New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 242510 | 73 (1.000) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 5.2% | coding (220/507 nt) | PP_0190 | disulfide bond formation protein B |
? | NC_002947 | = 242528 | 74 (1.050) | coding (238/507 nt) | PP_0190 | disulfide bond formation protein B |
TCCGTCTGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGCTGGGTGGC > NC_002947/242364‑242659 | tCCGTCTGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTgg > 2:1768906/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTggg < 1:1805300/150‑1 (MQ=255) tGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGgctgct > 2:209701/1‑150 (MQ=255) tGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGgctgct > 1:1464737/1‑150 (MQ=255) tGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCCGGgctgct > 2:1769747/1‑150 (MQ=255) gAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCg > 2:826473/1‑150 (MQ=255) aaaCACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGATGCCAGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCt > 1:993186/1‑150 (MQ=255) gggCTGATGCCGTGCCCAGTGTGACTCAGCCGACGGTTGCTGCTTGGGGGGTACGCGCTCATGTGTTTGGCAGCCGTGATGCAGGCGCCGGGGAGGCGGGGAATCGTCCGTTATGCTCGGCTGGCGGTGGGATGCTCGCTGCCCGCCGCt > 2:548356/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCttt > 1:1793777/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCttt > 1:1345483/1‑150 (MQ=255) tGATGCCGTGCTCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGc < 1:784838/150‑1 (MQ=255) tGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCCGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGc > 2:264423/1‑150 (MQ=255) gATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCt < 2:1464737/150‑1 (MQ=255) gATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCt < 1:209701/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGgcag > 1:1451449/1‑150 (MQ=255) gTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTg > 1:727351/1‑130 (MQ=255) gTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTg < 2:727351/130‑1 (MQ=255) aTTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCa > 1:782120/1‑150 (MQ=255) aTTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGCGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCCTCGTTATGCTCGGCTGGCCCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCCCGGcc > 2:1158485/1‑149 (MQ=255) ttGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCAt > 2:624191/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTg > 1:1374731/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTg > 1:572863/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTACTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTg > 1:1366106/1‑150 (MQ=255) cTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTgg > 2:1454961/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGt < 1:949821/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGt > 1:1482047/1‑150 (MQ=255) cAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGtt < 1:1158485/150‑1 (MQ=255) ccAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGc < 1:1690041/114‑1 (MQ=255) ccAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGc > 2:1690041/1‑114 (MQ=255) ccAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCa > 1:213777/1‑150 (MQ=255) aCGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTTGCAGCCCGGCATGTCTGGTTGCAggg > 2:1656210/1‑150 (MQ=255) ggTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAggggg < 1:1778710/150‑1 (MQ=255) ctgctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCt < 1:1481677/133‑1 (MQ=255) ctgctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCt > 2:1481677/1‑133 (MQ=255) ctgctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAg > 1:1742436/1‑150 (MQ=255) ctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAgggg < 1:124188/150‑1 (MQ=255) ctTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAgggg < 1:747731/150‑1 (MQ=255) tGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGTCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGt < 1:1319200/150‑1 (MQ=255) cGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCaa < 2:1374731/150‑1 (MQ=255) gggTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCCGGCCAGCGAGCAGCCCAgcgccagccgagcata > 2:475115‑M2/1‑97 (MQ=255) gggTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCCGGCCAGCGAGCAGCCCAgcgccagccgagcata < 1:475115‑M2/113‑17 (MQ=255) ggTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATg > 1:293584/1‑150 (MQ=255) gTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGa < 1:417583/150‑1 (MQ=255) tACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAg < 1:624191/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGAGCTGAGGGGGTCAATGAgg < 1:1343353/150‑1 (MQ=255) cgcgCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGt < 2:1482047/150‑1 (MQ=255) 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tgtgTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCgg < 2:1725276/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCgg < 1:1768906/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCgg < 2:293584/150‑1 (MQ=255) gtgtTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGTGGTCAATGAGGTATGTCCGGt < 2:993186/150‑1 (MQ=255) gCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCggg < 2:1742436/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCAc > 2:1370990/1‑89 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cgcgGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGa < 1:826473/150‑1 (MQ=255) cgGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGt < 1:1454961/150‑1 (MQ=255) ggCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCcggccagcgagcagcccagcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcct < 1:1153318‑M1/91‑64 (MQ=255) ggCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCcggccagcgagcagcccagcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcct > 2:1153318‑M1/1‑28 (MQ=255) cTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCTTGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGcggca < 1:645244/150‑1 (MQ=255) tATGCTCGGCTGGCGCtgggctgctcgctggccggcgccagccgagcataacgaaggatgccccgcgtgcccggcgcctgcagcacggctgcgaaacacaggagcgcgtaccc < 1:475115‑M1/113‑98 (MQ=255) 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TCCGTCTGGAAAACACAGTGGGGCTGATGCCGTGCCCATTGTGCCTCAGCCAACGGTTGCTGCTTGGCGGGTACGCGCTCCTGTGTTTCGCAGCCGTGCTGCAGGCGCCGGGCACGCGGGGCATCCTTCGTTATGCTCGGCTGGCGCTGGGCTGCTCGCTGGCCGGCGCTTTGCTGGCAGCACGGCATGTCTGGTTGCAGGGGGCTGAGGGGGTCAATGAGGTATGTCCGGTGCCGATCGGGCGAGTGTTCGAACAATCCTGGAGTGAGGCGGCACGGCAACTGCTGCTGGGTGGC > NC_002947/242364‑242659 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |