New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1168587 | 71 (0.970) | 5 (0.080) | 5/212 | NT | 7.2% | intergenic (+98/+155) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
? | NC_002947 | = 1168660 | 68 (1.090) | intergenic (+171/+82) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GCGGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAT > NC_002947/1168438‑1168733 | gcgGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTA < 1:1525298‑M1/150‑1 (MQ=255) aTCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAcc < 1:577493/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAcc > 1:205644/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgct > 1:1828754‑M1/1‑142 (MQ=255) gggTGCAGGGCGGGGGCGGTGGCACGGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTcc < 2:85062/148‑1 (MQ=255) cGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCt > 1:1280330/1‑150 (MQ=255) tGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCCTTTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTa < 2:205644/150‑1 (MQ=255) gCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACg < 1:323243/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAcc > 1:379728/1‑150 (MQ=255) aGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCt > 2:633574/1‑150 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGt < 1:110416/150‑1 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGt < 1:1201762/150‑1 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGt > 1:1154513/1‑150 (MQ=255) aTGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAACGATCTGCggg > 1:1236926/1‑149 (MQ=255) cACTGCTGGACGACAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCGTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTACGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGc < 1:1849320/150‑1 (MQ=255) tgGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCacacac > 2:1158602/1‑150 (MQ=255) aCGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg < 2:816335/150‑1 (MQ=255) gCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGgt > 1:1437661/1‑150 (MQ=255) 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cAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAgg > 1:101972/1‑150 (MQ=255) ttGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCg < 2:194679/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCTTTACGGCTTGGTGGGCGCTTGTTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgt < 2:1280330/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtag < 2:1437661/150‑1 (MQ=255) gtgCTTTACGGGTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCAC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagt < 2:494432/150‑1 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTTTTTTGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTTCTACGCACCGATCTCCGGGCGGCACACACCGGGTGTTTGGCACGGGCCgtagtt > 2:646968/1‑149 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta > 2:777544/1‑150 (MQ=255) tACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagg > 2:1061365‑M1/1‑82 (MQ=255) cGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAgacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgg < 2:217240‑M1/150‑71 (MQ=255) ttGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACg > 2:1612968/1‑90 (MQ=255) gtgGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTtac < 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1:219148/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCt < 2:1808948/150‑1 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgttcaacacccggtgtgtgcccaccgcagaacggtgcgtaggagcgggcctacccgccaacgggccagcacaaccactacaaataccccaggcaacaacaatgggcgccg > 1:708499‑M1/1‑17 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccg > 2:376598‑M1/1‑17 (MQ=255) tGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAGCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGAGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTGCAGGCAAAAAAAAAAAGCCCGCATAAAACGATGCGGGcgt > 1:893526/1‑148 (MQ=37) ggCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCttt < 1:1235205/150‑1 (MQ=255) gCCCTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgac > 2:1167575‑M1/1‑15 (MQ=255) gCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGACAGGCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTtc < 1:451048/150‑1 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgcttggtc > 1:1467386‑M1/1‑13 (MQ=255) ccTTTCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgacca > 1:1565432‑M1/1‑13 (MQ=255) tttCGCGGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaag < 2:1589378‑M1/150‑140 (MQ=255) tttCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCAt > 1:1597689/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAaacccgcttctcctccggcctgggtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagc < 2:451048‑M1/150‑141 (MQ=255) ttCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATc < 1:1057913/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATcc < 2:656916/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgcc < 1:964217‑M1/150‑144 (MQ=255) ggggAAGACGCGCTTCTAGGCCCCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGCTGGTGGACACAGGCCGTACACGCAGGGGTGGTCCCCGCGAAGGGGCCAGTCTAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTc < 2:156749/149‑1 (MQ=255) cgGGTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgccc < 1:26467‑M1/150‑145 (MQ=255) gggTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgcccc < 1:144057‑M1/150‑146 (MQ=255) gggTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaataccccaggcaaaaaaaaggggcgccgaccaagcgcccc > 1:633574‑M1/1‑5 (MQ=255) gggTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCa > 1:1029605/1‑150 (MQ=255) ggTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaa < 2:1331598‑M1/110‑107 (MQ=255) ggTAaacccgctcctactacggcctgtgtccaacacccggtgtgtgcccaccgcagatcggtgcgtaggagcgggtctacccgcgaaagggccagcacaaccactgcaaa > 1:1331598‑M1/1‑4 (MQ=255) ggTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAt > 1:1403542/1‑150 (MQ=255) ggTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAt > 1:258223/1‑150 (MQ=255) | GCGGATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAGGCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCAT > NC_002947/1168438‑1168733 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |