New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4350173 = | 72 (0.990) | 11 (0.170) | 10/214 | NT | 15.8% | intergenic (‑181/+56) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
? | NC_002947 | 4350224 = | 55 (0.870) | intergenic (‑232/+5) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG > NC_002947/4350224‑4350370 TAGAGGGATCCATCGAGAAGAGGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCGGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGGCGGGTAGCTGAGGTAAGCCTGTGGCGGGCTCTCGGCGCGGGAGCCCGTCGA > 2:1849264/1‑150 AGAGGGATCGATCTAGAAGATGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGATCCCTTCGAA < 2:482754/150‑1 ATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCC > 1:1076905/1‑150 TCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGTGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCG > 1:841258/1‑150 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCA > 1:265148/1‑150 TTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCC > 1:1128510/1‑125 TTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCC < 2:1128510/125‑1 AATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGC < 2:414622/118‑1 AATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGC > 1:414622/1‑118 GTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGT > 1:300429/1‑150 TAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAAC < 1:1759757/119‑1 TAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAAC > 2:1759757/1‑119 GCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACC < 2:900073/110‑1 GCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACC > 1:900073/1‑110 GCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGAT < 2:1082323/145‑1 GCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGAT > 1:1082323/1‑145 CTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACC > 2:1119655/1‑105 CTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACC < 1:1119655/105‑1 GTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACC > 2:1075105/1‑150 GCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGG < 1:1075105/150‑1 CGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTC < 2:300429/150‑1 AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTG > 1:465821/1‑150 AAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTG < 1:298197/150‑1 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGG > 1:39331/1‑146 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGG < 2:39331/146‑1 ACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGG > 2:1798041/1‑150 ACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGG > 1:1729935/1‑150 GGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG < 2:1641322/150‑1 GGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGT < 1:1831614/135‑1 GGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGT > 2:1831614/1‑135 TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG > NC_002947/4350224‑4350370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |