| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5903842 | 55 (0.750) | 3 (0.050) | 3/216 | NT | 5.5% | intergenic (+42/+65) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 5903870 | 55 (0.870) | intergenic (+70/+37) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGC > NC_002947/5903693‑5903988 | gAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG < 2:674920‑M1/150‑1 (MQ=255)gAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG > 2:1511460‑M1/1‑150 (MQ=255) gagTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTc > 2:1268947/1‑150 (MQ=255) tgtgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTcacc < 1:1186026/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGCGGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCTCTCCCACAGGGCTcaccac > 2:1475078/1‑150 (MQ=255) tgGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACaa < 1:1538419/150‑1 (MQ=255) ggTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGTCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAc < 1:1902954/150‑1 (MQ=255) gTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc > 2:963485/1‑150 (MQ=255) gTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcc > 2:265926/1‑150 (MQ=255) tCATGTAGCCCTGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCt < 2:725973/150‑1 (MQ=255) tCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCt < 2:1436088/150‑1 (MQ=255) tGTAGCCCTCTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGTTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 2:804142/150‑1 (MQ=255) tGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa > 1:963818/1‑150 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGGAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCACGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAgg > 1:1157374/1‑150 (MQ=255) aTTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTcc > 2:1526863‑M2/1‑148 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgt < 1:94459‑M2/150‑7 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTccctgt < 2:1815824‑M2/150‑7 (MQ=255) gcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCt > 2:1525857‑M1/103‑150 (MQ=255) 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acttgcaggCAGGATTGCGCAGTAATATCAGGGACTAGCCACATTGTGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGCGCCTTCG‑‑CGCGCATGCACGTCCTCAGAGTGGCCACCACAACCCGTAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCggg > 2:1390872/8‑150 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGc < 1:1689642/125‑1 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGc > 2:1689642/1‑125 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCg > 2:790560/1‑150 (MQ=255) gggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcatGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTg > 1:1269097‑M1/88‑150 (MQ=255) 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TCCCCCAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATc > 1:661679‑M1/1‑150 (MQ=255) TCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATc > 1:753209‑M1/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggc > 1:1815824‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggc > 1:1511460‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggc < 1:1072432‑M1/150‑143 (MQ=255) cacaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggca > 2:674469‑M1/1‑7 (MQ=255) CACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCtt < 1:1899308‑M1/104‑1 (MQ=255) CACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCtt > 2:1899308‑M1/1‑104 (MQ=255) acaGGGacctcacagccttcagggttgtggtgagccctgtgggagcgggcatgcccgcgaaggctccagcaccgattcaaagccataccgcatcccaatgtggatagtccctgatacttctgaccaatccagccctcaagggattggcaa < 2:1815824‑M1/150‑145 (MQ=255) AGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCAAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCctgc < 1:357944‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCtt > 2:407575‑M1/1‑137 (MQ=255) GGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCtt < 1:407575‑M1/137‑1 (MQ=255) | GAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCG‑‑CGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGTGAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGCACCCTCTTCGATCGCCTGC > NC_002947/5903693‑5903988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |