| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 609,782 | A→C | 5.3% | L356R (CTG→CGG) | PP_0525 ← | B12 family TonB‑dependent receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 609,782 | 0 | A | C | 5.3% | 220.0 / 4.6 | 76 | L356R (CTG→CGG) | PP_0525 | B12 family TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/33); new base C (2/2); total (41/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.25e-01 | |||||||||||
GATTCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGAGTGCTCCACTGCTCG > NC_002947/609633‑609931 | gATTCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAAcagca < 2:770895/150‑1 (MQ=255)gATTCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAAcagca < 2:1368703/150‑1 (MQ=255) ttCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAgg < 1:748541/150‑1 (MQ=255) tCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGc > 1:719298/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCtgtt < 2:800783/150‑1 (MQ=255) tGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTgtgt < 1:985237/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCCCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAg > 2:1159550/1‑150 (MQ=255) cAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAggg > 2:653699/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAg < 2:1484530/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAg > 1:1484530/1‑150 (MQ=255) gagtgaaaGTATTCGTCATGAAAGCGTTGCTGGACGAAAAGCGCATGAGTCAAGCGTCTGTATTCCGTAAAATCCTCACGCACATGGACACGGTCTTCTTACCAGTCGCTCCCCAACAGCAGGCTGTTATTTTAACCCAGGGCTAGgttg > 2:34700/6‑150 (MQ=255) gtAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGgttgtt > 2:1587345/1‑150 (MQ=255) aaGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGAGGCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAAGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGc > 2:1574043/1‑150 (MQ=255) tCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGtt < 1:1529695/150‑1 (MQ=255) gTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGc > 2:1454159/1‑150 (MQ=255) gTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGc < 1:167718/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCCTGCtgttgggt > 2:389782/1‑114 (MQ=255) tCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCCTGCTGTTgggt < 1:389782/117‑1 (MQ=255) cATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCCCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCtt < 1:1159550/150‑1 (MQ=255) aaaGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCt < 2:1307827/134‑1 (MQ=255) aaaGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCt > 1:1307827/1‑134 (MQ=255) cGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGc < 1:1751565/119‑1 (MQ=255) cGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGc > 2:1751565/1‑119 (MQ=255) gATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCggt > 1:988533/1‑150 (MQ=255) tGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCCTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCggtag < 1:215828/150‑1 (MQ=255) ggACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTc < 2:1360416/139‑1 (MQ=255) ggACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTc > 1:1360416/1‑139 (MQ=255) gACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTcgcg < 2:1097633/141‑1 (MQ=255) gACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTcgcg > 1:1097633/1‑141 (MQ=255) aaCAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGaaa > 1:1564031/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCATGATTCCAGCTGATGTTTTCCGTGAACCCCGCACTCGAATGGACACGGTCTCCGTAACTGAGTTTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAg < 1:34700/150‑1 (MQ=255) aGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGt < 2:1564031/150‑1 (MQ=255) gcATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTgcg > 2:78752/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAg > 1:1017797/1‑139 (MQ=255) ttCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAg < 2:1017797/139‑1 (MQ=255) ttCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACATCCACCCGAGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAg > 1:19992/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGt < 1:1587345/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTg < 1:116788/150‑1 (MQ=255) cTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACGAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGc > 2:377855/1‑150 (MQ=255) gTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACATGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCtt < 2:322928/150‑1 (MQ=255) gTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCtt > 1:625288/1‑150 (MQ=255) gTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCtt < 2:625288/150‑1 (MQ=255) gTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCtt < 2:719298/150‑1 (MQ=255) ttCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGtc > 2:522023/1‑150 (MQ=255) ttCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGtc < 1:78752/150‑1 (MQ=255) tCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGtct > 1:834595/1‑150 (MQ=255) cGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAgg > 2:633229/1‑82 (MQ=255) cGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAgg < 1:633229/82‑1 (MQ=255) cGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTAt < 1:1327988/116‑1 (MQ=255) cGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTAt > 2:1327988/1‑116 (MQ=255) cTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGa < 2:1243401/131‑1 (MQ=255) cTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGa > 1:1243401/1‑131 (MQ=255) tCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCAGTTTTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTGTTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATcg > 1:49505/1‑150 (MQ=255) tCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGt > 1:327040/1‑150 (MQ=255) gCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGttt > 1:30868/1‑150 (MQ=255) gCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGttt > 2:643383/1‑150 (MQ=255) gCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGttt > 2:453691/1‑150 (MQ=255) gACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGGTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCt > 1:1571112/1‑150 (MQ=255) acGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATcgcg > 1:474392/1‑138 (MQ=255) acGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATcgcg < 2:474392/138‑1 (MQ=255) cGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCagttt < 1:67698/150‑3 (MQ=255) ggTGTTCTTACCAGTCGCTGCCCAAGAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCCGGGCTATGTTGTTCTGCCAAGTGGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGGTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTGGCtgtgtg < 2:39465/150‑3 (MQ=255) ggTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTggg > 1:1141029/1‑150 (MQ=255) ggTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTggg > 1:1875182/1‑150 (MQ=255) ttCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAg > 1:1336360/1‑150 (MQ=255) gTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGt < 2:1518071/101‑1 (MQ=255) gTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGt > 1:1518071/1‑101 (MQ=255) tACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTACTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGGTTTCGCTGTGGGCCAGCTCa > 1:825080/1‑150 (MQ=255) tACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGATAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGTTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGGCAGCTCa > 2:128566/1‑150 (MQ=255) ccAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCaaa < 2:834595/150‑1 (MQ=255) cAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATcgc < 1:1681447/124‑1 (MQ=255) cAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATcgc > 2:1681447/1‑124 (MQ=255) cAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAAc > 1:1840722/1‑150 (MQ=255) cAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAAc < 1:643383/150‑1 (MQ=255) tCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGa < 2:327040/150‑1 (MQ=255) cacAACAGCCTGCTGTTGGGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCtgt < 1:1694602/125‑1 (MQ=255) cacAACAGCCTGCTGTTGGGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCtgt > 2:1694602/3‑127 (MQ=255) aaCAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGAGTGCTCCAc < 1:1454159/150‑1 (MQ=255) agGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGAGTGCTCCACTGCTCg < 1:653699/150‑1 (MQ=255) agGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGAGTGCTCCACTGCTCg > 2:1091800/1‑150 (MQ=255) | GATTCTTGTCGTGGCGCAGGCCAAGCTCGGTGTAAAAGTATTCGTCATGAAAGCGATGCTGGACGAACAGCGCATGATTCCAGCGGCTGTCTTCCGTGAAGTCCTCACTCGCATGGACACGGTCTTCGTACCAGTCGCTACCCAACAGCAGGCTGTTGTGTTCACCCAGGGCTAGGTTGTTCTGCCAAGTTGCTTGGTCGCGGTAGGTATTGAAAGGTGCGCTTGAGTGGCTGAGCTTGTCTCGGCTTTCATCGCGGTTTTCGCTGTGGGCCAGCTCAAACCGAGTGCTCCACTGCTCG > NC_002947/609633‑609931 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |