New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3167651 = | 76 (1.040) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 7.8% | coding (745/1212 nt) | PP_2781 | beta‑ketoacyl synthase |
? | NC_002947 | 3167676 = | 68 (0.970) | coding (770/1212 nt) | PP_2781 | beta‑ketoacyl synthase |
GGCAGCGAGCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTTGTGCC > NC_002947/3167531‑3167825 | ggCAGCGAGCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGgcgc < 1:548423/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGaa < 2:1307994/150‑1 (MQ=255) aGCGAGCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGaa < 2:1545693/150‑1 (MQ=255) gCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCt > 2:1434917/1‑150 (MQ=255) ctgcacaccaacacatcggttgggctgtcgggcaggctcaagcgaccgagggaggcatgggccgtcatgtcggcgaggcacgcctgaggaccggccgacaggtcttcgcgccggcgcggcagcgttggtgctgcgccGGCGCGAAGACCt < 1:666867‑M2/13‑1 (MQ=255) ctgcacaccaacacatcggttgggctgtcgggcaggctcaagcgaccgagggaggcatgggccgtcatgtcggcgaggcacgcctgaggaccggccgacaggtcttcgcgccggcgcagcaccaacgctgccgcgccGGCGCGAAGACCt < 1:881378‑M2/13‑1 (MQ=255) cTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACCCGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTg > 2:279168/1‑150 (MQ=255) ggATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTc < 1:1434917/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCg > 1:1081243/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGcc > 2:1722304/1‑150 (MQ=255) cccTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCg > 1:1317403/1‑150 (MQ=255) cgcTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTTACATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTc > 1:356432/1‑150 (MQ=255) gcTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCa > 2:816695/1‑150 (MQ=255) gcTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCa > 2:436713/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAg < 2:1806251/150‑1 (MQ=255) cTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATGGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAg < 1:316678/150‑1 (MQ=255) tCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCg > 1:1612210/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCg > 1:783251/1‑150 (MQ=255) 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ggCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACCCGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACag < 1:279168/150‑2 (MQ=255) ggCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACAt < 2:278109/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATg > 2:930861/1‑150 (MQ=255) gtCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGcc < 1:1452073/150‑1 (MQ=255) tcaGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTTCCTCGCCGACATAACGGCACATg > 2:184814/1‑150 (MQ=255) cgagggaggcatgggccgtcatgtcggcgaggcacgcctgaggaccggccgacaggtcttcgcgccGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGgc < 2:1839780‑M1/28‑1 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tCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGc > 2:1060389/1‑150 (MQ=255) cGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCt < 1:930861/150‑1 (MQ=255) gccgtcatgtcggcgaggcacgcctgaggaccggccgacaggtcttcgcgcgGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAg > 1:363421‑M1/53‑86 (MQ=255) gccgtcatgtcggcgaggcacgcctgaggaccggccgacaggtcttcgcgcgGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAg < 2:363421‑M1/34‑1 (MQ=255) gAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTc < 1:339513/93‑1 (MQ=255) gAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTc > 2:339513/1‑93 (MQ=255) acacGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCCTTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTTGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGa < 1:1557947/150‑1 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cGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGACCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCAc < 2:483705/150‑1 (MQ=255) ggggAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCAcc < 1:1901408/150‑1 (MQ=255) gccggcgcagcaccaacgctgccgcgccGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCg < 2:1839780‑M2/66‑1 (MQ=255) gccggcgcagcaccaacgctgccgcgccGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCg > 1:1839780‑M2/29‑94 (MQ=255) gAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGc < 2:1742590/150‑1 (MQ=255) GGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGAt < 1:1377352‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGca < 1:257763/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACaaa > 1:1581718/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGa > 1:506479/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGa > 1:1288024/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGa > 1:1034165/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGa > 1:955763/1‑150 (MQ=255) gTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCTCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGtt < 1:365946/113‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCTCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGtt > 2:365946/1‑113 (MQ=255) gTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACcgc < 1:184814/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCAGCGATGCGCACAAAGACcgcg > 2:852709/1‑150 (MQ=255) gctgcGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCgt < 2:125542/150‑1 (MQ=255) gccGGCGAGAAGACCTGAGGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTAGCCGACAGGACTCCCTAAGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGtgttgt < 2:356432‑M2/147‑1 (MQ=255) ccGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTtgtg < 2:1063766‑M2/148‑1 (MQ=255) ccGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTtgtg > 1:916434‑M2/3‑150 (MQ=255) cGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTTGTGc < 2:947155‑M2/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTTGTGc < 2:1715895‑M2/149‑1 (MQ=255) ggCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTTGTGcc < 2:1377352/150‑1 (MQ=255) | GGCAGCGAGCTGGATGCCCTGGCGCTGTCCGGGTTGGTCCAGGCGGGTGTCATCAGCGCCAACGGCTCGAACACGCTGCTGCCGTTCGACCTTCGGGGCACCGGCGGCATTGCCGGGGAGGGCGCGGCAGCGTTGGTGCTGCGCCGGCGCGAAGACCTGTCGGCCGGTCCTCAGGCGTGCCTCGCCGACATGACGGCCCATGCCTCCCTCGGTCGCTTGAGCCTGCCCGACAGCCCAACCGATGTGTTGGTGTGCAGCGGCACCGGCGATGCGCACAAAGACCGCGTGTTGTGCC > NC_002947/3167531‑3167825 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |