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| * | NC_002947 | 2,344,731 | 1 | . | C | 6.5% | 397.1 / 17.9 | 93 | intergenic (‑39/+36) | PP_2061/PP_2062 | hypothetical protein/hypothetical protein |
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GTCGACAATAAATACCCCGTTCTCATAGGCGATATAACCCGCAGCGCTAACGTTATTGCTGGCATTGAAATTCCACATTTCAGCG‑CCGCTGGCGTGAGTATTCAAGAGGGCGTCAGTAGAGGCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGTTTTAAG > NC_002947/2344588‑2344871 | gtcgACAATAAATACCCCGTTCTCATAGGCGATATAACCCGCAGCGCTAACGTTATTGCTGGCATTGAAATTCCACATTTCAGCG‑CCGCTGGCGTGAGTATTCAAGAGGGCGTCAGTAGAGGCGCCGAAGCCGACCAGGGAAGT‑ttcttc > 2:109228/1‑150 (MQ=255) tcgACAATAAATACCCCGTTCTCATAGGCGATATAACCCGCAGCGCTAACGTTATTGCTGGCATTGAAATTCCACATTTCAGCG‑CCGCTGGCGTGAGTATTCAAGAGGGCGTGAGGAGAGTCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑Ttcgtcg > 1:1097911/1‑150 (MQ=255) tcgACAATAAATACCCCGTTCTCATAGGCGATATAACCCGCAGCGCTAACGTTATTGCTGGCATTGAAATTCCACATTTCAGCG‑CCGCTGGCGTGAGTATTCAAGAGGGCGTCAGTAGAGGCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑Ttcgtcg > 1:90905/1‑150 (MQ=255) 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agagGCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATcc < 2:1651392/150‑1 (MQ=255) agGCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCtt < 2:1626243/150‑1 (MQ=255) agGCGACGAA‑ACGACCCTGGTCGTCTTCGGCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTAtt < 2:1083450/90‑1 (MQ=21) agGCGACGAA‑ACGACCCTGGTCGTCTTCGGCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTAtt > 1:1083450/1‑90 (MQ=21) gcgcCGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGa < 2:1216181/150‑1 (MQ=255) cGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAACCTTTTGGCATCCTTGAGTTc > 2:1690756/1‑150 (MQ=255) 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gacgacCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGtt > 1:1526967/1‑150 (MQ=255) gacgacCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGtt < 2:15757/150‑1 (MQ=255) gacgacCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGtt < 2:1294358/150‑1 (MQ=255) acgacCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATc > 2:1024518/1‑136 (MQ=255) acgacCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATc < 1:1024518/136‑1 (MQ=255) acCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGTTTTaa < 2:505739/150‑1 (MQ=255) acCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGTTTTaa < 2:1526967/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGTTTTAAg < 2:176652/150‑1 (MQ=255) ctggTCGTCTTCGGCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGc > 1:1415660/3‑112 (MQ=255) ctggTCGTCTTCGGCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGc < 2:1415660/110‑1 (MQ=255) | GTCGACAATAAATACCCCGTTCTCATAGGCGATATAACCCGCAGCGCTAACGTTATTGCTGGCATTGAAATTCCACATTTCAGCG‑CCGCTGGCGTGAGTATTCAAGAGGGCGTCAGTAGAGGCGCCGAAGACGACCAGGGTCGT‑TTCGTCGCCTTCATTTATGAGTGTGTATTTGTAAATCAGTGATGGGCTGATTTTTTTGCGCTATTGTTGTCGTTGATAATATTGATGTCTACGATGCCCTTGCTTATAAAGCTTTTGGCATCCTTGAGTTCGGTTTTAAG > NC_002947/2344588‑2344871 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |