New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4811898 | 47 (0.640) | 6 (0.090) | 6/218 | NT | 10.0% | coding (97/324 nt) | PP_4238 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4811958 | 67 (1.050) | coding (157/324 nt) | PP_4238 | hypothetical protein |
GCGCCGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGACGCAGGCC > NC_002947/4811827‑4812106 | gcgcCGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCAAGGCCAGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:1366901/1‑150 (MQ=255) gcCGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:249308/1‑150 (MQ=255) cGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 1:453011/1‑150 (MQ=255) cGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:35071/1‑150 (MQ=255) aGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:855238/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg < 1:63161/150‑1 (MQ=255) cAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAggg > 2:1325826/1‑150 (MQ=255) gCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCg < 1:73229/150‑1 (MQ=255) gACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGGTGACCCGCGAAAGGGCCggg > 2:437431/1‑149 (MQ=255) gTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACct > 2:1560396/1‑150 (MQ=255) ggggCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACct‑gc > 2:28759/1‑150 (MQ=255) ggCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCaa < 1:583199/150‑1 (MQ=255) cACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAAtt < 1:1530841/150‑1 (MQ=255) aCCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAAttt > 1:1375352/1‑150 (MQ=255) gCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACCGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTccac < 2:1038416/150‑1 (MQ=255) gCTACGCCGGTGTCCGCGGGTGAAACCGGTTCTCCGGGAATTGGGATCACGCGGTGGCTGTGCTCCATGCTCGGGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTccac < 2:1390825/150‑1 (MQ=12) gcgGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGtt < 2:249308/150‑1 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATAGCAAGGAATCCGTCGTCGGCCGTAGGAGCGGTGTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGtt < 1:235767/150‑1 (MQ=37) gggTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCACTGAGCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgc > 1:1207860/1‑150 (MQ=255) gTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtag > 1:1053637‑M2/1‑78 (MQ=255) gTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtag < 2:1053637‑M2/84‑7 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg > 1:1442356/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttcacggcgctcga < 2:1781952‑M2/150‑77 (MQ=255) aCCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccgc > 1:80573/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttcacggcgctcgat < 1:1509751‑M2/150‑78 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccgcc > 2:88025/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgc > 1:1366095/1‑146 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgc < 2:1366095/146‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccaccgcc > 1:876487/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCa > 2:1306762/1‑150 (MQ=255) cTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttcacggcgctcgatctgt > 1:1781952‑M2/1‑69 (MQ=255) cTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccaccgccctgg < 2:876487/150‑5 (MQ=255) tACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttca > 2:1300071‑M2/1‑65 (MQ=255) tACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttca < 1:1300071‑M2/131‑67 (MQ=255) tACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTAtt > 2:194571/1‑150 (MQ=255) cGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTcg > 2:439611/1‑150 (MQ=255) ggggCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCAGGGCCCGCGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCA‑GCTGGACACTTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTcgc < 2:760719/150‑1 (MQ=21) ggCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCgg < 1:28759/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCGATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTa > 2:1293172/1‑150 (MQ=255) gcgcTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTTCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTaaa > 2:1590939/1‑150 (MQ=255) cgcTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAAc > 1:852846/1‑150 (MQ=255) cgcTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAAc < 2:453011/150‑1 (MQ=255) cgcTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGCGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCCGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAAc < 2:1325356/150‑1 (MQ=255) gcTACCGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAAcc > 2:190043/1‑150 (MQ=255) tAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCg > 2:1266028/1‑150 (MQ=255) tAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCg > 1:1738208/1‑150 (MQ=255) tAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTAACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCg > 1:200047/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1325826/150‑1 (MQ=255) aCGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:1511671/1‑150 (MQ=255) aCGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGCTTTACCCGCGAAAGTGCCCGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:1467426/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg < 2:1658692/122‑1 (MQ=255) ggCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTgccgccg > 1:1658692/1‑122 (MQ=255) cTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:1573721/1‑150 (MQ=255) tGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:1324946/150‑1 (MQ=255) cgcCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTGCTACGCTGATCgg < 2:80573/150‑1 (MQ=255) gcCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCgg < 2:1268672/124‑1 (MQ=255) gcCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCgg > 1:1268672/1‑124 (MQ=255) gcCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGAGCCGGACCT‑GCTggccttgcgatcacgggcctggcgcaaaacccagccgttagcgcgagccccgtaggagcgggttcacccgcgaaca < 1:1008793‑M2/150‑77 (MQ=255) gcCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCACGAAAGGGCCGGACCA‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggg > 1:1760616/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCCGGGATCGCAATGCCCGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggg < 1:1240207/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCggggg > 2:1886599/1‑150 (MQ=255) aGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCgggggg > 1:1665574/1‑149 (MQ=255) ggCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTggccttgcgatcacgggcctggcgcaaaacccagccgttagcgc > 1:1721180‑M2/1‑70 (MQ=255) ggCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTggccttgcgatcacgggcctggcgcaaaacccagccgttagcgc < 2:1721180‑M2/114‑45 (MQ=255) cGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGgaga < 2:1375352/150‑1 (MQ=255) cGTAATCGCAAGACCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCCACCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGgaga < 1:1590939/150‑1 (MQ=17) gATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGacac < 1:1266028/150‑1 (MQ=255) aTCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGt > 1:536435/1‑141 (MQ=255) aTCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGt < 2:536435/141‑1 (MQ=255) gCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCTCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTg < 2:1253999/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCGGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTgg > 2:845657/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTgg > 1:27552/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTgg < 1:1496862/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCGGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTgg < 2:27552/150‑1 (MQ=255) gCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCACGAAAGGGCCGGACCA‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGAt < 2:1760616/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGAtt < 2:1738208/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGAtt < 2:1691607/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAAGGGCCGGACCGCGCAggccttgcgatcacgggcctggcgcaaaacccagccgttagcgcgagccccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgcc < 1:542588‑M2/150‑99 (MQ=255) tGCCCGGTCGGCCGTAGGGGCCGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCCGGCCACTTTCCACCAACCGTTCACAGTGGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTCATCGGGGGAGAAGCCACATGCGTGATTgg > 2:176604/1‑150 (MQ=17) gcgcGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGa > 1:847295/1‑150 (MQ=255) cgGTCGGccgtaggagcgggttcacccgcgaacaccggcgtagccggtgccatgccccacgtcgcctgcttcacggcgctcgatctgtgccccaccacatgcactagcgcctgcccagaatcttcccacgcatctccggccgtggtgccc > 2:1509751‑M2/1‑7 (MQ=255) tCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGc > 2:755065/1‑112 (MQ=255) tCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGc < 1:755065/112‑1 (MQ=255) tCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGACGc < 1:931317/147‑1 (MQ=255) tCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGACGc > 2:931317/1‑147 (MQ=255) ggCCGGAGGAGCTTGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGACGCAGGcc < 2:1665574/150‑1 (MQ=255) | GCGCCGTGAAGCAGGCGACGTGGGGCATGGCACCGGCTACGCCGGTGTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACGGGGCTCGCGCTAACGGCTGGGTTTTGCGCCAGGCCCGTGATCGCAAGGCCTGCGCGGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGACCT‑GCTGGCCAATTTCCACCAGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACTGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGATCGGGGGTGGAGACACATTGGTGATTGGACGCAGGCC > NC_002947/4811827‑4812106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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