New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1838124 = | 111 (1.520) | 8 (0.120) | 5/220 | NT | 8.0% | intergenic (+29/+75) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein |
? | NC_002947 | 1838184 = | 85 (1.310) | intergenic (+89/+15) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCGGCAATGAACAG > NC_002947/1837975‑1838273 | gcagcCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATg > 1:824805/1‑150 (MQ=255) cagcCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGc < 2:1438613/150‑1 (MQ=255) ggcgttcgacccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGc < 1:1128738‑M1/2‑1 (MQ=255) ccAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGC‑CACACCTCTGAACTCCAGTGCCTTTTGTGGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCg > 1:1398455/1‑150 (MQ=255) gttcgacccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGCCCg < 2:750291‑M1/5‑1 (MQ=255) aaCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCt > 1:479905/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCt > 1:1379235/1‑150 (MQ=255) aCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTc < 1:618751/150‑1 (MQ=255) ccagccagCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGTTCATGCCCGCTcc > 1:884658/1‑150 (MQ=255) cagccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 2:884702/1‑149 (MQ=255) cagccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 1:884702/149‑1 (MQ=255) cccggcgcgggcggtattgggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctacggtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaagccagttagattatttgcgggcatGCCCGCTCCca > 2:614788‑M1/140‑150 (MQ=255) ccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttcgatttttcgcgggcacGCACGCCCCcac < 2:833500‑M1/12‑1 (MQ=255) ccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGCCCGCTCCcac < 1:966873‑M1/12‑1 (MQ=255) ccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGCCCCCTCCcac < 1:1325596‑M1/12‑1 (MQ=255) ccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 2:1550084/1‑146 (MQ=255) ccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 1:1550084/146‑1 (MQ=255) ccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 2:1444336/1‑150 (MQ=255) ccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 2:1129364/1‑150 (MQ=255) gcgcGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTa > 2:1884938/1‑150 (MQ=255) cgcgACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTaa < 2:280019/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAAt < 1:897587/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTACTcgccc > 2:299875/1‑148 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGTCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgcac > 2:1141754/1‑150 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 1:1344768/1‑133 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCca < 2:1344768/133‑1 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgcac > 1:731247/1‑150 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGGTGCTCCCATTGGCGGGCATGCCCGCTCCCAAAGTAATagcacagcat > 1:72632/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAg < 1:218730/150‑1 (MQ=255) cagcagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCACTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGc > 2:1218325/1‑150 (MQ=255) gcagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGACATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGcat > 1:519143/1‑148 (MQ=255) cagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtg < 1:1017854/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgtg < 2:731247/150‑1 (MQ=255) gTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAg > 2:560677/1‑150 (MQ=255) cAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTAc < 1:197830/150‑1 (MQ=255) ccAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCtg > 2:777923/1‑150 (MQ=255) tgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGAACTTAAGGCCTGTGCAGTACCtg > 1:60099‑M1/102‑150 (MQ=255) aGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACtt < 2:1270163/129‑1 (MQ=255) tgggCATGCATATGGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg < 2:1379235/148‑1 (MQ=255) gTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTATTCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg < 1:154274/150‑1 (MQ=255) agcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCtgtg > 2:1128738‑M1/100‑150 (MQ=255) ggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCgg > 1:447759‑M1/93‑150 (MQ=255) cAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAgg > 2:1862337/1‑124 (MQ=255) cAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAgg < 1:1862337/124‑1 (MQ=255) cAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGc < 1:777923/150‑1 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTaa > 2:249375/1‑121 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTaa < 1:249375/121‑1 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCt < 1:693576/137‑1 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCt > 2:693576/1‑137 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCg > 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aaCCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGa > 2:949720/1‑150 (MQ=255) cATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACt > 2:268475/1‑150 (MQ=255) cATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACt > 1:1642922/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc < 2:1642922/150‑1 (MQ=255) ttGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc > 2:722881/1‑150 (MQ=255) gCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgc > 2:1286068/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcg > 1:1605193/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcg > 1:1054691/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcg > 2:594383/1‑150 (MQ=255) gtTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTa < 1:657729/150‑1 (MQ=255) ttGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCt < 1:121529/68‑1 (MQ=255) ttGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCt > 2:121529/1‑68 (MQ=255) cTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGt < 1:1129364/150‑1 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTg < 2:965725/127‑1 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTg > 1:965725/1‑127 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTa > 1:1711334/1‑150 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTa > 1:573754/1‑150 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGACGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTa > 1:1703411/1‑150 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTgg > 2:376203/1‑126 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTgg < 1:376203/126‑1 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGc > 1:1221016/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGCCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGcc < 1:640755/150‑1 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcgc < 2:496393/132‑1 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcgc > 1:496393/1‑132 (MQ=255) ggCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCGGCAATg < 1:1444336/150‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc < 2:1564397/122‑1 (MQ=255) gCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc > 1:1564397/1‑122 (MQ=255) cATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCGGCAATGaa < 2:1144449/150‑1 (MQ=255) | GCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACC‑GTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCGGCAATGAACAG > NC_002947/1837975‑1838273 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |