACGCAGCATGTTCTACTCCGCGGCAGCGGTGAATGACGCcgg > 1:859073/1‑150 (MQ=255) tctcGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCcggcg > 1:1905212/1‑150 (MQ=255) tcgatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCggcggc > 2:1297272/1‑150 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGTACgcagc < 2:1735963/109‑1 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGTACgcagc > 1:1735963/1‑109 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGa < 1:1341942/134‑1 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGa > 2:1341942/1‑134 (MQ=255) cTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCg > 2:1181729/1‑150 (MQ=255) tATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGc < 2:2296535/150‑1 (MQ=255) tATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCAGTTTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGc < 1:1833084/150‑1 (MQ=255) ccGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCa > 1:1332693/1‑150 (MQ=255) cGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAg < 2:888546/150‑1 (MQ=255) cGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCAAGAAGACCCCCTGTAGAATCTCGGACATTGGTACCGTGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGGCGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAg > 1:45183/1‑150 (MQ=255) gcAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGa < 2:2313471/150‑1 (MQ=255) aaGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGAtg > 2:1303919/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa < 2:1076609/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt > 1:336205/1‑108 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 2:336205/108‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAg > 1:792995/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTCCATGCTGCAAGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAg > 1:1962517/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATAGGCACAGGGTGGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAg > 2:1532304/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGtt < 2:780810/150‑1 (MQ=255) cAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTc < 1:1167382/150‑1 (MQ=255) cAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTc < 2:1905212/150‑1 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGgaga > 1:1513885/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATTGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACg < 2:1027584/150‑1 (MQ=255) aGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa > 2:2322948/1‑124 (MQ=255) aGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa < 1:2322948/124‑1 (MQ=255) gTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 1:922037/82‑1 (MQ=255) gTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt > 2:922037/1‑82 (MQ=255) tCGATCAACCATATGATCGCCGACCCGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc < 1:1220/148‑1 (MQ=255) tCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc > 2:1220/1‑148 (MQ=255) aTCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATc < 1:187699/150‑1 (MQ=255) aaCCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGcc < 2:1513885/150‑1 (MQ=255) ccATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGa > 1:1096000/1‑150 (MQ=255) tatGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATcg > 1:2163040/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGGACCCGGGCCCCGATGTGTAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGcc < 1:1472771/150‑1 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTAc > 2:1014915/1‑44 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTAc < 1:1014915/44‑1 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGc > 2:335818/1‑150 (MQ=255) 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ggCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTc > 2:1689869/1‑121 (MQ=255) ggCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTc < 1:1689869/121‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcggcg < 1:683084/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcggcgg > 1:396359/1‑150 (MQ=255) tGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGa > 2:250654/1‑78 (MQ=255) tGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGa < 1:250654/78‑1 (MQ=255) gCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCgg < 1:1303919/150‑1 (MQ=255) cATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCggg > 2:1259410/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGACAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGgc > 2:282385/1‑150 (MQ=255) gctgcACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGa > 1:667199/1‑37 (MQ=255) gctgcACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGa < 2:667199/37‑1 (MQ=255) cACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCtgctgc > 2:1896982/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCGGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCTGCg > 1:2106605/1‑150 (MQ=255) cGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCTGCGt < 2:1332693/150‑1 (MQ=255) cGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCTGCGt > 1:483981/1‑150 (MQ=255) | CCCCACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCTGCGT > NC_002947/2318560‑2318854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |