| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4340118 | 25 (0.340) | 14 (0.270) | 9/180 | NT | 36.3% | intergenic (+59/‑272) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 4340134 | 31 (0.590) | intergenic (+75/‑256) | ribAB‑II/PP_3814 | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase/polyamine ABC transportersubstrate‑binding protein | |||||
CGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACA > NC_002947/4339992‑4340283 | cgGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattc > 1:335007‑M2/1‑143 (MQ=255) cGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaa > 1:1039004‑M2/1‑134 (MQ=255) aGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACAGCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacaggg > 1:1647649‑M2/1‑119 (MQ=255) gtggtgCAGAGCATCCCGTTAGTCCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAGGAAATTGATTTAGCGGGGCCCTATAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGGCACAACCGAcgaattcgcgggtaagcccactcatacagggcc < 1:44319‑M2/150‑34 (MQ=255) ccGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACTCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagg > 2:1253538‑M2/1‑93 (MQ=255) ccGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagg < 1:1253538‑M2/123‑31 (MQ=255) tGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGcc > 2:740633/1‑150 (MQ=255) acacaAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATAcc > 1:1351897/1‑150 (MQ=255) aaGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCtt < 1:740633/150‑1 (MQ=255) ttAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgc < 1:736456‑M2/65‑10 (MQ=255) ttAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgc > 2:736456‑M2/1‑56 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTg < 2:246569/104‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTg > 1:246569/1‑104 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCata > 2:535394/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGa > 2:1115136/1‑136 (MQ=255) gAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGa < 1:1115136/136‑1 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCttt < 2:695861/81‑1 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCttt > 1:695861/1‑81 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATcc > 1:671177/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGc < 1:1538016/114‑1 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGc > 2:1538016/1‑114 (MQ=255) ccGCGAATGCGTCGGTGGTGTCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTg < 1:174428/111‑1 (MQ=21) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagc < 1:1285032‑M2/150‑124 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagc < 2:1755360‑M2/150‑124 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagc < 2:1696946‑M2/150‑124 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacg > 2:25812‑M2/1‑27 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacg < 1:25812‑M2/112‑86 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:754273/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 2:1320730/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCAGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAc > 1:968009/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGAcc > 2:764970/1‑150 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccc < 2:140734‑M2/150‑126 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagagctcaatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccc < 1:717799‑M2/150‑126 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgt > 2:989403‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgt < 1:989403‑M2/80‑56 (MQ=255) gcgAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCt < 2:1351897/150‑1 (MQ=255) gaTGCGAGGGAGCCAACACCGTCGCATCCGCACGTAAGCCCGCTCCTCCAGGGCCCGTGGTGCTTTTGACAGGCCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATTCCTCTTGCCCAAATCTTGGAATACCCTAATATGATATCCCGTAGACCTTgc < 2:813617/149‑2 (MQ=255) aTGCGAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcg < 2:1220107‑M2/150‑130 (MQ=255) gAGGGTGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcgtatt < 2:1549782‑M2/150‑134 (MQ=255) gAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt < 2:1599678/111‑1 (MQ=255) gAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCtt > 1:1599678/1‑111 (MQ=255) ggTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTAAGTCTGCAg < 2:671177/150‑1 (MQ=255) gTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCtt < 2:1822315/139‑1 (MQ=255) gTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCtt > 1:1822315/1‑139 (MQ=255) tGACACCACCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcgtatttcagc > 2:1285032‑M2/1‑12 (MQ=255) tGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGc < 1:535394/150‑1 (MQ=255) gACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGc > 1:1075865/1‑96 (MQ=255) gACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGc < 2:1075865/96‑1 (MQ=255) ccaccacCGTCGCATCCGCGGGTCAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCg < 2:44319/149‑1 (MQ=255) acacCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCg < 1:754273/150‑1 (MQ=255) caccacCGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcgtatttcagcggc > 1:1549782‑M2/1‑9 (MQ=255) accaccGAcgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaagcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcgtatttcagcggcg > 1:1696946‑M2/1‑8 (MQ=255) caccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCAc > 2:1805391/1‑150 (MQ=255) accGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCAcc > 1:704403/1‑150 (MQ=255) acgcattcgcgggtaaacccgctcctacagggccccgctaaatcaattgcttgtgtgttctcagccatccatccccgggtcgaacgggatgctctgcaccacctccagctcatagcccgccagccccgcgtatttcagcggcggccccag > 1:1755360‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGGGGCTGGCGGGCTATGAGCTGGAGGTGGTGCAGAGCATCCCGTTCGACCCGGGGATGGATGGCTGAGAACACACAAGCAATTGATTTAGCGGGGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGAGGGTGACACCACCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGCCCTTGGTGCTTTTGACAGGGCGGAGTGATGGCCGGTCGCCCCATACCTCTTGCCAAAATCTTGGAATACCATAATATGATATCCCGTAGACCTTGAGTCTGCAGGCCGGCACCTACA > NC_002947/4339992‑4340283 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |