New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 734282 = | 60 (0.820) | 4 (0.060) | 4/236 | NT | 6.7% | coding (1038/1296 nt) | ndh | NADH dehydrogenase |
? | NC_002947 | 734340 = | 54 (0.780) | coding (980/1296 nt) | ndh | NADH dehydrogenase |
ACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTA > NC_002947/734136‑734429 | ctcaaggacatcgatggaccagaaaacaagcgcacggaccagccggacgtccgccctacgatgcaaaccacccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgactgcgccgcctgcccgcaacccggcagcgatcgtaacgtgccgccgcgc < 2:715987‑M1/4‑1 (MQ=255) tcaaggacttcgatggcctggaaaccaaccgcatcaaccagctggtcgtgcgccctaccctgcaaaccacccgcgacgacaacatcttcgccttcggtgactgcgccgcctgcccgcaacccggcagcgatcgtaacgtgccgccgcgcg < 2:1099897‑M1/5‑1 (MQ=255) aTAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGgcgcgc > 2:919278/1‑150 (MQ=255) aTAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGgcgcgc > 1:68200/1‑150 (MQ=255) aCATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCa < 2:22818/150‑1 (MQ=255) gccagccaGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTgc < 1:1026333/150‑1 (MQ=255) gccagccaGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTgc > 1:1662476/1‑150 (MQ=255) gccagccTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCa < 2:1662476/150‑1 (MQ=255) gccagccTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCa < 1:919278/150‑1 (MQ=255) ccagccTTCCAGCTTCCCGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCGAg > 2:1602545/1‑150 (MQ=255) agccTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAgg > 2:329991/1‑137 (MQ=255) agccTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAgg < 1:329991/137‑1 (MQ=255) agccTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCa > 1:1294606/1‑150 (MQ=255) 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agcgacaCCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCggg < 2:68200/150‑1 (MQ=255) acacCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcagg < 2:370992‑M2/150‑5 (MQ=255) acCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcaggcg < 2:62150‑M2/150‑7 (MQ=255) ccAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcaggcgg > 1:1722905‑M2/1‑143 (MQ=255) ccAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcaggcgg > 1:62150‑M2/1‑143 (MQ=255) 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gCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGa < 2:924320/138‑1 (MQ=255) cAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTcgcg > 1:1288883/1‑150 (MQ=255) aGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCGTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTCCGCGCGGCGGCACCTTACGATCGCTGACGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAATATGGTGTCGTCGCgg < 2:692661/150‑1 (MQ=255) cTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGggtggt > 1:260112/1‑150 (MQ=255) ttGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGtt > 2:1265305/1‑150 (MQ=255) ttCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGc < 2:402148/150‑1 (MQ=255) tctcCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCa < 1:110606/150‑1 (MQ=255) ctcCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAg > 1:983625/1‑150 (MQ=255) ctcCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAg < 2:983625/150‑1 (MQ=255) tcCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTCCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGGTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGCCGCAGTCACCGAAGGCGACGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAgg > 1:1099897/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCAc < 1:1388502/110‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCAc > 2:1388502/1‑110 (MQ=255) cAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGt > 2:1204159/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGt > 1:30848/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcaggcggcgca > 1:1363702‑M2/1‑93 (MQ=255) aGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGcaggcggcgca < 2:1363702‑M2/104‑12 (MQ=255) aGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTa < 1:1758263/150‑1 (MQ=255) | ACATAGAACATGCGCGCCAGCCAGCCTTCCAGCTTCACGCTGCCCATCAGGTTACCCATCAGGTTGCCCACCGCCGAGAAGCGCGACAGCGACACCAGCGAGCCATAGTCCTTGTACTCGTACGTCGGCAGGGCCTTGTTCTCCAGGCGCGCCTTCAGGCTTTGCGCCAGCATCGAAGCCTGCTGGTGCGCCGCCTGTGCGCGCGGCGGCACGTTACGATCGCTGCCGGGTTGCGGGCAGGCGGCGCAGTCACCGAAGGCGAAGATGTTGTCGTCGCGGGTGGTTTGCAGGGTA > NC_002947/734136‑734429 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |