Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 593,437 | A→C | 6.4% | E391A (GAG→GCG) ‡ | PP_0503 → | MFS transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 593,437 | 0 | A | C | 6.4% | 222.3 / 5.2 | 78 | E391A (GAG→GCG) ‡ | PP_0503 | MFS transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/38); new base C (2/3); total (37/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 |
TTGCTATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGTGTCGATGTCGA > NC_002947/593288‑593577 | ttGCTATTCGCCGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGa < 2:137912/150‑1 (MQ=255) cTATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCACCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGgc > 2:1462023/1‑150 (MQ=255) aTTCGCTGTGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGgccg > 2:1449634/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCTCGGCCGccc < 1:1154118/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc < 1:1201424/150‑1 (MQ=255) gCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCt > 2:1938651/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCACCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTg < 1:1462023/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAAt > 1:1548523/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAAt < 1:146719/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGt < 1:1417256/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGt > 1:637068/1‑150 (MQ=255) gTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTccg > 1:1645587/1‑148 (MQ=255) gTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAg < 2:988105/150‑1 (MQ=255) tttGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAgg < 1:60088/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACtt < 2:1318780/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCaa < 2:1645587/150‑1 (MQ=255) aGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAga < 1:1449634/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCt < 2:369768/118‑1 (MQ=255) gCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCt > 1:369768/1‑118 (MQ=255) tGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACtt < 2:869196/137‑1 (MQ=255) tGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACtt > 1:869196/1‑137 (MQ=255) tGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAg < 1:548690/141‑1 (MQ=255) tGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAg > 2:548690/1‑141 (MQ=255) ggTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAgaccgac < 1:1787732/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAgaccgac > 2:1219456/1‑150 (MQ=255) ggTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAgaccgac < 1:73320/150‑1 (MQ=255) tgtTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCa > 2:1177054/1‑150 (MQ=255) tgtTTGCACACTGGGGCTGGGTAGCGGTGTGTGGGCTTGGCAGGGGCATCAGTGCCGACGCACTGTCCCGCGAGCAGTGGCAGCAAGCCGCTACCGCCGCCGATGCCACGCTCCAAGGCTCGGGACACAGCTTGTACCGAAGCGCGACCa > 2:796287/1‑150 (MQ=255) ttGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGt < 1:1219456/150‑1 (MQ=255) acacTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc < 2:1446939/104‑1 (MQ=255) acacTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc > 1:1446939/1‑104 (MQ=255) acacTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATAc > 2:111926/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAg > 2:1733693/1‑93 (MQ=255) tGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAg < 1:1733693/93‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCAc > 1:757537/1‑150 (MQ=255) cTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAgg > 1:1216445/1‑89 (MQ=255) cTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAgg < 2:1216445/89‑1 (MQ=255) tGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcg > 2:625750/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacg < 2:493801/150‑1 (MQ=255) ttGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgt > 1:889809/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgt > 1:1904618/1‑150 (MQ=255) ggTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCa > 1:1823683/1‑102 (MQ=255) ggTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCa < 2:1823683/102‑1 (MQ=255) ggTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgac < 1:1708817/150‑1 (MQ=255) gtgtgtGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgac < 1:1727779/143‑1 (MQ=255) gtgtgtGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgac > 2:1727779/1‑143 (MQ=255) tgtgGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgacgtcg > 2:1454821/1‑150 (MQ=255) tgGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcgacgtcgac < 1:521748/150‑1 (MQ=255) gggCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGAcc < 2:1548523/150‑1 (MQ=255) gCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGTGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCtt > 1:1453829/1‑150 (MQ=255) aTGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc > 1:1632953/1‑70 (MQ=255) aTGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGccc < 2:1632953/70‑1 (MQ=255) aTGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTg < 1:625750/150‑1 (MQ=255) ggCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACggg < 2:59208/120‑1 (MQ=255) ggCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACggg > 1:59208/1‑120 (MQ=255) gcACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTc > 2:291836/1‑150 (MQ=255) cTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCggg < 1:1185535/150‑1 (MQ=255) gCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGt < 1:1454821/150‑1 (MQ=255) tACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTg > 1:1093978/1‑150 (MQ=255) tACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTg > 1:635615/1‑150 (MQ=255) aCTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCaa < 2:1621017/132‑1 (MQ=255) aCTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCaa > 1:1621017/1‑132 (MQ=255) tGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCaa > 1:772967/1‑70 (MQ=255) tGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCaa < 2:772967/70‑1 (MQ=255) cTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGTCGAGGCCGTCCTGCAACGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGCCGTCCACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTCGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTg < 2:1459826/150‑1 (MQ=255) cTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTg < 2:889809/150‑1 (MQ=255) tATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGc > 1:1331096/1‑117 (MQ=255) tATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGc < 2:1331096/117‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCATGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGAACTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCAGTCGGGCCGTTGACGCTGGc > 2:1365297/1‑150 (MQ=255) ttccaccgcccgAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCNTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTg < 1:796287/144‑1 (MQ=255) gcgcgAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGtgtcga < 1:1938651/150‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcga > 1:767656/1‑82 (MQ=255) aGGGCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGgtcgacgtcga < 2:767656/82‑1 (MQ=255) gggCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGtgtcgatgtcga > 1:670829/1‑150 (MQ=255) gggCGGCCTCGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGagtcgatgtcga < 2:670829/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTg > 1:1673646/1‑86 (MQ=255) ccGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTg < 2:1673646/86‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCt < 2:521130/124‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCt > 1:521130/1‑124 (MQ=255) | TTGCTATTCGCTGGGCAGCGGTTTGGGGGCGGTGTTGGCGAGCTGGGTGTTTGCACACTGGGGCTGGGTTGCGGTGTGTGGGCTTGGCATGGGCATCAGTGCCGCCGCACTGTGCTACTGGCTATGGCTGCAACGCGCGAGGGCGGCCGAGGCCGCCCTGCAATGTTCAGGTCAGAACTTGTAGCCAAGACCGACCATGTATACCCACGGGTCGACGTCGACGTCGACCTTGGTCTTGCTGTAGCCAAGGGCGGTCGGGCCGTTGACGCTGGCCTTGGTGTCGATGTCGA > NC_002947/593288‑593577 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |