New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295818 = | 75 (1.030) | 6 (0.100) | 5/200 | NT | 10.6% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295903 = | 41 (0.700) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
CGGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295989‑2295818 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATC > NC_002947/2295903‑2296050 CGGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGACATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTT > 1:727267/1‑150 AGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGACATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGC < 2:727267/150‑1 GCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCA > 1:1252371/1‑150 GGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGt < 2:1252371/150‑2 AGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCC < 1:946796/150‑1 GTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGTGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTC > 2:1720824/1‑150 GCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCA > 1:185404/1‑150 TGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA > 1:1275766/1‑150 TGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCAAATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATACCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGGTCCCACA > 1:346948/1‑150 GCAATCATGGTCCGCCGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTcat > 1:1179907/1‑107 GCAATCATGGTCCGCCGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTcat < 2:1179907/110‑4 GTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAA > 1:223625/1‑137 GTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAA < 2:223625/137‑1 TGGGAGCGGGCACGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGC < 2:1259548/150‑1 TGGGAGCGGGCACGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGC > 1:1259548/1‑150 GAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGC > 1:490698/1‑65 GAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGC < 2:490698/65‑1 GGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTC > 1:1602582/1‑150 CGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACC‑GCGGTGCCCG‑CTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACACCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTC > 1:878996/1‑150 CGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGA < 2:1797209/150‑1 GCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGAC > 2:54454/1‑150 CATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGG > 2:1498445/1‑150 ATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACGACTGCGGTTCGACCCCGGC > 1:958360/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 1:537510/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 1:1933885/1‑150 TCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGC < 1:326298/150‑1 TCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGC < 1:1002892/150‑1 CACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATC < 2:1661109/150‑1 CGGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2295989‑2295818 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATC > NC_002947/2295903‑2296050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |