Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 978,168 | G→A | 5.8% | R51H (CGC→CAC) | iscR → | DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 978,168 | 0 | G | A | 5.8% | 201.7 / 2.2 | 69 | R51H (CGC→CAC) | iscR | DNA‑binding transcriptional regulator IscR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base A (2/2); total (35/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.97e-01 |
TGACTACCAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCG > NC_002947/978024‑978317 | tgactACCAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTGCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCgcagca < 2:466571/150‑1 (MQ=255) aCCAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTg < 2:871576/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCt > 1:1045222/1‑148 (MQ=255) ccAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCt < 2:1045222/148‑1 (MQ=255) cAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGt > 1:103292/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGt > 2:1633931/1‑150 (MQ=255) cAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGt < 1:1900655/150‑1 (MQ=255) cAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCAGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCACAGCAGCCTGGt > 1:1690064/1‑150 (MQ=255) gccattACGCCGTGAACGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACCCGAAGCATGGGCCTGTGTCTTTGCCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATGTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCa < 1:1447744/145‑1 (MQ=255) gCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCa < 2:528068/150‑1 (MQ=255) gCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCa < 2:1429079/150‑1 (MQ=255) cGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAgt < 1:929529/150‑1 (MQ=255) aTACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCACAGCAGCCTGGTTTCCAgtgt < 2:1690064/150‑1 (MQ=255) ccGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGcgcg < 2:1325862/150‑1 (MQ=255) gACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTcc > 2:1234852/1‑150 (MQ=255) ccGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCGCTCTTATCTGGAGCAGCGGTTCGCCAACCTGCGCCGCAGCAGCCTGGCTTCCAGTTTCCGCGGtgacg > 2:891734/1‑146 (MQ=255) caaTGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCg > 2:867299/3‑150 (MQ=255) cATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCgg > 1:1422368/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGt < 1:1102187/150‑1 (MQ=255) aTGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGt < 1:1940956/150‑1 (MQ=255) tggtCGACCTGGTGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGATCTCTGTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAAGGCCTTTCCCTCTCATATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTg < 1:18584/147‑1 (MQ=255) cTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTGTCTTATCTGGAGCAGCTGTCCGTCCCCATGCGGGGCAACAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGc > 1:1398800/1‑150 (MQ=255) cTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGc > 2:1053557/1‑150 (MQ=255) cTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCACAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGc > 1:1343225/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTAcc > 1:330018/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCa > 1:1703782/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGttt < 1:583505/118‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGttt > 2:583505/1‑118 (MQ=255) cTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAg < 2:1415490/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTg > 1:218854/1‑150 (MQ=255) cGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGt < 1:928621/150‑1 (MQ=255) aCGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGGCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTATCTTATTTGGAGCAGCTGTTCGCGACGGTGCACCGGAAAAGCCTGGTTTCAAGAGCTCGCGGGCGAGGCGGTTGCTTCACGCTGTcacgtg > 2:550251/1‑148 (MQ=255) cgAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCa < 1:372422/150‑1 (MQ=255) gAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCAt > 1:379815/1‑150 (MQ=255) gAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCAt < 2:103292/150‑1 (MQ=255) aaGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATg < 2:330018/150‑1 (MQ=255) cATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCACAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGaa < 2:1343225/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCAt < 2:1586241/150‑1 (MQ=255) gtgtCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTg < 2:336231/115‑1 (MQ=255) gtgtCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTg > 1:336231/1‑115 (MQ=255) tgtCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAgg < 1:867299/150‑1 (MQ=255) gCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAg < 2:628670/150‑1 (MQ=255) gCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAg > 2:1448874/1‑150 (MQ=255) cagctatCTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCGCTCTCATCTTGAGCAGCTGCCCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCCGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAgg < 1:891734/146‑1 (MQ=255) cGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGt > 1:1738409/1‑150 (MQ=255) cGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGt > 2:1768367/1‑150 (MQ=255) cAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAAc < 1:1448874/150‑1 (MQ=255) cAGGGCATTTCCCTCTCTTATATGGAGCAGCTGTTCGCTAAGCTGCGCCGCAGAAGCATGGTTTCGAGTGTGCGCGGTCCAGACGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACTTTCCAGGTGGCCCCGGTTATCGACGCGGTaaaa > 2:274423/1‑149 (MQ=255) aGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACg > 1:106596/1‑150 (MQ=255) ggCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGaa > 2:1216568/1‑150 (MQ=255) gCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAAt < 2:1201642/150‑1 (MQ=255) aTTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCgg < 1:1365482/99‑1 (MQ=255) aTTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCgg > 2:1365482/1‑99 (MQ=255) aTTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCg < 1:1633931/150‑1 (MQ=255) ccTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGa > 1:258006/1‑150 (MQ=255) ccTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGa > 1:1061727/1‑150 (MQ=255) ctTATCTGGAGCCGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCACCAGTATGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCa < 2:1859204/150‑1 (MQ=255) ttATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCAc > 2:192967/1‑150 (MQ=255) ttATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGACATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCAc > 2:251032/1‑150 (MQ=255) gcagcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTAc < 2:332553/67‑1 (MQ=255) gcagcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTAc > 1:332553/1‑67 (MQ=255) gcagcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAg < 2:1500404/106‑1 (MQ=255) gcagcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAg > 1:1500404/1‑106 (MQ=255) agcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAgg < 2:1422368/150‑1 (MQ=255) agcTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTCATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAgg > 2:245935/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATcc < 1:1195046/85‑1 (MQ=255) gCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATcc > 2:1195046/1‑85 (MQ=255) gCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGt > 1:1004883/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGAcgcg > 1:1258766/1‑102 (MQ=255) cTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTCGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGAcgcg < 2:1258766/102‑1 (MQ=255) cgccgcAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCAt < 2:1738409/150‑1 (MQ=255) gccgcAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATg < 2:1004883/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGcc < 1:1768367/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTCATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGcc < 1:245935/150‑1 (MQ=255) gcagcaGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCg > 1:57741/1‑150 (MQ=255) | TGACTACCAAAGGCCGATACGCCGTGACCGCCATGCTCGACCTGGCGTTGCACGCGAAGCATGGGCCGGTGTCTTTGGCCGATATTTCCGAGCGCCAGGGCATTTCCCTCTCTTATCTGGAGCAGCTGTTCGCCAAGCTGCGCCGCAGCAGCCTGGTTTCCAGTGTGCGCGGTCCAGGCGGTGGCTACCAGCTGTCGCGGGGCATGGAAACCATCCAGGTGGCCCAGGTTATCGACGCGGTCAACGAATCGGTCGACGCCACCCGCTGCCAGGGGCTCGGTGACTGCCATGCCG > NC_002947/978024‑978317 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |