| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,355,094:1 | +C | 7.8% | coding (250/681 nt) | modB → | molybdate ABC transporter permease ModB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,355,094 | 1 | . | C | 7.8% | 305.1 / 20.1 | 77 | coding (250/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (35/36); new base C (4/2); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
GGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354945‑4355234 | ggtggCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAg < 2:1068424/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGTACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg < 1:396366/150‑1 (MQ=255) tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg < 2:994059/150‑1 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt > 1:345671/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTCGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGc > 1:172628/1‑150 (MQ=255) cgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt < 2:320655/150‑1 (MQ=255) ttccgatctctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgtg < 2:1826664/143‑1 (MQ=255) cACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggtggcct < 2:345671/150‑7 (MQ=255) aCGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg < 2:1673468/150‑1 (MQ=255) ctctTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCAACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGtt > 1:1735702/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAg < 1:260031/150‑1 (MQ=255) gtcggcgcGGGCTGGTGTGTTCGCAGGTGTCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTTATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTCGCTTGGTCAGGCCACCCATGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCt < 2:806803/146‑1 (MQ=255) gCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCtt > 2:1428147/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTca > 1:236849/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAg < 2:236849/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGcc < 1:1078759/150‑1 (MQ=255) gtgggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTg > 1:458921/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCt < 2:1215037/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCt < 2:192390/150‑1 (MQ=255) gtggtgGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGACAAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGAGAtcggaaga > 1:18505/1‑143 (MQ=255) cACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCGCGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGgtgt > 2:422328/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGATTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTa > 1:18013/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCACTTCGGAAGCACGGCTGGCTGAGCTAGGGTACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTa > 1:1206734/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTc < 2:428960/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTCGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTc < 2:172628/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg < 2:1372246/105‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg > 1:1372246/1‑105 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTgg < 1:1225192/127‑1 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTgg > 2:1225192/1‑127 (MQ=255) tGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCAACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGc < 2:1735702/150‑1 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg > 2:265217/1‑87 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg < 1:265217/87‑1 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAg > 2:1846656/1‑111 (MQ=255) tGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAg < 1:1846656/111‑1 (MQ=255) cccGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCgtggt < 2:1786293/149‑1 (MQ=255) ccGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCgtggtg < 2:1128045/150‑1 (MQ=255) ggTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt > 2:268600/1‑82 (MQ=255) ggTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt < 1:268600/82‑1 (MQ=255) tGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAAcccc < 2:458921/150‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTg < 1:656047/102‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTg > 2:656047/1‑102 (MQ=255) tCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGc > 1:833251/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCGCGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCa < 1:422328/150‑1 (MQ=255) ttttACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAAt < 1:1857394/150‑1 (MQ=255) tttACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCACCCCCTGCAGAATg > 2:1019089/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTGATCGCCATTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCt > 2:1563030/1‑150 (MQ=255) cTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGGGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGCTTGGCACGAAGGTGTGCTCCACGCCGGTTAGTGG‑GCATCTCCGTCACAATGCCttt > 2:211669/1‑150 (MQ=255) cTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 1:1620869/150‑1 (MQ=255) gTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑Gtt > 2:886146/1‑120 (MQ=255) gTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑Gtt < 1:886146/120‑1 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGa > 2:599734/1‑91 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGa < 1:599734/91‑1 (MQ=255) aTCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGcgcg > 1:160710/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTTGGCCCGCACTGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGGGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGa > 1:802052/1‑150 (MQ=255) cGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGAGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGAt > 2:1780630/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGc < 2:160710/150‑1 (MQ=255) gCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGGGCTAG‑GCCTAGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAgc < 1:211669/150‑1 (MQ=255) gCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGTCCTGGTGATTGGCTCGAc < 2:1627430/88‑1 (MQ=255) gCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGAc > 1:1627430/1‑88 (MQ=255) cccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAgcg > 1:197939/1‑150 (MQ=255) ccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt > 1:376993/1‑132 (MQ=255) ccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 2:376993/132‑1 (MQ=255) tggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGAc > 1:1315715/1‑77 (MQ=255) tggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGAc < 2:1315715/77‑1 (MQ=255) tggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 1:287032/150‑1 (MQ=255) ggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAg > 2:1039979/1‑150 (MQ=255) ctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTc > 2:1888022/1‑150 (MQ=255) ttGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaacaag > 2:226/1‑146 (MQ=255) ttGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcg > 2:124113/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCTCCCCCTGGAAGTcgc < 1:794293/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 2:1222914/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 2:1473739/1‑150 (MQ=255) cactgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGTAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAc > 2:874051/6‑150 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCgtggt > 1:891084/5‑89 (MQ=38) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCgtggt < 2:891084/85‑1 (MQ=38) ctgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGTAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTActc > 2:1516598/4‑150 (MQ=255) cAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGa < 1:1428147/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGGGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTCGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAACTCGCCGATACTCTGCgg > 2:862216/1‑149 (MQ=255) | GGTGGCTCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCC‑GTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGA > NC_002947/4354945‑4355234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |