| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478264 = | 41 (0.560) | 4 (0.070) | 4/188 | NT | 9.2% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478359 = | 48 (0.870) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAG > NC_002947/478116‑478412 | cGCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCG > 2:307046‑M1/1‑150 (MQ=255) tCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTC > 2:1576389‑M1/1‑150 (MQ=255) ctgcgaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCtt < 1:1336783‑M1/9‑1 (MQ=255) gaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcgcg > 2:1291954‑M1/138‑150 (MQ=255) gaggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTcgcg < 1:404829‑M1/13‑1 (MQ=255) cTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGAATGGCGCCGCCGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGGGGCGCGGGTTGCAGTTTACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTATTCGCG > 2:912972‑M1/1‑150 (MQ=255) aggcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 2:1052326‑M1/137‑150 (MQ=255) gcgcagcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑Gt < 1:675357‑M1/16‑1 (MQ=255) gcagcggcggcgcgagcggtggatgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAAcc < 2:1744570‑M1/21‑1 (MQ=255) gACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCC < 2:1937808‑M1/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCT > 1:480171‑M1/1‑150 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAAC > 2:432544‑M1/1‑144 (MQ=255) tGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAAC < 1:432544‑M1/144‑1 (MQ=255) ggTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGGAGCTGTGGCAGGAAGCGAAGATCGATCTGGTGCTGTGCGCCTTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCC < 1:1491807‑M1/150‑1 (MQ=255) gCATCCGGGTGGGGGGAAGTGCATGGCGCAGCCGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGCGTGGCGCGGGTTGCAGTTTACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTAC < 2:792099‑M1/150‑1 (MQ=255) cATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTacg < 2:480171/150‑1 (MQ=255) aTCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTacga > 2:1545488/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTATATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACaggg > 1:952968‑M1/1‑146 (MQ=255) gtgtGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCCGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCt < 2:827745/150‑1 (MQ=255) tgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg < 1:24060‑M1/14‑1 (MQ=255) tgtgaagccgttggtgcaagccgggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCgg > 2:24060‑M1/107‑120 (MQ=255) gCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGAAGGGCTGAGccc > 1:746762/1‑150 (MQ=255) aaGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGC < 2:1000216‑M1/128‑1 (MQ=255) aaGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGC > 1:1000216‑M1/1‑128 (MQ=255) gTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTGTCGGCCTCTTCGCGG‑GTAGACACGCTCCTACGTCGGGCTGAGccgcacc > 1:116576/1‑145 (MQ=255) tGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGa < 2:353188/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAt > 1:1828682/1‑150 (MQ=255) cgcAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt > 1:1916543/1‑150 (MQ=255) gtgGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGcccc < 2:829046/150‑1 (MQ=255) gggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTc > 1:285862‑M1/85‑110 (MQ=255) gggctgaccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTc < 2:285862‑M1/26‑1 (MQ=255) aGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgta < 1:1628541‑M2/150‑4 (MQ=255) aGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt < 2:936481/134‑1 (MQ=255) aGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt > 1:936481/1‑134 (MQ=255) ccggtcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGc > 2:1336783‑M1/78‑150 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAACCCCGCTCCTATGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg > 1:976665‑M2/1‑140 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgg < 2:1487584‑M1/150‑46 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtc < 2:1668975‑M1/140‑36 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtc > 1:1668975‑M1/1‑105 (MQ=255) gcAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgg < 1:858761‑M2/150‑11 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGTCCCGCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGATTGGGTGGTGATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:612138‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:1084165‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 1:361568‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGAAGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcggg > 2:746762‑M2/1‑139 (MQ=255) tcaggcactgggcgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATTTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGt > 2:294523‑M1/74‑150 (MQ=255) aGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTTCAGTTGACGCCCGCTTGCGCCTGTATC > 2:788849‑M1/1‑74 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1:1586150‑M2/146‑16 (MQ=255) tcAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggttta > 2:1586150‑M2/1‑131 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1828682‑M2/1‑127 (MQ=255) gTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:233012‑M2/150‑24 (MQ=255) cgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGc > 1:627331‑M1/62‑85 (MQ=255) cgaagcactcaaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctacCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGc < 2:627331‑M1/24‑1 (MQ=255) aCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt < 2:1627674/125‑1 (MQ=255) aCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCt > 1:1627674/1‑125 (MQ=255) aCTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 1:1717777‑M2/1‑125 (MQ=255) ggCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 2:1800003‑M2/1‑122 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGt < 2:738072‑M1/60‑2 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGt > 1:738072‑M1/1‑59 (MQ=255) gCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggcc > 1:665708‑M2/1‑121 (MQ=255) cccccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccg < 2:795867‑M2/150‑31 (MQ=255) cccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACgg < 1:419949/88‑1 (MQ=255) cccGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACgg > 2:419949/1‑88 (MQ=255) tGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGt < 2:1786823/150‑1 (MQ=255) gggcCTTTGAGTGGCGGGGGTTGCAGTGGACGCACCCTTGAGCCTATATAGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgatacag < 2:952968‑M1/149‑72 (MQ=255) ccTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTa > 2:743908/1‑150 (MQ=255) 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gcgcGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTATAACCGCGCTgg > 1:519251/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGt > 2:1553763/1‑150 (MQ=255) ctggTTGCAGTTGATGGGCTCTTGAGGCGGAATCGGCCGCCTCGCGG‑GTAAACCCGCTTCTACGACGCGCTGAGCTCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa < 2:116576/148‑1 (MQ=37) gggTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAg > 2:1263549/1‑150 (MQ=255) gTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt < 1:1410261/86‑1 (MQ=255) gTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGAtgt > 2:1410261/1‑86 (MQ=255) ttGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCt > 2:677317/1‑150 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgg < 2:1620055‑M1/101‑46 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgg > 1:1620055‑M1/1‑56 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGCGCCCAACCACTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTCCCCCCGCATAGGCCGGCTCGTCTAACCTCGCTGGTAAGCCTCGa > 1:432663/1‑150 (MQ=37) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 2:1308100‑M2/117‑27 (MQ=255) cAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 1:1308100‑M2/1‑91 (MQ=255) tgccGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAgcgc < 1:743908/147‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCtt > 2:1803157/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGGCGGGCTGAGCCCAACATCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGACGCAGGTCGGTCTAACCGCGCTGCTAACACTCGGACGCCTTc > 2:818311/1‑150 (MQ=37) cccGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTAGATTGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCa < 1:1576389/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAg > 2:1854056/1‑150 (MQ=255) gCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCAc > 1:139967/1‑150 (MQ=255) cTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACTACGGGCTGAGCCCAACCTCTCATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCCCCt > 1:841181/1‑150 (MQ=255) tGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTGCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCtt > 2:713963/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTATAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCCGCCGTTCACCTTTGa < 2:519251/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAg < 1:677317/150‑1 (MQ=255) ccgGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggt < 2:405027‑M2/77‑13 (MQ=255) ccgGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTgtaggagcgggt > 1:405027‑M2/2‑66 (MQ=255) | CGCTGTCGTTGCTGGCGCCCGACCTGGTGCATCCGGGTGTGGGCAAGTGCATGGCGCAGCTGTGGCAGGAAGCGCAGATCGATCAGGTACTGGCCCCCGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGG‑GTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAG > NC_002947/478116‑478412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |