New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5671666 = | 34 (0.470) | 11 (0.190) | 9/200 | NT | 26.1% | intergenic (+34/‑136) | PP_4978/PP_4979 | hypothetical protein/substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 5671751 = | 35 (0.600) | intergenic (+119/‑51) | PP_4978/PP_4979 | hypothetical protein/substrate‑binding protein |
GGCGCATCTGCTGCGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGC > NC_002947/5671602‑5671899 | ggCGCATCTGCTGCGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt < 1:1595834/150‑1 (MQ=255) tgctgcGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatg > 1:1801077/1‑150 (MQ=255) cGATCCACCCACGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCCGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGCGCAACCCGATCGTTGGCCCCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatgcatgc < 2:1690788/150‑1 (MQ=255) aCCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt < 1:601905/131‑1 (MQ=255) aCCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAt > 2:601905/1‑131 (MQ=255) aCCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTAc > 1:747292/1‑150 (MQ=255) cccAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTAcc < 2:747292/150‑1 (MQ=255) cAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGt > 2:1926556/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTa < 2:1582842/150‑1 (MQ=255) tGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCg < 1:1926556/150‑1 (MQ=255) tGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCg > 2:372671/1‑150 (MQ=255) tgCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGa < 1:1011344/150‑1 (MQ=255) cccGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAgc > 2:198612/1‑150 (MQ=255) aaaCTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTaa < 2:1694986/150‑1 (MQ=255) gTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGcc > 1:394591/1‑150 (MQ=255) tCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTCATCTCCGGCCa > 1:1154345/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATg > 2:1487215/1‑150 (MQ=255) gcgGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCcac > 2:450523/1‑150 (MQ=255) GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCg > 2:1801077‑M1/1‑150 (MQ=255) GGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGt < 1:1159393‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCt > 2:1167428‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTg < 2:1463564‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCCCGCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTc < 1:1591880‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatg < 2:864052‑M1/83‑1 (MQ=255) GCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAatg > 1:864052‑M1/1‑83 (MQ=255) CGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTg < 1:78017‑M1/150‑1 (MQ=255) CGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTg > 2:1159393‑M1/1‑150 (MQ=255) gcccgcgaacaccggcgaagccggtgccaacgatcgggttgctctcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTac < 2:614015‑M2/25‑1 (MQ=255) gcccgcgaacaccggcgaagccggtgccaacgatcgggttgctctcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTac > 1:614015‑M2/71‑95 (MQ=255) CCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATc > 1:1463564‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgccaacgatcgggttgctctcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc > 1:1017718‑M2/69‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgccaacgatcgggttgctctcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc > 1:1248‑M2/69‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcgaagccggtgccaacgatcgggttgctctcttcgcgggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc > 1:580105‑M2/69‑150 (MQ=255) CCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc < 2:343279‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc < 2:979561‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATcc < 2:600020‑M1/150‑1 (MQ=255) 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gtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCTGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCtt < 1:1054482/150‑1 (MQ=255) gtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCtt < 2:1156782/150‑1 (MQ=255) ggcacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTg < 1:372671‑M2/132‑1 (MQ=255) cacgcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGt < 2:78017‑M2/134‑1 (MQ=255) gcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaa > 2:1252240‑M2/14‑133 (MQ=255) gcccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGaa < 1:1252240‑M2/120‑1 (MQ=255) cccgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGGTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTGTGGGCGAACTCTTGCGCCTGGTAAcc > 1:428822‑M2/13‑150 (MQ=255) cgctcccacaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACcga < 2:297410‑M2/140‑1 (MQ=255) acaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTgg > 2:6563‑M2/4‑150 (MQ=255) acaTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTgg < 1:198612‑M2/147‑1 (MQ=255) tctCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTggg < 1:1384301/148‑1 (MQ=255) aTCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACtgggt > 1:1257375‑M2/2‑149 (MQ=255) | GGCGCATCTGCTGCGATCCACCCAAGCCTGATGTGCCCGCAAAACTCATTGTCTTGCGCGGTCTTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGAGCAACCCGATCGTTGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATCGATAATGCATGCCTTTACCGTACACCGGCCGAGCGCGTAATCTCCGGCCATGCCACATATCGCCCGTCTGTTCTGGATCCTGCTGCTCGTTTGCCTGAGCCCGTTGGCTCTGGGCGAACGCTTGCGCCTGGTAACCGACGACTGGGC > NC_002947/5671602‑5671899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |