Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 415,540 | T→C | 5.6% | L102S (TTG→TCG) | waaC → | ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 415,540 | 0 | T | C | 5.6% | 207.0 / 2.4 | 71 | L102S (TTG→TCG) | waaC | ADP‑heptose‑‑LPS heptosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/34); new base C (2/2); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.10e-01 |
CCAGGTCATCCCGGTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATGGCCCTGG > NC_002947/415391‑415689 | ccAGGTCATCCCGGTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTTAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGtt > 1:436653/1‑150 (MQ=255) ggTCATCCCGGTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGAc < 1:1856243/150‑1 (MQ=255) gTCATCCCGGTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGAcc > 2:668727/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGt < 2:273618/150‑1 (MQ=255) ggCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCACGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGATTAAACCGTTagctcaa < 2:1529007/150‑7 (MQ=255) gcAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGcc > 1:870308/1‑150 (MQ=255) gcAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCATTCAATAATGGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGACTCTAGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGcc > 1:1321015/1‑150 (MQ=255) cAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCt < 1:1656469/150‑1 (MQ=255) gAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACCCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGa > 2:201424/1‑150 (MQ=255) gAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAACGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGa < 1:31380/150‑1 (MQ=255) aCCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑c < 1:82461/132‑1 (MQ=255) aCCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑c > 2:82461/1‑132 (MQ=255) gCAAACCATCAAGAGAGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTc > 2:1041551/1‑150 (MQ=255) ccATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑c < 1:365420/120‑1 (MQ=255) ccATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑c > 2:365420/1‑120 (MQ=255) aaGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGaa > 1:1038548/1‑150 (MQ=255) gTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCt > 1:848191/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTg > 2:1637548/1‑150 (MQ=255) ggCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGAACTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTgg < 1:1391327/150‑1 (MQ=255) tGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCGAGc > 1:653769/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGGACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCg > 1:535899/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGc < 2:878849/150‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTCGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGc > 1:1757941/1‑120 (MQ=255) aaGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTCGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGc > 1:1757804/1‑120 (MQ=255) aaGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTCGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGc < 2:1757804/120‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTCGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGc < 2:1757941/120‑1 (MQ=255) aGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCt > 1:1727959/1‑150 (MQ=255) gCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTAAAGGC‑‑A‑CCCGTACCCGGCCGGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTc > 1:785391/1‑150 (MQ=255) gTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTa > 1:659144/1‑150 (MQ=255) gTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTa > 2:664994/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTAcgac < 2:848191/150‑1 (MQ=255) gcagcGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCNGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCAGCCCGTGTCCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTAcgaccg > 1:119584/1‑150 (MQ=255) gcagcGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTAcgaccg > 1:107485/1‑150 (MQ=255) agcGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTAcgaccgac < 1:668727/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACgaccgacc > 2:1500670/1‑150 (MQ=255) tGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGt < 2:659144/150‑1 (MQ=255) gcgAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCgg < 1:363236/150‑1 (MQ=255) cgAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGcc < 1:265858/125‑1 (MQ=255) cgAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGcc > 2:265858/1‑125 (MQ=255) gcaaccaCGACCCTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCCGATTG‑CCCAT‑‑CCTGATGCCTAATAATCTAGCCGTCCTCCATTGCTACTCGGCACGCGAAGGCTGGGCCAGCGGCTTCTACGACCGACCTCCGTCGGTTGCCa < 1:1407539/144‑1 (MQ=255) gcAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCa < 1:1637548/150‑1 (MQ=255) cAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTCGCCAc < 1:1041551/150‑1 (MQ=255) aaGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTg > 1:1631314/1‑84 (MQ=255) aaGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTg < 2:1631314/84‑1 (MQ=255) aaGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCAcc < 1:867026/150‑1 (MQ=255) tACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGc > 1:216743/1‑150 (MQ=255) tACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGc < 2:436653/150‑1 (MQ=255) cTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCAc > 1:1783104/1‑150 (MQ=255) ttGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGG‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCAcg > 1:297256/1‑150 (MQ=255) tCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTgg > 1:1203611/1‑150 (MQ=255) gACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCCTGCACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAg > 1:1180758/1‑150 (MQ=255) gACGCACAGGGACTAATCCAGTCTTCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAg < 2:1321015/150‑1 (MQ=255) cGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCTAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCg < 1:535199/150‑1 (MQ=255) cccAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCAACGGCCTCCACGGGGTGTAGCtgg < 2:1443045/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGt > 1:378035/2‑150 (MQ=255) ccAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGCAg < 1:1734965/83‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAg > 2:1734965/1‑83 (MQ=255) ggCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGc > 1:870512/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGcc < 2:216743/150‑1 (MQ=255) aggTCGGCCTGGTTGGCCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTCCGACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTAAGCCAACTGttt < 2:297256/148‑1 (MQ=255) aaGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCTACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGttt > 2:1431626/1‑150 (MQ=255) aaGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGttt < 1:664994/150‑1 (MQ=255) aaGTCGCCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CGCTTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAATGCTGGGCCAGCCGCTTCTACTACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGttt < 1:201424/150‑1 (MQ=255) aGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTg < 2:1716415/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGttt < 1:695726/147‑1 (MQ=255) tCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGttt > 2:695726/1‑147 (MQ=255) cGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCa < 2:870512/150‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCa < 2:107485/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATgg < 1:1500670/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATgg < 2:870308/150‑1 (MQ=255) tGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATGGcc > 2:859136/1‑150 (MQ=255) gTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCGGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATGGCCCt > 2:1756748/1‑150 (MQ=255) tGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCGGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATGGCCCTgg < 1:1756748/150‑1 (MQ=255) | CCAGGTCATCCCGGTGGCGATCCGTCGCTGGCGCAAGAACCTCTGGCAAACCATCAAGAGTGGCGAGTGGAAGGCGTTCAAGCAGCGCGTGCGCGAGCGCAAGTACGACCTTGTGATCGACGCCCAGGGCCTGGTCAAGTCGGCCTGGTTGACCCGTTACGTGAAGGC‑‑A‑CCCGTAGCCGGCCTGGACCGCTACTCGGCGCGCGAAGGCTGGGCCAGCCGCTTCTACGACCGACCTCTGTCGGTTGCCACCGGCCAGCACGCGGTGGAGCGGGTACGCCAACTGTTTGCCATGGCCCTGG > NC_002947/415391‑415689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |