| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2911614 = | 81 (1.110) | 7 (0.100) | 6/246 | NT | 8.1% | coding (591/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
| ? | NC_002947 | 2911640 = | 79 (1.090) | coding (617/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin | |||||
ACGCCTGGATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAACGC > NC_002947/2911469‑2911763 | aCGCCTGGATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCcgcg > 2:1337503/1‑150 (MQ=255) cTGGATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTGCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGt < 1:1795352/150‑1 (MQ=255) tGGATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTg < 2:1586465/150‑1 (MQ=255) ggATGCCCTTGTTTGGCCAGTTTTTCGACCACGTTCTGGACTTGGTCAGCAAGAGCATCACCGACATCGTTTTCATCCCGCTGCTCCCGCACGCCTCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGTCCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTgc < 2:337725/150‑1 (MQ=255) gATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTgcg > 2:194815/1‑150 (MQ=255) gACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCa > 2:555735/1‑149 (MQ=255) gACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCa < 1:555735/149‑1 (MQ=255) cttcttTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCAccgc > 1:1034581/1‑150 (MQ=255) cttcttTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCAccgc > 2:864009/1‑150 (MQ=255) cttTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑Cgg < 2:1603609/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGa > 1:1120739/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGa > 2:929637/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGa > 1:332744/1‑150 (MQ=255) ttcGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtg < 2:1724977/150‑1 (MQ=255) ttcGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtg < 2:1120739/150‑1 (MQ=255) ttcGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtg > 2:1922983/1‑150 (MQ=255) tgagACAACGGCCTGAACCTGGTAAGAAAGGGCAGCATCGAGATCGTGGTCGGCGCGGTGCGCTCGGCAGTTCCTGTGTCCGTGGCGGGAAGTCCGCCTATCTCCGTGGTGCTGTCCGGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtg < 2:774093/147‑1 (MQ=255) cgtgtattcgcgcaggaacacctggtgcgagggatgtgaactgtaggtctggctctggtcgacgaagggcgaggtggtgttgggctggctatcgtcggcggtacccaccacgccatCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtg < 2:1503814‑M1/34‑1 (MQ=255) 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ggACCTGGTCAGCAAGAGCAGCCCATCTAACTTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCcga < 1:70/150‑1 (MQ=255) ggACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCcga > 1:1816646/1‑150 (MQ=255) gACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCcgac > 1:1784748/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCcgacga > 2:1318188/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATa < 1:345075/150‑1 (MQ=255) cctggtgcgagggatgtgaactgtaggtctggctctggtcgacgaagggcgaggtggtgttgggctggctatcgtcggcggtacccaccacgccatCCGCGCCGTACGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGtggtgg > 2:1333791‑M1/97‑134 (MQ=255) cctggtgcgagggatgtgaactgtaggtctggctctggtcgacgaagggcgaggtggtgttgggctggctatcgtcggcggtacccaccacgccatCCGCGCCGTACGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGtggtgg < 1:1333791‑M1/38‑1 (MQ=255) aGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATagccag < 2:731579/150‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTggg < 2:468365/129‑1 (MQ=255) cAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGCTagccagcc > 2:657823/1‑150 (MQ=255) cAAGAGCAGCACAGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTggg > 1:468365/1‑129 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aCTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCgtggt > 2:1709424/1‑52 (MQ=255) aCTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTc > 1:1928357/1‑130 (MQ=255) aCTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTGCACATCCCTc < 2:1928357/130‑1 (MQ=255) ttCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGaa > 1:557515/1‑150 (MQ=255) acccaccacgccatCGGCGCCG‑GCGGTGCGCACGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGaa < 1:692130‑M1/136‑1 (MQ=255) ccaccacgccatCGGCGCCG‑GCGGTGCGCACGGCGCGGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATa < 1:1503814‑M1/138‑1 (MQ=255) caccacgccatCGGCGCCG‑GCGGTGCGCACGGCGCGGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAg > 2:600043‑M1/12‑132 (MQ=255) caccacgccatCGGCGCCG‑GCGGTGCGCACGGCGCGGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAg < 1:600043‑M1/121‑1 (MQ=255) tGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTGGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATaca < 1:41431/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGaa < 1:763874/145‑1 (MQ=255) ggTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGaa > 2:763874/1‑145 (MQ=255) ggTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATacac > 1:150630/1‑150 (MQ=255) tGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGgtgt < 2:266973/132‑1 (MQ=255) tGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGgtgt > 1:266973/1‑132 (MQ=255) tGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACgg < 1:1318188/150‑1 (MQ=255) gCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGt < 1:929637/150‑1 (MQ=255) gCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGt > 1:1635545/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATCGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCACACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGtacac > 2:954561/1‑146 (MQ=255) tCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAAc > 1:964060/1‑150 (MQ=255) tCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAAc < 1:1922983/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAg > 1:1747490‑M1/1‑121 (MQ=255) CCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAg < 2:1747490‑M1/121‑1 (MQ=255) CCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAACGc < 1:1022597‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAACGc < 1:372255‑M1/150‑1 (MQ=255) | ACGCCTGGATGACCTTCTTTGGCCAGTTCTTCGACCACGGCCTGGACCTGGTCAGCAAGAGCAGCACCGACATCGTGTTCATCCCGCTGCGCCCGGACGACCCTCTGTTCGTGGCCGGCAGCCCGACCAACTTCATGGTGCTGTCCCGCGCCGTGCGCACCGC‑CGGCGCCGATGGCGTGGTGGGTACCGCCGACGATAGCCAGCCCAACACCACCTCGCCCTTCGTCGACCAGAGCCAGACCTACAGTTCACATCCCTCGCACCAGGTGTTCCTGCGCGAATACACGGTCAACGC > NC_002947/2911469‑2911763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |