New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 482080 = | 69 (0.950) | 6 (0.080) | 6/240 | NT | 8.6% | coding (284/1272 nt) | PP_0396 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 482100 = | 61 (0.860) | coding (264/1272 nt) | PP_0396 | hypothetical protein |
TGTCGGCGCCAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCAT > NC_002947/481931‑482228 | gccgccgttccatcatggatatggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcc > 2:1923527‑M1/150‑150 (MQ=255) tCGGCGCCAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGccaccgccccca > 1:273260/1‑150 (MQ=255) ggCGCCAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGccaccgcctccacc < 1:557911/150‑1 (MQ=255) gcCAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGccaccgcctccaccgcc > 2:1582965/1‑150 (MQ=255) ccAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGccaccgcctccaccgcct < 2:1874645/150‑1 (MQ=255) tcatggatatggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCg < 1:1374961‑M1/13‑1 (MQ=255) tCAGGTGACGTTTGGCCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCCACCCCCTCATAGGCATCGACCTCGTTGTTGATGTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCg < 1:717742/150‑1 (MQ=255) tCAGGTGACGTTTGACCATGTTCCGTAGCTGAAGATCTTCGAACATGAAGTCAACAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTGCACGCCGAAGACGAACTGGTCGGCCTTACCGCCACCGCAACCGCCTCTGCCGCCTTGcc < 2:272606/150‑2 (MQ=255) atggatatggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGc < 1:1502688‑M1/15‑1 (MQ=255) tGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGt > 2:90655/1‑150 (MQ=255) tttGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAt < 1:1553331/150‑1 (MQ=255) ggaacatggcgagcagatcagtattcccgggcgcgacatcgacgaaccggtcttgcatcatggtcgtgggggcaaacagaccatcgtgcatcctggcaacaaagaattcactgccggtgaacacatcCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAt > 2:1374961‑M1/128‑150 (MQ=255) tGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAtgt < 2:395432/150‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCATTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGAtgtg < 1:372714/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCAGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGtt > 2:269471/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTCGCGGCCGTGGCATGTGCTc < 2:811223/150‑1 (MQ=255) gTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCGTGCGGCCGTGGGATGTGTTCAcc > 2:403898/1‑150 (MQ=255) tGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCgg < 1:90655/150‑1 (MQ=255) 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tCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTttgttg > 1:584206/1‑150 (MQ=255) aaCATGGATGCGGGAAATGCGTCGTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCa < 2:733839/150‑1 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCgg > 2:699551/1‑99 (MQ=255) gagaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCgg < 1:699551/99‑1 (MQ=255) agaAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATg < 2:1049518/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGt > 2:1723071/1‑150 (MQ=255) tcttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGt > 1:1425954/1‑150 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGttt > 2:1171048/1‑150 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGttt > 1:432263/1‑150 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGttt < 1:1582965/150‑1 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGttt > 1:1396822/1‑150 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGtag > 1:701368/1‑148 (MQ=255) ttcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGCGCGATAAATTTACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGttt > 2:1021630/1‑150 (MQ=255) tcCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTg < 2:1425954/150‑1 (MQ=255) ccTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGc > 1:249862/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGcc < 2:584206/150‑1 (MQ=255) ggTGATCTGGAAGACGACCTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATGGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGccccc < 1:898005/150‑1 (MQ=255) tGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCAc > 1:666415/1‑150 (MQ=255) tCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGAc > 2:48109/1‑150 (MQ=255) tGGAAGACGACCTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCa < 1:1376614/150‑1 (MQ=255) tGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCa > 2:1925981/1‑150 (MQ=255) ggAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGt < 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aGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCCCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCat > 2:395708/1‑147 (MQ=255) aGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCCCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCat < 1:395708/147‑1 (MQ=255) aCGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATg > 2:1495860/1‑123 (MQ=255) aCGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATg < 1:1495860/123‑1 (MQ=255) gAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCttt < 2:67672/102‑1 (MQ=255) gAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCttt > 1:67672/1‑102 (MQ=255) cTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGAc < 1:1723071/150‑1 (MQ=255) tCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGAcc < 2:249862/150‑1 (MQ=255) gTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCgg > 1:298573/1‑150 (MQ=255) tCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTACACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTAGCGGGCGTTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACAACCACGCTGCAAGACCGGt > 1:119796/1‑150 (MQ=255) gCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTtcgtc < 1:269471/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATa > 2:1783726/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATa < 1:48109/150‑1 (MQ=255) ttcactgccggtgaacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTtcg < 2:245842‑M1/105‑1 (MQ=255) ttcactgccggtgaacacatcCCACGGCCGCAAGGCGGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTtcg > 1:245842‑M1/22‑126 (MQ=255) gCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCCGGCCTATGATGTCGCGCCCGGGAATACTGAt < 1:1021630/150‑1 (MQ=255) ccaccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCa > 2:1794252/1‑150 (MQ=255) ccaccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCa > 1:409798/1‑150 (MQ=255) ccaccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCa > 1:373755/1‑150 (MQ=255) caccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCatgat < 2:1746090/99‑1 (MQ=255) caccgcctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCatgat > 1:1746090/1‑99 (MQ=255) cctccaccgcctTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTcc < 2:1396822/150‑1 (MQ=255) cCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGACAATATCTCCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCat > 1:492741‑M1/2‑150 (MQ=255) | TGTCGGCGCCAGTCAGGTGACGTTTGACCAGGTTGGGTAGCTCAAGGTCTTCGAACATGAATTCGAGAAATTCTTCCTGGGTGATCTGGAAGACGAACTCGTCCATGCCCTCGCCGGAATTGCCGGCCTTGCCGCGACCGCCACCGCCTCCACCGCCTTGCGGCCGTGGGATGTGTTCACCGGCAGTGAATTCTTTGTTGCCAGGATGCACGATGGTCTGTTTGCCCCCACGACCATGATGCAAGACCGGTTCGTCGATGTCGCGCCCGGGAATACTGATCTGCTCGCCATGTTCCAT > NC_002947/481931‑482228 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |