New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 66118 | 68 (0.930) | 6 (0.090) | 6/232 | NT | 8.4% | coding (1176/1653 nt) | betA‑I | choline dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 66126 | 67 (0.980) | coding (1184/1653 nt) | betA‑I | choline dehydrogenase |
GAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGCCTTACCCGGCGCATCGTCCAGGCCCCTGCCCTCGC > NC_002947/65971‑66267 | gAGCCAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGc > 2:1469757/1‑150 (MQ=255) ccAGTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAg > 2:67959/1‑150 (MQ=255) gTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCTGAACAGGCCATCGCCAATCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTTTCATTGGAACGCTTCGGTGATCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCGTCACGTCTGCGGTG‑TGCAACCTGCGCCGGGCAAGcct > 2:340775/1‑149 (MQ=255) gTTAGGCGCGTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCAGGCCTTTATTTCC‑CTGTGATGCAAGCTGCGCCCGGCCAGCcg > 2:318229/1‑150 (MQ=255) gcgTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGcggctggccgg > 2:1835893‑M1/1‑135 (MQ=255) gcgTTCGTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGcggctggccgg < 1:1835893‑M1/146‑12 (MQ=255) gTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTAGTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGAc < 1:340775/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGAc > 2:1514693/1‑150 (MQ=255) gtccAAGCCCCGGACAGGCCGCCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCt < 2:601395/147‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTgc < 2:721740/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTgc < 1:1469757/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGc > 1:193430/1‑127 (MQ=255) aaGCCCCGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGc < 2:193430/127‑1 (MQ=255) ccccGAACAGGCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGAAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCCGGGGCAGTCCTTTACTGCCTCTGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCAAGCAGAGGGACCATCTAATTCTTCAGCAc > 1:120031/1‑150 (MQ=255) cccGAACAGGTCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCAcc < 2:121497/150‑1 (MQ=255) gCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGCCATGAAc > 2:945573/1‑150 (MQ=255) gCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGaa < 1:655285/149‑1 (MQ=255) gCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGaa > 2:655285/1‑149 (MQ=255) gCCACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAAc < 1:901622/150‑1 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATc < 1:1634704/124‑1 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATc > 2:1634704/1‑124 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATc > 2:325276/1‑130 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATc < 1:325276/130‑1 (MQ=255) cACCGCCAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAg > 1:397541/1‑150 (MQ=255) cAACCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCAcgcc > 1:251490/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCt > 2:1513720/1‑123 (MQ=255) aCCTTCAGTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCt < 1:1513720/123‑1 (MQ=255) gTATCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGa > 2:1328316/1‑150 (MQ=255) tCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCTACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc > 2:1830481/1‑150 (MQ=255) tCACGTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGAccc > 1:1244007/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCCGCTGTCACTGGAACGCTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCAACTACATGAACAGCACGCCGCGGGTCGACCCCAAt > 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cTTCGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACtt > 2:1386602/1‑150 (MQ=255) cGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGcggctggccgggcgcagg < 2:1894629‑M1/76‑19 (MQ=255) cGGTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGcggctggccgggcgcagg > 1:1894629‑M1/1‑58 (MQ=255) ggTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCgg < 1:1514693/150‑1 (MQ=255) gTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCt < 1:791383/81‑1 (MQ=255) gTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCt > 2:791383/1‑81 (MQ=255) gTGAGCCGTTGCATCAGTTCCCGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCggg > 2:572584/1‑150 (MQ=255) 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< 1:142094/140‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGc < 2:1511465/150‑1 (MQ=255) cGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGcc > 2:1222626/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACAGCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGAGCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGCCTTGCGGGTTGCTGCCGCTGCCATTCGcc > 2:12216/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGACGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGcc > 1:1845393/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTACTGCCTCGGTG‑TGCAACCTGCGCCCGGCCAGCCGCGGGCGCATCGACATCTGCAGCACCGACATGAACAGCACGCCGCGGATCGACCCCAATTACCTCAGT‑GCTCCGCAGGACTTGCGGGTTGCTGCCGATGCCATTCGcgg < 1:67959/150‑3 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |