| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 914215 | 89 (1.220) | 5 (0.070) | 5/236 | NT | 5.5% | coding (923/1743 nt) | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC |
| ? | NC_002947 | = 914241 | 87 (1.250) | coding (949/1743 nt) | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGCTGATTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTGGAG > NC_002947/914068‑914363 | tgctgATTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGAtc > 1:1746214‑M1/1‑148 (MQ=255) ctgATTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGc > 1:1866385/1‑150 (MQ=255) aTTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGcccc < 2:1618773/150‑1 (MQ=255) aTTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGcccc > 1:444897/1‑150 (MQ=255) aTTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGcccc > 1:1203355/1‑150 (MQ=255) gCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCggg < 1:827897/150‑1 (MQ=255) tcgttcgtGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGcc > 2:266700/1‑150 (MQ=255) gttcgtGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGcccc > 2:98529/1‑150 (MQ=255) gttcgtGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGcccc > 1:1714548/1‑150 (MQ=255) ttcgtGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCg > 1:989775/1‑150 (MQ=255) tgtTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCa < 2:1261306/150‑1 (MQ=255) tgtTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCa > 1:1261306/1‑150 (MQ=255) gtTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCAt < 2:1203355/150‑1 (MQ=255) gTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAAATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGAtcg > 1:1700481‑M2/1‑147 (MQ=255) tATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGAtcgg < 2:1621434‑M2/150‑5 (MQ=255) tCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTACGCTACTGGCAGGATATATCGCCTGGTATAGCGTAGATCGCCGCGGTCTGGGCCCTGGCATGAtcggcg < 2:211449‑M2/150‑7 (MQ=255) cGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcga < 2:1746214‑M1/150‑34 (MQ=255) ccTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGt > 2:74814/1‑150 (MQ=255) 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tCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGcc > 2:1652402/1‑150 (MQ=255) cGCCGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcgatagaccaggcgatatagcctgccagtagcggaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaatctgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcga < 2:1592640‑M1/150‑145 (MQ=255) cGCCGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcgatagaccaggcgatatagcctgccagtagcggaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaatctgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcga < 1:105072‑M1/150‑145 (MQ=255) cGCCGAtcatgccagggcccagaccgcggcgatctacgctataccaggcgatatatcctgccagtagcgtaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaatctgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcga < 2:211449‑M1/150‑145 (MQ=255) gCCGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcgatagaccaggcgatatagcctgccagtagcggaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaagctgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcgat > 2:1300015‑M1/1‑5 (MQ=255) ccGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcgatagaccaggcgatatagcctgccagtagcggaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaatctgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcgata < 2:1621434‑M1/150‑147 (MQ=255) ccGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCACCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTgg > 1:25535/1‑150 (MQ=255) cGAtcatgcccggggccagcccggggcggtcggcgatagaccaggcgatatagcctgccagtagcggaaccatcagtttgaaggcagcctcaccgccaatttgcatcaacgccgccggcaaggtgcccgcctctttgtaggcctcgatac > 1:1700481‑M1/1‑3 (MQ=255) cGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTGGa < 2:596776/150‑1 (MQ=255) cGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCACTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTGGa < 1:440182/150‑1 (MQ=255) gACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTGGAg < 2:375328/150‑1 (MQ=255) | TGCTGATTGCGTTGTCGTTCGTGTTCGGTATCGAGGCCTACAAAGAGGCGGGCACCTTGCCGGCGGCGTTGATGCAGATTGGCGGTGAGGCTGCCTTCAAACTGATGGTTCCGCTACTGGCAGGCTATATCGCCTGGTCTATCGCCGACCGCCCCGGGCTGGCCCCGGGCATGATCGGCGGCCTGTTGGCCAGCACCTTGGGGGCCGGCTTCATCGGTGGCATTGTCGCCGGTTTCCTCGCCGGTTACAGCGCCAAGGCCATTGCCCGATGGGCGCGCTTGCCCAGCAGCCTGGAG > NC_002947/914068‑914363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |