| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 914,647:1 | +C | 6.2% | coding (1355/1743 nt) | fruA → | PTS fructose transporter subunit IIBC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 914,647 | 1 | . | C | 6.2% | 343.5 / 15.3 | 81 | coding (1355/1743 nt) | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (37/39); new base C (3/2); total (40/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.22e-01 | |||||||||||
AATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCCGTTACGGG > NC_002947/914499‑914796 | aaTGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:1319622/150‑2 (MQ=255) tGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gcc > 1:1628976/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gcc > 2:80444/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gcc < 1:521205/150‑1 (MQ=255) tGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gcc > 1:1393019/1‑150 (MQ=255) ccATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGCCGGCGGC‑CATGGtcgccg < 2:192859/150‑6 (MQ=255) cATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgcc > 1:410361/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGa < 1:470723/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGa < 1:1353318/150‑1 (MQ=255) tCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGa < 2:1628976/150‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgc > 2:806510/1‑139 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑gccgc < 1:806510/139‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg < 1:1426219/150‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGGTCTCGGTGGGCGTGCTGGCCTCATCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCgattggattg > 2:710068/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTAt > 1:1213802/1‑150 (MQ=255) gCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGc > 1:874575/1‑150 (MQ=255) ggcggcATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTGCGCGCCAAT‑GGGGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCAAcc > 1:606013/1‑150 (MQ=255) ggcggcATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 2:842313/139‑1 (MQ=255) ggcggcATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg > 1:842313/1‑139 (MQ=255) ggCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTC > 1:322616‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTC < 1:852563‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTC < 2:1393019‑M1/150‑1 (MQ=255) atgatgTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACGAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTg < 1:68720/150‑1 (MQ=255) tgtgCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAt > 1:1490521/1‑121 (MQ=255) tgtgCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAt < 2:1490521/121‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGTGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 1:508352/124‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGTGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg > 2:508352/1‑124 (MQ=255) tCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCTCGC‑CGGTGCTCCCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGGATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCa > 1:1790690/1‑150 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 2:572316/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 2:410361/150‑1 (MQ=255) gACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAg < 2:1221364/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGc < 1:1740615/150‑1 (MQ=255) gCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCagag > 2:1366384/1‑150 (MQ=255) cGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcg > 1:755573/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:102886/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgag > 2:411968/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgag > 1:770695/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgag < 1:80444/150‑1 (MQ=255) aacaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAgcgc < 1:1060930/150‑1 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCC‑ATTGGcgcgta > 1:1072742/1‑98 (MQ=9) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCC‑ATTGGcgcgta < 2:1072742/103‑6 (MQ=9) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTtgcccgcctcgcgctcgctctgggcgaacttg > 1:1776316‑M1/1‑118 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:1763337/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 2:1110893/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAg > 2:1310228/1‑150 (MQ=255) aGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAgg > 2:1644200/1‑150 (MQ=255) gccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑TATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGCGCGCGAGGCg > 1:1539506/1‑150 (MQ=255) ccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTtgcccgcctcgcgctcgctctgggcgaacttgcgccgg < 2:1776316‑M1/150‑39 (MQ=255) gccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGc < 2:429823/150‑1 (MQ=255) ttCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGgcggcg < 2:1221146/150‑1 (MQ=255) ctcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgct < 1:752625/150‑1 (MQ=255) tcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctg < 1:540786/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCGAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCGTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAAGCGGGCAAGGCggcggtggcg > 2:1844906/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTCCGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCTGCGCAAGTTCGCCCAGAGCCAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGcgctggcgctgg < 2:675827/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGTCCGCCTG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGcgctggcgctgg < 2:583697/150‑1 (MQ=255) tgctgGCCACGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGCCAATGGCCGCCGG‑GATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGTGCATTGCCACCTTCCTGGTCGGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGc < 2:553781/150‑1 (MQ=255) gctcGCCTCGCCGACCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGCGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCt < 1:1844906/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 2:1763337/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt > 2:1826393/1‑150 (MQ=255) gCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGc < 2:1790690/150‑1 (MQ=255) ccTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCaga > 1:208401/1‑105 (MQ=255) ccTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCaga < 2:208401/105‑1 (MQ=255) ccTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCt > 1:1075361/1‑150 (MQ=255) cTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCtt > 2:656870/1‑150 (MQ=255) tcgtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc < 1:1310228/150‑1 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTtgcccgcctcgcgctcgctctgggcgaacttgcgccgggccaggaaggtg < 1:261627‑M1/128‑51 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTtgcccgcctcgcgctcgctctgggcgaacttgcgccgggccaggaaggtg > 2:261627‑M1/1‑78 (MQ=255) tACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAg > 1:1103370/1‑150 (MQ=255) caagcCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg > 2:367180/4‑150 (MQ=37) caagcCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCC‑ATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAggg > 2:1126609/4‑150 (MQ=25) gcgcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgggg > 2:1748978/1‑150 (MQ=255) gcgcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgggg > 1:270032/1‑150 (MQ=255) aagcCAATCGGCGGC‑ACCAT‑GCCGGCGGCCATGGTCGCCGCC‑ATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgggg < 1:1126609/148‑1 (MQ=25) cgcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCGCCGAggggg < 1:1119723/150‑1 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGc > 2:1915645/1‑150 (MQ=255) cAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGa > 1:1376207/1‑150 (MQ=255) cAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGa > 1:1376216/1‑150 (MQ=255) ggcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGACAGATCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGtt > 1:121057/1‑150 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTTCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCGGAGGGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttg < 1:376079/150‑2 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 2:755573/150‑1 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 1:1748978/150‑1 (MQ=255) gACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgc > 2:1816618/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgcg < 1:694965/60‑1 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgcg > 2:694965/1‑60 (MQ=255) aTGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgcc > 1:1281355/1‑150 (MQ=255) ccgccgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAGCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAgg < 2:874575/150‑1 (MQ=255) cgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGAccc < 2:1213802/150‑1 (MQ=255) cgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGAccc > 1:1871912/1‑150 (MQ=255) cgG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGAccc < 1:412079/150‑1 (MQ=255) tGGT‑GCGGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCCGTTAc < 1:903843/150‑1 (MQ=255) t‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCCGTTACggg < 1:1366384/150‑1 (MQ=255) | AATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGACCCGTTACGGG > NC_002947/914499‑914796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |