| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,726,860:1 | +G | 6.4% | coding (162/2574 nt) | opgH ← | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,726,860 | 1 | . | G | 6.4% | 322.9 / 14.8 | 78 | coding (162/2574 nt) | opgH | glucans biosynthesis glucosyltransferase H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/37); new base G (3/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
GCGCCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTT > NC_002947/5726716‑5727004 | gcgcCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGccgtgca < 1:1555819/150‑6 (MQ=255) ccATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGATCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGc < 2:738668/150‑1 (MQ=255) tGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTc < 2:1090330/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCCGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCgg > 1:21628/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCgg < 1:931576/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCgg > 2:1248614/1‑150 (MQ=255) tCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCa < 2:654995/150‑1 (MQ=255) cGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCGCCGAGGCCGTGCA‑GGCCTCggtgg < 1:1354714/150‑4 (MQ=255) gggCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCaga < 1:1719828/150‑1 (MQ=255) gACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTggc > 2:1024966/1‑150 (MQ=255) gTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCggg > 2:406359/1‑150 (MQ=255) gTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTgg > 2:324224/1‑150 (MQ=255) tttGATCGGCGGGGCGATCTTCATGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgc > 2:1267714/1‑150 (MQ=255) tttGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgc > 1:538742/1‑150 (MQ=255) tttGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgc > 2:1890143/1‑150 (MQ=255) aTCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGgccgcc > 2:1831045/1‑150 (MQ=255) gggCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGtt < 2:1216794/150‑1 (MQ=255) ggCGATCTTCATGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTg < 1:1267714/150‑1 (MQ=255) ggCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCACACCGAGGCC‑TTCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTg > 1:1887219/1‑150 (MQ=255) ggCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGCCGACGCCGAACATTTCGTCTTCGTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGACAGGCGCGCGCCCACCGAGACC‑TACACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTg < 2:544282/150‑1 (MQ=255) gCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTc > 2:1000414/1‑113 (MQ=255) gCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTc < 1:1000414/113‑1 (MQ=255) gATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCGGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgtg > 1:1185342/1‑150 (MQ=255) aTCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgtgt < 1:1890143/150‑1 (MQ=255) tCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTa < 1:944530/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGc < 1:1363709/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGc > 2:1363709/1‑150 (MQ=255) gCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCGGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACt < 2:1185342/150‑1 (MQ=255) acaGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGa < 1:1024966/150‑1 (MQ=255) acaGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGa < 2:1344076/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgt > 2:1307433/1‑126 (MQ=255) tGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGgt < 1:1307433/126‑1 (MQ=255) tGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGc < 1:324224/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCt < 2:1673470/150‑1 (MQ=255) gTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGc > 1:1445047/1‑150 (MQ=255) gTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGc < 2:78601/150‑1 (MQ=255) cGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGATGTGCAGCTGGCaa < 2:1734318/150‑1 (MQ=255) aCGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGc > 2:1252539/1‑150 (MQ=255) gCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGccc < 2:1299179/150‑1 (MQ=255) cATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCt < 1:1864357/135‑1 (MQ=255) cATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCt > 2:1864357/1‑135 (MQ=255) ttCGGCTTCTTCCAGCTGGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAg > 2:996312/1‑124 (MQ=255) ttCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAg < 1:996312/124‑1 (MQ=255) ttCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCCGGCAAGCTCAGCCCgctg > 1:1236048/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCgctgc < 2:1409804/150‑1 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACt < 1:1837546/108‑1 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACt > 2:1837546/1‑108 (MQ=255) ttcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 2:1369429/1‑150 (MQ=255) atcCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTTAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCt > 2:1327461/2‑150 (MQ=255) ccAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCa > 2:327210/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAg > 1:478945/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGCACAGTAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCGGAGTgg > 1:1476603/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTgg < 1:1518401/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGt > 2:1593956/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCCCGTCGCTCAGTGGt > 1:881654/1‑150 (MQ=255) cggcgCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTgg < 1:1758838/72‑1 (MQ=255) cggcgCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTgg > 2:1758838/1‑72 (MQ=255) 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ccACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCGCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCg > 1:437107/1‑150 (MQ=255) tgccGAGGCCGTGCA‑GGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGa > 2:548977/3‑75 (MQ=38) tgccGAGGCCGTGCA‑GGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGa < 1:548977/73‑1 (MQ=38) ccGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGcc < 1:1593956/150‑1 (MQ=255) cGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCCGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCt < 2:1236048/150‑1 (MQ=255) gAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCtt < 2:21628/150‑1 (MQ=255) | GCGCCATGGCTCGGGCACGACCTTGGTGCGTTTGATCGGCGGGGCGATCTTCAGGCACAGGCGGCCGCTGCCGTCGACGCCGAGCATTTCGGCTTCTTCCAGCTCGGCGGCGCTGCCCACGGTCAGGCGCGGGCCCACCGAGGCC‑TGCACGGCCTCGGCAGAGCTGGCGGCCGGGTTGGCCGCCAAGCGTTGGTGTAGCTCACTGAACGAGGTGCAGCTGGCAAGCTCAGCCCGCTGCTCGTCGCTCAGTGGTAGGTGGGCCAGGTACTCGCCAAGCGATTCCGGCCTT > NC_002947/5726716‑5727004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |