New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aCCTGGCGAACCCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCtt > 2:1151654/1‑69 (MQ=255) aCCTGGCGAACCCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGgcg > 2:1597156/1‑150 (MQ=255) cTGGCGAACCCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCtt > 2:1562929/1‑67 (MQ=255) cTGGCGAACCCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCtt < 1:1562929/67‑1 (MQ=255) tcgaacccaacgtcaagggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGgcgcgc < 2:328465‑M2/54‑1 (MQ=255) tcgaacccaacgtcaagggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGgcgcgc > 1:328465‑M2/24‑77 (MQ=255) tcgaacccaacgtcaagggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGAc < 2:1754314‑M2/104‑1 (MQ=255) tcgaacccaacgtcaagggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGAc > 1:1754314‑M2/24‑127 (MQ=255) CCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAAc < 1:769833‑M1/86‑1 (MQ=255) CCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAAc > 2:769833‑M1/1‑86 (MQ=255) CCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGTTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCgg < 1:1379520‑M1/150‑1 (MQ=255) CTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCt < 2:195363‑M1/89‑1 (MQ=255) CTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCt > 1:195363‑M1/1‑89 (MQ=255) CTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCAGCCACATGCGCGTGGAGGTCGTGACTATCGCCATGCGCTGACGAAAGGCCTTggg < 2:510682‑M1/150‑1 (MQ=255) aCGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGCGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGa < 1:185762/115‑1 (MQ=255) aCGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGCGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGa > 2:185762/1‑115 (MQ=255) cGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCgg < 1:721356/150‑1 (MQ=255) cGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCgg < 1:733238/150‑1 (MQ=255) gTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGc > 1:182351/1‑150 (MQ=255) tt‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCg > 2:28285/1‑150 (MQ=255) ggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCGATg < 1:28285‑M2/144‑1 (MQ=255) ggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCGATg < 2:1499307‑M2/144‑1 (MQ=255) ggttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCGATg > 1:902708‑M2/7‑150 (MQ=255) ttcgAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCGATGGt > 2:638954‑M2/5‑150 (MQ=255) | GAAGCCAGCAGTTCATTCTCGCTTTCCAGCAAGAAGCCTTCGCCGGCCAGTGCATGCAGGTTGAGCGTCCCGTACTGGCGGCGGGCCACCCACAGGACCGTCTGGATGTCACGCAGGCCACCTGGCGAACCCTTGACGTT‑‑GGGTTCGAGGTTGTACTCGGTGTCGTTGTACTTGTGGTGGCGGGCCTTGAGTTCGGCGCGCTTGGCCAGGAAGAACTCCTTGCTCGGCCACATGTGCGCGGTGCTGGTGACTTCCAGCATGCGCTGGCGCAAGGCCTCGGGGCCGGCGATGGT > NC_002947/1783352‑1783644 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |