New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2137636 = | 54 (0.740) | 4 (0.060) | 3/240 | NT | 6.3% | coding (453/624 nt) | gstB | glutathione S‑transferase |
? | NC_002947 | 2137733 = | 67 (0.950) | coding (550/624 nt) | gstB | glutathione S‑transferase |
AGCAGTGCGCGCAATTACTGGCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTCACTTGAACCTGCTTCGATAGTCATTATCAATAGATGTGACTGTACTTGTGCAGCCTGGCCTTGCACCATGGCTGCACTCAC > NC_002947/2137584‑2137882 | aGCAGTGCGCGCAATTACTGGCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTacc < 2:1308781/150‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCGCAATTACTGGCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGCTCCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTacca > 2:154481/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGCGCAATTACTGGCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGGCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTaccac < 1:1346513/150‑1 (MQ=255) 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tGGCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATg > 1:1350568/1‑150 (MQ=255) gCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGTTGACCAGATCGGTCCGTTCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGaa < 1:1478655/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGaa > 2:853464/1‑150 (MQ=255) gCCATTGCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGaa > 1:1657070/1‑150 (MQ=255) gCCGACGAAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCtt > 1:456156/1‑150 (MQ=255) cgacgaAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTaa > 2:1642959/1‑150 (MQ=255) cgacgaAACCCTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTaa < 1:378302/150‑1 (MQ=255) cccTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGcc < 1:269908/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGccc < 2:1350568/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCAGCCGTACCTGTCCGGTGACCAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGcc < 2:394762/150‑1 (MQ=255) 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cAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTc > 1:1825215/1‑150 (MQ=255) cAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTc > 2:978480/1‑150 (MQ=255) cAGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTc > 1:301904/1‑150 (MQ=255) aGATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTCa < 2:301904/150‑1 (MQ=255) gATCGGCATGGGCGACATCCCACTGGGTAGCTTCATCTATGCCTGGTTCGAACTGCCCATCGAGCGCCCGGACATGTACCACCTTCAAGCCTGGTATGAACGCCTTAAGCAACGCCCGGCCTACCAGGCCGCCGTGATGACCGCGCTCAc < 2:1825215/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |