New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5841887 = | 83 (1.140) | 5 (0.070) | 5/242 | NT | 5.6% | coding (400/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5841923 = | 88 (1.240) | coding (436/1431 nt) | calB | coniferyl aldehyde dehydrogenase |
TGCGCCACGCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTC > NC_002947/5841738‑5842036 | tGCGCCACGCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCg > 2:591932/1‑150 (MQ=255) cgaagggcaggcgggcgaaggcctggcccacctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGc < 2:379397‑M1/2‑1 (MQ=255) gcCACGCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCa > 1:733486/1‑150 (MQ=255) aCGCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCg < 1:819458/150‑1 (MQ=255) gCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGc > 1:365341/1‑150 (MQ=255) gCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGc > 2:1831494/1‑150 (MQ=255) aaGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCa < 2:82339/139‑1 (MQ=255) aaGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCa > 1:82339/1‑139 (MQ=255) gCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTTCAGCCGGCCAGTGCATAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTTCCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAc < 2:727956/150‑1 (MQ=255) cACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGAcc < 2:569813/150‑1 (MQ=255) aCTGGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCt < 1:1042661/150‑1 (MQ=255) gCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTgcgc > 1:379397/1‑150 (MQ=255) cAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGcc > 2:1864300/1‑150 (MQ=255) cGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTg < 2:233083/150‑1 (MQ=255) ggATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGgccg > 2:820307/1‑150 (MQ=255) ctcgacctcaccgagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGgccgcc < 2:1168689‑M1/33‑1 (MQ=255) tGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTCCCCGTTGTTCCTCGCGATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGccgccg < 2:1192417/150‑1 (MQ=255) gcAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCa > 1:1516010/1‑150 (MQ=255) cgccgACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCgg < 2:365341/150‑1 (MQ=255) gagcacaacgctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTc > 2:190678‑M1/106‑150 (MQ=255) gccgcGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGc < 1:1831494/150‑1 (MQ=255) gccgcGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGATCGGGAGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGCCGGCGTTATCGTGCGGTGCATTCACCTGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGCCCTCCGGGTCAGGc > 1:137569/1‑150 (MQ=255) gctgaccaggtctgtggggaacacacgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAg > 1:1168689‑M1/97‑150 (MQ=255) tCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGc > 1:390496/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCAATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCg > 1:173637/1‑150 (MQ=255) ggCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGa < 2:1516010/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAg > 2:852856/1‑150 (MQ=255) gCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAg > 2:1665913/1‑150 (MQ=255) 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cAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGc > 2:1606142/1‑128 (MQ=255) cAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGc < 1:1606142/128‑1 (MQ=255) acgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATg > 2:1909439‑M1/73‑120 (MQ=255) acgctcgagcagttgctgcagggccaggcccgtcgcgggcgtggcctcgctaagcttgagcatgacccggttGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATg < 1:1909439‑M1/48‑1 (MQ=255) aGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACg > 2:175598/1‑150 (MQ=255) gcACAGGTGGGCTAGCAACCCTCGGGCGGGGGCGGCGTCATCGTGCAGTGGAACTACCCGTTGTGCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGc < 2:742799/150‑1 (MQ=255) 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> 1:652848/1‑112 (MQ=255) tCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCtt < 2:652848/112‑1 (MQ=255) tCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCTGCGGGCCTGGCCCTgcccac > 2:892372/1‑146 (MQ=255) cAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCaa > 2:1464732/1‑150 (MQ=255) cAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCaa < 1:175598/150‑1 (MQ=255) aaCCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCaaa > 1:738127/1‑149 (MQ=255) 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tGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTa < 2:1886333/84‑1 (MQ=255) tGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTa > 1:1886333/1‑84 (MQ=255) tGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCAc > 1:488483/1‑94 (MQ=255) tGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCAc < 2:488483/94‑1 (MQ=255) cGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTgg < 1:1665913/150‑1 (MQ=255) cTACCCGTTGTTATGCGCTGGTGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGt < 2:1321339/150‑1 (MQ=255) tACCCTTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCca < 2:10764/133‑1 (MQ=255) tACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCca > 1:10764/1‑133 (MQ=255) aCCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTtg > 2:1591559/1‑150 (MQ=255) cccGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTtgt > 2:1637875/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATTCTCAACCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTtgtg < 1:820307/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAgg < 2:1168222/75‑1 (MQ=255) cGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAgg > 1:1168222/1‑75 (MQ=255) gttgttCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGACCCCTGGACGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCt > 2:711071/1‑150 (MQ=255) gttccgaGCCATCGGCCCGCTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCgg > 2:137569‑M1/8‑150 (MQ=255) ttCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGTGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGt < 2:1207075/150‑1 (MQ=255) ttCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGccc > 2:490624/1‑94 (MQ=255) ttCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGccc < 1:490624/94‑1 (MQ=255) ttCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGt < 1:1637875/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGa < 1:913046/150‑1 (MQ=255) cTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGCGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAg > 2:771838/1‑150 (MQ=255) GCCATCCGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTc > 1:685580‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGCGCCACGCCGAAAAGCACTTGCAACGCTGGATGCGCAGCCGCCGACGCCGCGTCGGCCTGGCGTTCCAGCCGGCCAGCGCACAGGTGCGCTATCAACCCTTGGGCGTGGTCGGCGTCATCGTGCCGTGGAACTACCCGTTGTTCCTCGCCATCGGCCCGTTGACCTGCGCCCTGGCCGCCGGCAACCGGGTCATGCTCAAGCTTAGCGAGGCCACGCCCGCGACGGGCCTGGCCCTGCAGCAACTGCTCGAGCGTGTGTTCCCCACAGACCTGGTCAGCGTTGTGCTCGGTGAGGTC > NC_002947/5841738‑5842036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |