Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 87,493 | T→A | 7.5% | N98I (AAT→ATT) | PP_0076 ← | choline betaine‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 87,493 | 0 | T | A | 7.5% | 247.4 / 10.5 | 80 | N98I (AAT→ATT) | PP_0076 | choline betaine‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/34); new base A (3/3); total (43/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.34e-01 |
GATTCCGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTAACAGG > NC_002947/87348‑87642 | gATTCCGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGc < 1:1331748/150‑1 (MQ=255) tCCGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGAt < 1:620792/150‑1 (MQ=255) tCCGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGAt < 2:726011/150‑1 (MQ=255) cGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGTGCACTGCGAGGTTGAACTCGGTTCCCTCCAAGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGa > 1:778366/1‑150 (MQ=255) aGTTTTTTGTCAAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTg > 2:1042730/1‑150 (MQ=255) tttttGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCa < 2:678395/150‑1 (MQ=255) cGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGc < 2:1524263/150‑1 (MQ=255) gAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGcc > 1:1528981/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTtgct < 2:1139536/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTgcgc > 1:1586535/1‑150 (MQ=255) ttttGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATc > 1:1924496/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGt < 1:1042730/150‑1 (MQ=255) cAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGaa < 1:1397416/126‑1 (MQ=255) cAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGaa > 2:1397416/1‑126 (MQ=255) aGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGttt > 1:601527/1‑150 (MQ=255) gTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTc < 2:67963/117‑1 (MQ=255) gTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTc > 1:67963/1‑117 (MQ=255) aGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAg > 2:1015224/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAg > 2:946394/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAg > 1:1801880/1‑150 (MQ=255) gAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGaa < 2:1801880/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGc > 2:1347695/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGc < 2:1503036/150‑1 (MQ=255) tCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGa > 2:705664/1‑142 (MQ=255) tCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGa < 1:705664/142‑1 (MQ=255) ccTTCACCCTGGTATTCCACACATAGTCGCGCACTGCGAGGGTCCACCCGGTTCCCTGCAGTTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGGCTAACTTGCCATGGAAGCCTTGCTGCGCCCCGATCCAGTTTCCGAGGAATGCGt < 2:778366/150‑1 (MQ=255) ccTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGt > 2:119199/1‑150 (MQ=255) cTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCAATGGCGATgtg < 1:1495232/99‑3 (MQ=255) cTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCAATGGCGATgtg < 1:1806768/99‑3 (MQ=255) cTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCAATGGCGATgtg > 2:1806768/1‑97 (MQ=255) cTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCAATGGCGATgcg > 2:1495232/1‑97 (MQ=255) cACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGAc < 2:1586535/150‑1 (MQ=255) aCCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGATCTCGGTTCCCTCCATGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGAcc > 1:1847665/1‑150 (MQ=255) cccGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTg > 2:16203/1‑150 (MQ=255) aTTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTc > 1:70855/1‑150 (MQ=255) acacaTAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGa < 2:70855/150‑1 (MQ=255) acaTAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAg < 2:1810081/149‑1 (MQ=255) acaTAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAg > 1:1810081/1‑149 (MQ=255) aTAGTCGGGCACTGCGCGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGgcc > 1:1701147/1‑150 (MQ=255) aTAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGgcc > 1:1709584/1‑150 (MQ=255) cGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGt < 2:1064860/150‑1 (MQ=255) gCACTGCGAGTGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAACCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGCGGAAGCCGTCGCCCTGGCCGTCCTCGAGGCCACCCTAga > 1:120704/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAgatgat > 1:1018144/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTgg < 2:1126187/121‑1 (MQ=255) gAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTgg > 1:1126187/1‑121 (MQ=255) gTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGccgccg > 2:857050/1‑135 (MQ=255) gTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGccgccg < 1:857050/135‑1 (MQ=255) tGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTa < 2:1212890/136‑1 (MQ=255) tGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTa > 1:1212890/1‑136 (MQ=255) gAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGc > 1:326386/1‑150 (MQ=255) aCTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCa > 2:353886/1‑150 (MQ=255) cTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAg > 1:705709/1‑150 (MQ=255) tCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAgg > 1:927370/1‑150 (MQ=255) tCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAgg > 1:765788/1‑150 (MQ=255) cTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGa > 2:1776547/1‑113 (MQ=255) cTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGa < 1:1776547/113‑1 (MQ=255) tCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATc < 1:1347695/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATc < 1:946394/150‑1 (MQ=255) aGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGt > 2:1666433/1‑91 (MQ=255) aGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGt < 1:1666433/91‑1 (MQ=255) gTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGATGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCAc < 2:1727077/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCAc < 2:1701147/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTCCCGAg > 2:1701363/1‑81 (MQ=255) gTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTCCCGAg < 1:1701363/81‑1 (MQ=255) gTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTCGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGCCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCAc < 1:658249/150‑1 (MQ=255) gcgACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAga > 1:393772/1‑114 (MQ=255) gcgACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAga < 2:393772/114‑1 (MQ=255) gcgACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGt > 2:753995/1‑150 (MQ=255) gcgACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGt > 2:342642/1‑150 (MQ=255) cAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAAcc < 2:705709/150‑1 (MQ=255) ctgctgCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAg > 1:649937/1‑150 (MQ=255) gttcaTCGCCAATGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCa > 1:1130382/4‑117 (MQ=255) gttcaTCGCCAATGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCa < 2:1130382/114‑1 (MQ=255) cacaTCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTc < 2:1924496/150‑1 (MQ=255) caTCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCa < 2:1847665/150‑1 (MQ=255) aTCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTACCCCAGGCCTTCCAg > 2:1696496/1‑150 (MQ=255) cGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTa > 2:1062400/1‑150 (MQ=255) cGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTa > 1:1932819/1‑150 (MQ=255) gCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTaa < 2:326386/150‑1 (MQ=255) ccATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTAAc < 1:753995/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTAACAgg > 1:713038/1‑150 (MQ=255) | GATTCCGTACAGTTTTTTGTCGAACTGCCCGGCGTGTTTTTGCAGGTCAGCGAAGTCCTTCACCCCGGCATTCCACACATAGTCGGGCACTGCGAGGGTGAACTCGGTTCCCTCCAGGTTGCGCGACAGCTGCTGCACATCGCCATTGGCGATGAACTTGTCATGGAAGCCTTGCTGCGCCGGCATCCAGTTTCCGAGGAAGGCGTCGACCTGGCCGTCCTTGAGGCCGCCGTAGATGATCGGTACGGCCAGGCTGTCGATCTTCACCTGGTAACCCAGGCTTTCCAGTAACAGG > NC_002947/87348‑87642 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |