| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,962,231 | Δ1 bp | 6.7% | coding (252/1356 nt) | atoC ← | two‑component system DNA‑binding transcriptional activator AtoC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,962,231 | 0 | G | . | 6.7% | 283.6 / 13.8 | 89 | coding (252/1356 nt) | atoC | two‑component system DNA‑binding transcriptional activator AtoC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/43); new base . (3/3); total (43/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
GCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGCTTCTTCGGC > NC_002947/4962082‑4962380 | gCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGAcggcg < 2:858116/150‑1 (MQ=255)gCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGAcggcg > 2:1317458/1‑150 (MQ=255)gCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGAcggcg < 2:1813913/150‑1 (MQ=255)gCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGAcggcg < 1:1779866/150‑1 (MQ=255) cGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACggcggc > 1:776850/1‑150 (MQ=255) tCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGTAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATg‑c > 2:121228/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATg‑cgc < 2:1736756/150‑1 (MQ=255) cAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGcc < 2:776850/150‑1 (MQ=255) cAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGcc < 2:22864/150‑1 (MQ=255) ggCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGt < 1:451011/150‑1 (MQ=255) gCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtc < 1:1896229/150‑1 (MQ=255) cACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcat < 1:221179/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcatc > 1:1698323/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGc > 2:232019/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcatc < 1:1027557/142‑1 (MQ=255) ttcttcGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcatc > 2:1027557/1‑142 (MQ=255) cttcGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCg < 2:1305577/150‑1 (MQ=255) ttcGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCgg > 1:1733665/1‑150 (MQ=255) tCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGcc > 2:1923638/1‑125 (MQ=255) tCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGcc < 1:1923638/125‑1 (MQ=255) cacaCGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTCAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCGCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACCGCACCGGCAACTGTgg < 2:968398/150‑1 (MQ=255) acGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGC‑GCATGCCGCCGtcgagc > 1:601063/1‑124 (MQ=255) acGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGC‑GCATGCCGCCGtcgagc < 2:601063/128‑5 (MQ=255) gCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGgctgct > 1:914083/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGC‑GCATGCCGCCGtcgag < 1:582165/125‑4 (MQ=255) gCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGC‑GCATGCCGCCGtcgag > 2:582165/1‑122 (MQ=255) ccGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTgg > 1:1876335/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTgg > 2:554000/1‑150 (MQ=255) cggcggCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTggc > 1:1564658/1‑150 (MQ=255) ggcggcATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTggcg < 1:819545/150‑1 (MQ=255) ggcATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAAc > 1:1284659/1‑121 (MQ=255) ggcATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAAc < 2:1284659/121‑1 (MQ=255) gCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCCTCATCAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACt < 1:1123259/150‑1 (MQ=255) cGCTCCACGAGGTTGAGTAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTCGCGGGCGCCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTgg < 1:121228/150‑1 (MQ=255) cGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTgg < 2:914083/150‑1 (MQ=255) tCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTc < 2:1564658/150‑1 (MQ=255) cACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGAGCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAg > 2:1119128/1‑150 (MQ=255) cACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAg > 2:65663/1‑150 (MQ=255) cACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAg > 1:1867206/1‑150 (MQ=255) aCGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGc > 1:1233386/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCaa < 2:1770368/105‑1 (MQ=255) gAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCaa > 1:1770368/1‑105 (MQ=255) aGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTGGTCGGCGTCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAAc < 2:1668550/150‑1 (MQ=255) aGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAAc < 2:1733665/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACt < 1:1119128/150‑1 (MQ=255) gcagcGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGcc < 1:334144/150‑1 (MQ=255) cagcGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcatc > 1:324911/1‑94 (MQ=255) cagcGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGtcatc < 2:324911/94‑1 (MQ=255) agcGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCcca > 2:660011/1‑150 (MQ=255) agcGCATTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGCCCCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCNGCAACTGTGNCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCcca < 1:789142/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCccatccc > 2:1282495/1‑149 (MQ=255) cTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGctgctg < 1:1924579/114‑1 (MQ=255) cTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGctgctg > 2:1924579/1‑114 (MQ=255) ttGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACt > 1:819539/1‑103 (MQ=255) ttGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACt < 2:819539/103‑1 (MQ=255) gCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGAGGCGCCCTGGCACATGGCCTCGCCCGCGGGCTCGATGGCGGCAAT‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCgg > 2:710613/1‑150 (MQ=255) tCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGc < 1:1558224/150‑1 (MQ=255) cGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCa < 1:1317458/150‑1 (MQ=255) gAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCaa > 1:1773582/1‑93 (MQ=255) gAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCaa < 2:1773582/93‑1 (MQ=255) acacttttGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGAGAAACTGGACAAGCAAGTGGTTCCCATCCATACCGGGCATg > 1:1523194/6‑150 (MQ=255) aaCGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACtgt < 1:1320111/96‑1 (MQ=255) aaCGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACtgt > 2:1320111/1‑96 (MQ=255) aaCGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATg > 2:833903/1‑150 (MQ=255) cGGTTTGAGCAGGTAGGCGGCGGCGCCTGGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGtt < 2:1867206/150‑1 (MQ=255) cGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGtt < 1:660011/150‑1 (MQ=255) gTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGa < 1:1810059/150‑1 (MQ=255) aCCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGGCa > 1:761957/1‑150 (MQ=255) cAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCAGTTTGACGTCACt > 1:883929/1‑150 (MQ=255) gTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGac < 1:232019/150‑1 (MQ=255) gTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGAATGGCCTCCATGGCTCGCAGGTTTACGGTATC‑AGTGTGCATCAACATCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGac < 2:1876335/150‑1 (MQ=255) gTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACACTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGc > 1:1833844/1‑73 (MQ=255) gTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACACTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGc < 2:1833844/73‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACt < 1:1069574/143‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACt > 2:1069574/1‑143 (MQ=255) tCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGaccacc > 2:1835536/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCaa < 2:339291/56‑1 (MQ=255) gcgcCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCaa > 1:339291/1‑56 (MQ=255) ccTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAAc < 2:1698323/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACt < 2:1266416/66‑1 (MQ=255) cTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACt > 1:1266416/1‑66 (MQ=255) cTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAAcg > 1:931191/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAAcgc > 2:1130156/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGACATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAg < 1:65663/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTa > 2:843445/1‑150 (MQ=255) tCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACg < 1:843445/150‑1 (MQ=255) cGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACgg > 2:1881448/1‑150 (MQ=255) gACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGc < 2:1764324/150‑1 (MQ=255) cGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTgg > 2:1099529/1‑70 (MQ=255) cGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTgg < 1:1099529/70‑1 (MQ=255) gCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAgcg > 2:55969/1‑150 (MQ=255) gatgACGGC‑GCATGCCGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCTTCTTCGAGTACg > 2:1096737/4‑139 (MQ=255) gatgACGGC‑GCATGCCGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCTTCTTCGAGTACg < 1:1096737/136‑1 (MQ=255) tCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGct > 2:1031439/1‑150 (MQ=255) gggggcATG‑CGCCGTCATGAACAGCGCCGGCAACTCTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGTCCCTACATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGCttcttc < 2:1036373/147‑1 (MQ=255) gcggcATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGCTTCTTCg < 1:1189864/150‑1 (MQ=255) ggcATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGCTTCTTCGGc > 2:1265246/1‑150 (MQ=255) | GCCGGCTCGCAGGCCACCGGCCCTTCTTCGCCGGTCACACGCCCGGCGGCATGCCGCTCCACGAGGTTGAGCAGCGCCTTGGGCTCGAACGGTTTGACCAGGTAGTCGGCGGCGCCTTGGCGCATGGCCTCGACCGCACGCTCGACGGCGGCATG‑CGCCGTCATCAACAGCACCGGCAACTGTGGCTGCTGGCGGCGCAACTGGCTCAGCAACTGGTGCCCATCCATACCGGGCATGTTGACGTCACTGACCACCAGGCTGAACGCGTCTTCGAGTACGGCCTCCAGCGCTTCTTCGGC > NC_002947/4962082‑4962380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |