| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1875397 | 77 (1.050) | 7 (0.100) | 5/236 | NT | 8.1% | coding (79/756 nt) | cobS | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
| ? | NC_002947 | = 1875414 | 85 (1.220) | coding (96/756 nt) | cobS | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTG > NC_002947/1875266‑1875561 | gCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGc < 2:1799329‑M2/150‑2 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg < 1:1291472‑M2/150‑5 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg > 1:942025‑M2/1‑146 (MQ=255) ttGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggc < 1:1549291‑M2/150‑6 (MQ=255) ctgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCAcc > 2:1820989/1‑150 (MQ=255) tgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACcg > 2:1078859/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:292423/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:508529/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAg > 1:520130/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 1:1202961/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa > 1:1394211/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 2:1394211/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAgg < 1:1728227/150‑1 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTCGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 2:1196295/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGATGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGGATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 1:1440722/1‑150 (MQ=255) gcgcGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCgctg < 1:1196295/150‑1 (MQ=255) gcgTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatc > 1:1259414‑M2/1‑118 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGc > 2:590067/1‑150 (MQ=255) 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tGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctgc < 2:442283/150‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt > 2:615462/1‑115 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt < 1:615462/115‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGtt > 1:1278513/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTATGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTc < 2:1258686/150‑1 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg > 1:74185/1‑150 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg < 1:1130987/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCgg < 1:1078859/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 2:1356928/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 1:1820989/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACTCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCt < 2:560691/150‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa > 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ccTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCttt < 1:1287994/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagca < 1:420315‑M2/150‑128 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc < 2:1056431/142‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc > 1:1056431/1‑142 (MQ=255) gCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagcaa > 2:420315‑M2/1‑22 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc > 2:1114654/1‑67 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc < 1:1114654/67‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTTGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct < 2:74185/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct > 2:1108982/1‑150 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg > 2:204081/1‑39 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg < 1:204081/39‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGTCTTTGCTGCTGACGTtgt < 1:1799329/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTtgt < 1:1342847/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTtgct > 2:269991/1‑137 (MQ=255) ccGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTtgct < 1:269991/137‑1 (MQ=255) ccGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTgg < 1:590067/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGCACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTgg < 2:1341794/150‑1 (MQ=255) cGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTcgc < 1:1519576/117‑1 (MQ=255) cGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTcgc > 2:1519576/1‑117 (MQ=255) aTGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTg > 2:1847524/1‑150 (MQ=255) | GCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGTGGGTACTG > NC_002947/1875266‑1875561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |