| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5537105 | 90 (1.230) | 16 (0.280) | 11/194 | NT | 18.2% | intergenic (+34/+69) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| ? | NC_002947 | = 5537127 | 74 (1.300) | intergenic (+56/+47) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin | |||||
GGACGAGGCGTCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5536930‑5537105‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgcaggagcgggttcacccgcgaatGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCTGCCCATG < NC_002947/5537127‑5536979 GGACGAGGCGTCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGC > 1:115339/1‑150 ACGAGGCGTCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCT < 2:754447/150‑1 GAGGCGTCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGC < 2:326109/150‑1 TCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCTGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGC < 1:1086493/150‑1 TCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGAT‑AGTGGCCTGCAGGAGCG < 2:173917/150‑1 GTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACC < 2:1592141/150‑1 GTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACC > 1:1634292/1‑150 GACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCG > 2:1879770/1‑150 TACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAA < 2:1634292/150‑1 TACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAA > 1:533526/1‑150 ATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGT > 1:1854125/1‑150 TTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACC > 1:560193/1‑150 CAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCG < 2:533526/150‑1 AGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCCCAAGCCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGG < 1:1477315/150‑1 AGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGG < 2:1854125/150‑1 AGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGG < 2:560193/150‑1 GCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTCGGTGGGTTCACCC > 1:1482650/1‑137 GCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTCGGTGGGTTCACCC < 2:1482650/137‑1 AGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCC < 1:1530429/122‑1 AGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCC > 2:1530429/1‑122 CCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAC > 1:1503746/1‑120 CCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAC < 2:1503746/120‑1 CACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGG < 1:1819350/94‑1 CACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGG > 2:1819350/1‑94 CCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGAGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCG < 1:1197594/78‑1 CCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGAGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCG > 2:1197594/1‑78 CCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAAC > 1:934454/1‑150 CTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACG > 1:658440/1‑150 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCG > 1:1368216/1‑102 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCG < 2:1368216/102‑1 AGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTG < 1:1419323/150‑1 AGCGGGTTCACCCGCGAATGAGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTG < 1:666012/150‑1 CGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGT < 1:1266360/150‑1 GGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTGCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTC < 1:1881086/150‑1 GTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGAT > 2:556553/1‑127 GTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGAT < 1:556553/127‑1 TCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACC < 1:785761/150‑1 ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGCTGAAGTCGAACTGTGGCTGGTCAACCGG > 2:932313/1‑150 ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGA > 1:948491/1‑122 ACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGA < 2:948491/122‑1 CCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGG < 2:1729443/141‑1 CCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGG > 1:1729443/1‑141 CCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCT > 2:1006952/1‑150 CCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCT < 1:666633/150‑1 CCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTC > 2:1090485/1‑101 CCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTC < 1:1090485/101‑1 ATGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCTGCCCAT > 2:1111886/1‑150 TGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCTGCCCATG < 2:1260409/150‑1 GGACGAGGCGTCACATGGCGTGACCTACGCGCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5536930‑5537105‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgcaggagcgggttcacccgcgaatGCGTCGGTGGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGCCACTTATCAAGGAGCGAACGGCAGTTCGCGCTTGTGCTGGGTCTTGCGGTAGGTGGCGACGATGATGTCGAACGCTGCCTGGTCAACCGGCTGCCCATG < NC_002947/5537127‑5536979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |