New junction evidence | |||||||||||
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CTACAGCGTGCACCGGTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCG > NC_002947/3978256‑3978552 | cTACAGCGTGCACCGGTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCt < 1:1299647/150‑1 (MQ=255) cTACAGCGTGCACCGGTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCt < 1:1236697/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCACCGGTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTc > 2:544820/1‑150 (MQ=255) 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ggTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATg < 2:46630/150‑1 (MQ=255) ccACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGGCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGcccca > 1:521215/1‑148 (MQ=255) actcactcAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGcc > 2:241981/1‑150 (MQ=255) tcactcaGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGc < 2:55696/147‑1 (MQ=255) tcactcaGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGc > 1:55696/1‑147 (MQ=255) 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tCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTGTGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGcaaca > 2:587776/1‑150 (MQ=255) cgatctgcaGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGgctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacc > 1:901572‑M2/5‑36 (MQ=255) cTGCACCGGATCA‑GGGCGTATGCCCTGCCGCGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCAGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCCGGCTTGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACACCGCcag > 2:797604/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCAGAAGTTCGTTATCACTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCcagc > 2:1021598/1‑150 (MQ=255) gcagcagtggcagggcataagccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacccgacct < 2:125898‑M1/150‑146 (MQ=255) gCAGCcgtggcagggcatacgccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacccgacct < 2:1859541‑M1/150‑146 (MQ=255) gCAGCcgtggcagggcatacgccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcaca < 2:1835896‑M1/138‑134 (MQ=255) gCAGCcgtggcagggcatacgccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcaca > 1:1835896‑M1/1‑5 (MQ=255) cAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGgctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgctcgggcaggcattggagggaccagcccagtaacccagagcc < 2:901572‑M2/150‑122 (MQ=255) aGCcgtggcagggcatacgccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacccgacctga < 1:1705290‑M1/150‑148 (MQ=255) ccgtggcagggcatacgccctgaacagctgcaggccatgagcaatgaaccttggcgcacctgtggcgacacccgcgagcgccttgagctgctggcactgcaggtgatcgggcaggcattggagggcacggcacagttacccgacctgagt < 1:1418260‑M1/150‑150 (MQ=255) cTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGa > 2:1254767/1‑112 (MQ=255) cTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGa < 1:1254767/112‑1 (MQ=255) cTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCcagca < 2:538249/146‑1 (MQ=255) cTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCcagca > 1:538249/1‑146 (MQ=255) | CTACAGCGTGCACCGGTTGCCACTCACTCAGGTCGGGTAACTGTGCCGTGCCCTCCAATGCCTGCCCGATCACCTGCAGTGCCAGCAGCTCAAGGCGCTCGCGGGTGTCGCCACAGGTGCGCCAAGGTTCATTGCTCATGGCCTGCAGCTGTTCA‑GGGCGTATGCCCTGCCACGGCTGCCCAAGGTCGCAGTCGAGCGGGTCCCAGCCCGGCACCAGTGCTTTGGCCAAAGCCCGCAGCAGGCTGGCATTACCCCCACGACCGTCGCCACGCTCGACCCGCAACAACGCCAGCAGCG > NC_002947/3978256‑3978552 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |