| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,886,820 | C→G | 7.9% | W84C (TGG→TGC) | PP_5161 ← | lysophospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,886,820 | 0 | C | G | 7.9% | 273.4 / 12.9 | 88 | W84C (TGG→TGC) | PP_5161 | lysophospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/37); new base G (4/3); total (48/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
TCGCCGCTGGACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGCCAGGCGGGTGCGCAG > NC_002947/5886671‑5886969 | tCGCCGCTGGACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTTCTCGGGCAGc > 2:215151/1‑150 (MQ=255) gccgcTGGACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCa > 1:1134370/1‑150 (MQ=255) ccgcTGGACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAt < 1:111890/150‑1 (MQ=255) gACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAtgcctgc > 2:1058780/1‑150 (MQ=255) aGGTCGTGGCCGGGCAGTTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAt < 2:939783/141‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAt > 1:939783/1‑141 (MQ=255) ggCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGGCATGGCTGCCCGa < 2:181182/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGAc < 2:1458820/150‑1 (MQ=255) cGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGa < 2:642938/150‑1 (MQ=255) tggCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTAGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGaa > 2:1398952/2‑150 (MQ=255) gTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGGCATGGCTGCCCGa < 1:1122658/134‑1 (MQ=255) gTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGGCATGGCTGCCCGa > 2:1122658/1‑134 (MQ=255) tCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAtgc > 1:507468/1‑125 (MQ=255) tCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCAtgc < 2:507468/125‑1 (MQ=255) acaGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGc < 1:787437/150‑1 (MQ=255) acaGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGc < 1:154941/150‑1 (MQ=255) acaGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTAAATGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGc > 1:1322905/1‑150 (MQ=255) aGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCt > 2:216213/1‑150 (MQ=255) aGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCt > 2:1093589/1‑150 (MQ=255) gATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAACGTCGCGATTAGTTGCTCGCGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGaaa < 1:1494080/150‑1 (MQ=255) tCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGaa < 1:860296/133‑1 (MQ=255) tCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGaa > 2:860296/1‑133 (MQ=255) aCGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTa < 2:857618/150‑1 (MQ=255) cGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGACAGCTAc > 2:1085060/1‑150 (MQ=255) cGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTAc < 1:670435/150‑1 (MQ=255) ccTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCcagccagc > 2:445172/1‑150 (MQ=255) ccTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCcagccagc > 2:865160/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCACGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCt < 1:1683183/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATCGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCtgtgt > 1:850104/1‑150 (MQ=255) gAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGc < 1:865160/150‑1 (MQ=255) aGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGcc < 1:445172/150‑1 (MQ=255) gCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGc > 1:1180083/1‑150 (MQ=255) ccACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCtgt < 2:281754/140‑1 (MQ=255) ccACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCtgt > 1:281754/1‑140 (MQ=255) ccACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAg > 2:169070/1‑150 (MQ=255) aCTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGccc < 1:1072330/94‑1 (MQ=255) aCTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGccc > 2:1072330/1‑94 (MQ=255) aCTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCCCGAGCAGCCaagc > 2:152933/1‑85 (MQ=255) aCTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCCCGAGCAGCCAagc < 1:152933/88‑1 (MQ=255) gATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAg < 1:57375/150‑1 (MQ=255) gATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAg > 2:57375/1‑150 (MQ=255) tCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGc > 2:148789/1‑150 (MQ=255) aTGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCTCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATa < 2:1322905/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTAGGGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAg < 2:231548/150‑1 (MQ=255) tCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGaa < 1:783950/150‑1 (MQ=255) ggTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCGTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAgc > 1:1390372/1‑150 (MQ=255) ggTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAgc < 1:216213/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGGCATGGCTGCCCGagc < 2:743907/82‑3 (MQ=38) gTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGGCATGGCTGCCCGagc > 1:743907/1‑80 (MQ=39) gTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAgcg > 2:1602774/1‑150 (MQ=255) gTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAg > 1:1658744/1‑148 (MQ=255) gTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAg < 2:1658744/148‑1 (MQ=255) tAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAgcgc > 1:231494/1‑150 (MQ=255) agGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTgg < 1:148789/150‑1 (MQ=255) agGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGACTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTgg > 2:268135/1‑150 (MQ=255) gCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTa > 2:1074752/1‑150 (MQ=255) ccATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGt > 1:1866541/1‑150 (MQ=255) 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> 2:99580/1‑113 (MQ=255) aCAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAgcgc < 1:99580/113‑1 (MQ=255) aGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAgtg < 2:1105316/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTATTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAAc > 1:1553128/1‑150 (MQ=255) gttcgacctggtCGGGCAGGCATGGCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACg > 2:198791/8‑150 (MQ=255) ttGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGgcg > 2:1802521/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCAGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGgcg > 2:741234/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTCCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGcc > 1:1307079/1‑150 (MQ=255) tCGGGCAGGCATGGCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGCCAGGCgg > 2:1630511/1‑150 (MQ=255) tCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGtggctg > 2:566141/1‑125 (MQ=255) tCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGtggctg < 1:566141/125‑1 (MQ=255) tCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGCCAGGCgg > 2:1516483/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAgg < 2:768306/79‑1 (MQ=255) gggCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAgg > 1:768306/1‑79 (MQ=255) gggCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGTCTGGCGAgtg < 2:477636/130‑1 (MQ=255) gggCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAgtg > 1:477636/1‑130 (MQ=255) ccATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGCCAGGCGGGTGCGCAg < 2:1180083/150‑1 (MQ=255) | TCGCCGCTGGACAGGCCGTGGCCGGGCAGGTCACAGCTGATCACGGCGAAACCCTGCTTGAGTGCCCACTCGATCACATGTCGGTAGAGGCCCATGTGGTCGTAATAGCCGTGCAGCAGGAACAGCGTCGCGCTTGGCTGCTCGGGCAGCCATGCCTGCCCGACCAGGTCGAACCCCGCTGCCTGAAAGCTACCCAGCCAGCTGTGTGCCGGCAGGTTCAGGCCATAGAAGCGCTGGTAGTCCTGCGCTTGTGCCGACAGTGGCTGGCGAGTGGTGAACGGCGCCAGGCGGGTGCGCAG > NC_002947/5886671‑5886969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |