Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 715,019 | Δ1 bp | 14.1% | coding (478/483 nt) | PP_0607 ← | type IV pili biogenesis protein FimT |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 715,019 | 0 | A | . | 14.1% | 180.9 / 26.9 | 64 | coding (478/483 nt) | PP_0607 | type IV pili biogenesis protein FimT |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/27); new base . (6/3); total (34/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.78e-01 |
GGACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAGC > NC_002947/714871‑715167 | ggACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTagcag > 1:316507/1‑150 (MQ=255) gAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGc > 1:68840/1‑150 (MQ=255) cACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctcc > 2:1199295/1‑150 (MQ=255) aCCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCg > 2:1298094/1‑150 (MQ=255) cTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTa > 1:842018/1‑150 (MQ=255) ttttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGGCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTaa < 1:1670799/150‑1 (MQ=255) tttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAg < 2:68840/150‑1 (MQ=255) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCTACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAc < 1:301282/150‑1 (MQ=255) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGcag < 2:951214/127‑3 (MQ=39) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGcag > 1:951196/1‑125 (MQ=39) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGcag > 1:951214/1‑125 (MQ=39) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGcag < 2:951196/127‑3 (MQ=39) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAc < 2:471918/150‑1 (MQ=255) cAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAct > 2:1031303/1‑150 (MQ=255) agCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGcc < 1:1298094/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGAt < 2:316507/150‑1 (MQ=255) cgctcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCa < 2:842018/150‑1 (MQ=255) gctcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAg > 2:1298189/1‑111 (MQ=255) gctcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAg < 1:1298189/111‑1 (MQ=255) aTCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCTTTGCGCGAAACAAGACCGCTCCTGCAATGACAGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCATGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTCCCGCTTGATGCCAGCACCACCt < 2:220822/150‑1 (MQ=255) aTCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTc < 2:647055/101‑1 (MQ=255) aTCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGATGCTGTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTc > 1:647055/1‑101 (MQ=255) tCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTg > 2:1516790/1‑150 (MQ=255) gggCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCg > 1:1084229/1‑150 (MQ=255) ggCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCgg < 1:488900/150‑1 (MQ=255) aGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTg < 1:985926/150‑1 (MQ=255) aGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTg > 1:705840/1‑150 (MQ=255) gTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGc > 2:978382/1‑150 (MQ=255) gTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGc > 1:240938/1‑150 (MQ=255) gTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATACCAGCACCACCTGATATCGGCTGc > 1:1734360/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGCAATTGAAGGGGCTGCTTGGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCg > 2:1392161/1‑150 (MQ=255) cccgacgCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCTACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGGAGCAGTCATTTCTCAGGTCCTCTGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCGCCTGATATCGGCTGCGa < 2:1740389/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCg < 1:1100887/116‑1 (MQ=255) ccgccgCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCg > 2:1100887/1‑116 (MQ=255) cgccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGagcagc < 2:625355/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGgcgc < 2:705840/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGt < 1:1516790/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTCCACCGTTCCTCCGTAAGCGCCCGGAGTCGGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGtt < 1:236436/150‑1 (MQ=255) aGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGc > 1:1434140/1‑134 (MQ=255) aGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGc < 2:1434140/134‑1 (MQ=255) gctgctTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCGAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGcac > 2:1726961/1‑150 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTGAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATGGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTAGCACAt > 1:1788923/1‑150 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACAt > 1:1402980/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCa < 1:1199295/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTg > 2:646244/1‑150 (MQ=255) tGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTgcgc < 2:1402980/150‑1 (MQ=255) acaAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAg > 2:617095/1‑150 (MQ=255) aCCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCGGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCtt > 1:1851493/1‑73 (MQ=255) aCCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCtt < 2:1851493/73‑1 (MQ=255) aCCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGtt < 1:1536393/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGtt > 1:189375/1‑150 (MQ=255) cTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGccc > 1:376821/1‑150 (MQ=255) tCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCg < 1:1031303/150‑1 (MQ=255) tgagCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGa > 1:1565167/4‑150 (MQ=255) tGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGa > 2:1897516/1‑95 (MQ=255) tGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGa < 1:1897516/95‑1 (MQ=255) tGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACg > 1:498037/1‑150 (MQ=255) cAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACGACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTc > 2:771809/1‑150 (MQ=255) aaTGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCg < 1:1448624/85‑1 (MQ=38) aaTGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCg > 2:1448624/1‑85 (MQ=38) aaTGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctcc > 1:1501705/1‑38 (MQ=255) aaTGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctcc < 2:1501705/38‑1 (MQ=255) aTGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACTTTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCAt > 2:118813/1‑150 (MQ=255) gACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCAAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATgg < 1:646244/150‑1 (MQ=255) tAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCAGTTGCCCGACGTCATGGgcccgccc > 2:1850541/1‑150 (MQ=255) agcagcGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCa < 1:1215897/150‑1 (MQ=255) cagcGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAgc < 1:617095/150‑1 (MQ=255) | GGACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAGC > NC_002947/714871‑715167 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |