Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 460,473 | T→C | 5.7% | A665A (GCA→GCG) | pqqF ← | coenzyme PQQ synthesis protein F |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 460,473 | 0 | T | C | 5.7% | 207.0 / 2.4 | 70 | A665A (GCA→GCG) | pqqF | coenzyme PQQ synthesis protein F |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/36); new base C (2/2); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.66e-01 |
TGTGGCCAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGCTAACAGGCG > NC_002947/460326‑460622 | tgtgGCCAAGTGTGTCTGGCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCTAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGc < 2:157660/150‑1 (MQ=255) tgtgGCCAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGc < 2:863403/150‑1 (MQ=255) ccAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCGGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGa < 2:1245026/149‑1 (MQ=255) ccAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCGCCTGTGCCTGAt > 1:1298915/1‑150 (MQ=255) ccAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGa > 1:1245026/1‑149 (MQ=255) cAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATc > 2:1023135/1‑150 (MQ=255) gtgtGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGCGCCTGATCGGTGTgg > 1:1935594/4‑150 (MQ=255) tGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTggggg < 2:1285684/150‑1 (MQ=255) gCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTgggggg > 2:1297808/1‑150 (MQ=255) cGCTCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTGGTCGAATTGCCCAGCCAATGTCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGGAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCAACTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTg < 2:802044/150‑1 (MQ=255) gCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGc > 1:318027/1‑128 (MQ=255) gCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGc < 2:318027/128‑1 (MQ=255) cATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTGAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAAcagca < 1:1484234/150‑1 (MQ=255) cATCGGCAGTGGCCATGGTGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCGGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGATCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAAcagca < 1:15831/150‑1 (MQ=255) ggCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGccc > 1:1248233/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCa > 1:3378/1‑150 (MQ=255) cATAGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATGGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCAc < 1:478213/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGCGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGcccccc < 2:1935594/150‑1 (MQ=255) tcgtcgAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGa < 1:1122327/150‑1 (MQ=255) tcgAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGa > 2:1466857/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGgcgc < 2:1258615/150‑1 (MQ=255) cccAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCt > 1:496319/1‑150 (MQ=255) cccAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCt > 1:106647/1‑150 (MQ=255) cAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCACGGGGGACGCCATGGGGCAGCAGGCTGAGCACGTGGTCGAGGACCTGTGCCTGAACGGTGTGGGGGGGTTGCACGCCGAACCGCAGCCCACCGACGCCCTCGACCTGGAGAAAGGCGCTgc > 2:456531/1‑149 (MQ=255) cAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGc < 2:553912/105‑1 (MQ=255) cAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGc > 1:553912/1‑105 (MQ=255) aGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGaa > 1:1117577/1‑150 (MQ=255) cAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAacac > 2:625926/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAg < 1:1023135/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAg < 1:1008987/150‑1 (MQ=255) gCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCGGACGAAACGCGATGAACACCGGCTAGca > 2:1288525/1‑149 (MQ=255) gAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAGCAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGa < 2:1255571/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGCGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCt > 1:1362863/1‑120 (MQ=255) gAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGCGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCt < 2:1362863/120‑1 (MQ=255) agaggacGGGTCTAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGTGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAg < 2:515183/144‑1 (MQ=255) gCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGaa > 2:915561/1‑92 (MQ=255) gCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGaa > 2:916159/1‑92 (MQ=255) gCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGaa < 1:916159/92‑1 (MQ=255) gCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGaa < 1:915561/92‑1 (MQ=255) gCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCACGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGt < 1:8821/150‑1 (MQ=255) cGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGtt < 2:1117577/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGc > 2:496573/1‑150 (MQ=255) cGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCaa < 1:1420343/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGt < 1:625926/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGt < 1:1297808/150‑1 (MQ=255) aaGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGAtt > 1:1266107/1‑71 (MQ=255) aaGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGAtt < 2:1266107/71‑1 (MQ=255) aaGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGAc > 1:1229578/1‑105 (MQ=255) aaGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGAc < 2:1229578/105‑1 (MQ=255) aGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTAcc < 2:1248233/150‑1 (MQ=255) gACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAg < 1:496573/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGa < 2:282618/126‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGa > 1:282618/1‑126 (MQ=255) aTGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTg < 1:1497495/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTg > 2:783893/1‑150 (MQ=255) ggTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGt < 1:1732995/116‑1 (MQ=255) ggTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGt > 2:1732995/1‑116 (MQ=255) gtggtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGCCCCCCTCGCCCTGACGAACGGCGCTGAACACCGCTGAGCCGATTCTCAATTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCaa > 2:218197/1‑150 (MQ=255) gtggtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACAcc > 2:1923336/1‑94 (MQ=255) gtggtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACAcc < 1:1923336/94‑1 (MQ=255) gtggtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCaa > 1:317703/1‑150 (MQ=255) gtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAgg > 2:979203/1‑121 (MQ=255) gtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAgg < 1:979203/121‑1 (MQ=255) gtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCgg < 2:655641/135‑1 (MQ=255) gtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCgg > 1:655641/1‑135 (MQ=255) gtCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTg < 2:3378/150‑1 (MQ=255) tCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTgg > 2:1535804/1‑150 (MQ=255) gAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGc > 1:1783487/1‑150 (MQ=255) cACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGCTaa < 2:496319/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGCTAACAg < 1:1466857/150‑1 (MQ=255) tgCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACGCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGCTAACAggcg < 2:1298915/150‑1 (MQ=255) | TGTGGCCAAGTGTGTCTGCCACGCCCATTCGGCGACATCGGCATTGGCCATGGCGGGCTCGTCGAATTGCCCAGCCAATGCCTGGCGAGCGGCCGGGTCAAGGGTGACGCCATGGCGCAGCAGGTTGAGCAGGTGGTCGAGCACCTGTGCCTGATCGGTGTGGGGGGATTGCACGCCGAACAGCAGCCCACCGACCCCCTCGACCTGACGAAAGGCGCTGAACACCGCGTAGCCGAGTTGCAAGTCTACCCGCAGGCGCTGGTAAACCGGCCCTTGCAGCAATTGGGCTAACAGGCG > NC_002947/460326‑460622 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |