| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,698,793:1 | +T | 6.9% | coding (499/1014 nt) | cheBC → | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,698,793 | 1 | . | T | 6.9% | 394.9 / 23.5 | 102 | coding (499/1014 nt) | cheBC | chemotaxis response regulator protein‑glutamate methylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (45/50); new base T (4/3); total (49/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TTGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACC > NC_002947/1698649‑1698941 | ttGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGaa < 1:305964/150‑1 (MQ=255)ttGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGaa < 1:885370/150‑1 (MQ=255) tgcGCAAGATCCTCAATATCGGCT‑CCGCCACGGACCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgc > 1:1506432/1‑150 (MQ=255) gcAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgctgc < 2:798089/150‑1 (MQ=255) aaGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTc > 2:786179/1‑150 (MQ=255) gATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCaa < 1:744464/150‑1 (MQ=255) ccTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgc > 1:1254174/1‑140 (MQ=255) ccTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGtgc < 2:1254174/140‑1 (MQ=255) tCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCATGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTTTCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGtt > 1:1288817/1‑150 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGc < 1:1633941/150‑1 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCg < 2:1000559/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCa < 2:514721/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCa < 2:1837979/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggcgg > 2:711440/1‑150 (MQ=255) g‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGACAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCcggcgg > 2:382468/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCggcggc > 1:175066/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCggcggc > 2:229782/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCACAGCAGCACTTCG‑AGtgctgccgg < 2:175259/122‑4 (MQ=255) ccAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCACAGCAGCACTTCG‑AGtgctgccgg > 1:175259/1‑119 (MQ=255) cagcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATc > 2:915516/1‑150 (MQ=255) agcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTTCTGCTCAAGGGttt < 2:1627834/124‑1 (MQ=255) agcGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGttt > 1:1627834/1‑124 (MQ=255) gTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 2:1106430/1‑150 (MQ=255) gTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCCGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 1:1015210/1‑150 (MQ=255) 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ccTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTc < 2:1116502/150‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGcc < 1:1475176/116‑1 (MQ=255) gCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGcc > 2:1475176/1‑116 (MQ=255) ccGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGATGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGc < 1:1208211/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAt > 2:1420444/1‑150 (MQ=255) aGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCTAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCAtg‑tg < 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cccAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAAt < 1:1060958/150‑1 (MQ=255) gcagcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTca < 2:1375677/147‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGa > 1:732176/1‑113 (MQ=255) cgcgGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGa < 2:732176/113‑1 (MQ=255) gggTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCagcagc < 1:1711444/150‑1 (MQ=255) ggTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcg > 2:1521078/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAgcagcgc > 1:967195/1‑150 (MQ=255) gtggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCGGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCCGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCCGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCgcagca > 1:560630/1‑150 (MQ=255) gtggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAgg > 1:1510619/1‑55 (MQ=255) gtggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAgg < 2:1510619/55‑1 (MQ=255) gtggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCgcagca > 1:1264750/1‑150 (MQ=255) tggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑Tgg < 1:1257548/102‑1 (MQ=255) tggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑Tgg > 2:1257548/1‑102 (MQ=255) ggCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGACAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg < 1:382468/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCt < 2:1677276/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGACCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg < 2:1231570/147‑1 (MQ=255) aaTCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGACCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg > 1:1231570/1‑147 (MQ=255) tCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGc > 1:1040364/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGc < 1:586150/150‑1 (MQ=255) tCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGc > 1:1604521/1‑150 (MQ=255) tCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGTACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTg > 1:1288810/1‑150 (MQ=255) ttCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc > 2:255233/1‑74 (MQ=255) ttCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGc < 1:255233/74‑1 (MQ=255) cg‑gcggGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGcc < 1:229782/150‑1 (MQ=255) gcggGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTcagcag < 2:790341/125‑1 (MQ=255) cccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCg > 1:1121088/8‑150 (MQ=255) ccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg < 2:1743770/122‑1 (MQ=255) ccttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAgg > 1:1743770/7‑128 (MQ=255) gCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTg > 1:306752/1‑150 (MQ=255) cttgagcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTg > 2:832885/6‑150 (MQ=255) ttgagcagcaC‑TTCGAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCCGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTCCGCCTGGCCCGTGa > 1:1166399/5‑150 (MQ=255) ccGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGaa < 2:585695/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGaa > 1:1009227/1‑150 (MQ=255) ggCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAgg < 1:1564021/150‑1 (MQ=255) agcagcaCTTCG‑AGTGCTGCCCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAgg < 1:832885/149‑1 (MQ=255) gcaC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGaa < 2:1040364/150‑1 (MQ=255) aC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAcc < 1:145231/150‑1 (MQ=255) aC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAAcc < 2:1604521/150‑1 (MQ=255) | TTGCTGCGCAAGATCCTCAATATCGGCTGGCTGGTCGG‑CCAGCAGCGTGCACCTGCCGCAAGGTCGGTGGCTGCACCGCTGCGCGAGGCTTCCCAGCGCCGCGGGTTGGTGGCAATCGGGTCTTCG‑GCGGGTGGCCCGGCAGCAC‑TCGAAGTGCTGCTCAAGGGTTTGCCGGCAGCGTTTCCGGCGGCCATCGTGCTGGTCCAGCATG‑TGGACCAGGTGTTTGCCGCAGGCATGGCCGAATGGCTCAGCAGCGCAGCAGGCCTGCCGGTGCGCCTGGCCCGTGAAGGCGAACC > NC_002947/1698649‑1698941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |