Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,698,797 | Δ1 bp | 6.4% | coding (503/1014 nt) | cheBC → | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,698,797 | 0 | A | . | 6.4% | 322.9 / 17.0 | 109 | coding (503/1014 nt) | cheBC | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/52); new base . (4/3); total (53/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.67e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TTGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACCGCC > NC_002947/1698649‑1698944 | ttGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGaa < 1:885370/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGaa < 1:305964/150‑1 (MQ=255) tgcGCAAGATCCTCAATATCGGCT‑CCGCCACGGACCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgc > 1:1506432/1‑150 (MQ=255) gcAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgctgc < 2:798089/150‑1 (MQ=255) aaGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTc > 2:786179/1‑150 (MQ=255) gATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCaa < 1:744464/150‑1 (MQ=255) ccTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgc > 1:1254174/1‑140 (MQ=255) tCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCATGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTTTCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGtt > 1:1288817/1‑150 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGc < 1:1633941/150‑1 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCg < 2:1000559/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCa < 2:1837979/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCa < 2:514721/150‑1 (MQ=255) gctggTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGtt > 2:1536643/1‑150 (MQ=255) tggTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCTGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTgctgct > 1:1410130/1‑127 (MQ=255) tggTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCTGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTgctgct < 2:1410130/127‑1 (MQ=255) tggTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTc > 2:1492092/1‑150 (MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGc > 2:1126176/1‑132 (MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGc < 1:1126176/132‑1 (MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggcgg > 2:711440/1‑150 (MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGACAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggcgg > 2:382468/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCggcggc > 1:175066/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCggcggc > 2:229782/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCACAGCAGCACTTCG‑AGtgctgccgg > 1:175259/1‑119 (MQ=255) cagcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATc > 2:915516/1‑150 (MQ=255) agcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTTCTGCTCAAGGGttt < 2:1627834/124‑1 (MQ=255) agcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGttt > 1:1627834/1‑124 (MQ=255) gTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 2:1106430/1‑150 (MQ=255) gTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCCGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 1:1015210/1‑150 (MQ=255) gCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTCGTGGCAATTGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAT‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGACGGCAGCGTTTTTGGCGACCATAGTGCTg > 1:927482/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGt > 1:1657490/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTgctgct < 2:1906583/107‑1 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTgctgct > 1:1906583/1‑107 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggc > 1:1464143/1‑134 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggc < 2:1464143/134‑1 (MQ=255) ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTc < 2:1116502/150‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGcc < 1:1475176/116‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGcc > 2:1475176/1‑116 (MQ=255) ccGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGATGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGc < 1:1208211/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAt > 2:1420444/1‑150 (MQ=255) aGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCTAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg‑tg < 1:894231/150‑1 (MQ=255) ggTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑Tgg > 1:585695/1‑150 (MQ=255) 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tGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCA‑CATGCTGGACCa < 1:869804/148‑1 (MQ=255) tGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCA‑CATGCTGGACCa > 2:869804/1‑148 (MQ=255) gCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGCTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGTGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGttt < 2:459919/150‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCCATC‑GCTGTGCGTCCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTg < 2:1506432/150‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGACAGCAACCTA‑ACTTTTTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTg < 1:1790700/150‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGc > 1:1485959/1‑150 (MQ=255) tGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAg < 1:695354/150‑1 (MQ=255) gAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATg > 2:1060958/1‑150 (MQ=255) tCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGaa < 2:1642318/150‑1 (MQ=255) cccAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAAt < 1:786179/150‑1 (MQ=255) cccAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAAt < 1:1060958/150‑1 (MQ=255) gcagcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTca < 2:1375677/147‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGa > 1:732176/1‑113 (MQ=255) cgcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGa < 2:732176/113‑1 (MQ=255) gggTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCagcagc < 1:1711444/150‑1 (MQ=255) ggTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcg > 2:1521078/1‑150 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tCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGc < 1:586150/150‑1 (MQ=255) tCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGTACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTg > 1:1288810/1‑150 (MQ=255) ttCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc < 1:255233/74‑1 (MQ=255) ttCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 2:255233/1‑74 (MQ=255) gcggGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTcagcag > 1:790341/1‑125 (MQ=255) gcggGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTcagcag < 2:790341/125‑1 (MQ=255) cccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCg > 1:1121088/8‑150 (MQ=255) ccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg < 2:1743770/122‑1 (MQ=255) ccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg > 1:1743770/7‑128 (MQ=255) gCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTg > 1:306752/1‑150 (MQ=255) cttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTg > 2:832885/6‑150 (MQ=255) ttgagcagcaC‑TTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCCGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTCCGCCTGGCCCGTGa > 1:1166399/5‑150 (MQ=255) ccGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGaa > 1:1009227/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAgg < 1:1564021/150‑1 (MQ=255) agcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAgg < 1:832885/149‑1 (MQ=255) gcaC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGaa < 2:1040364/150‑1 (MQ=255) aC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAcc < 2:1604521/150‑1 (MQ=255) aC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAcc < 1:145231/150‑1 (MQ=255) tCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg‑t < 2:1854188/64‑1 (MQ=255) tCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg‑t > 1:1854188/1‑64 (MQ=255) tCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAccgc < 2:175066/150‑1 (MQ=255) tCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAccgc > 1:703368/1‑150 (MQ=255) cGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAccgcc < 1:1536643/150‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGAc < 2:178124/66‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGAc > 1:178124/1‑66 (MQ=255) gAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCgcagca > 1:849231/1‑111 (MQ=255) gAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCgcagca < 2:849231/111‑1 (MQ=255) | TTGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACCGCC > NC_002947/1698649‑1698944 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |