| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,033,605 | T→A | 5.0% | I74I (ATT→ATA) | PP_0891 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,033,605 | 0 | T | A | 5.0% | 252.1 / 2.0 | 79 | I74I (ATT→ATA) | PP_0891 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/39); new base A (2/2); total (38/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CTGGATGGCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTC > NC_002947/1033456‑1033749 | cTGGATGGCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGCGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTAtt > 1:1463876/1‑150 (MQ=255)cTGGATGGCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTAtt < 2:684911/150‑1 (MQ=255) tGGATGGCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTc < 1:213505/150‑1 (MQ=255) ggCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTg < 2:1406912/150‑1 (MQ=255) tCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGAc < 2:1748783/150‑1 (MQ=255) ttCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGa < 1:1404361/150‑1 (MQ=255) ttCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGAATACCGCTGctcac < 1:585697/147‑5 (MQ=255) ttCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGAATACCGCTGctcac > 2:585697/1‑143 (MQ=255) ttCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCAAGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGa > 1:235419/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCaaa > 1:1170733/1‑150 (MQ=255) ggCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCaaa < 2:828032/150‑1 (MQ=255) gTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGa < 2:1509014/150‑1 (MQ=255) ttCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGAc < 1:693235/135‑1 (MQ=255) ttCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGGATTCCGCTGCGTGAc > 2:693235/1‑135 (MQ=255) catcaCCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACaa < 2:1470596/150‑1 (MQ=255) tcaCCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAAcc > 2:1572259/1‑150 (MQ=255) tcaCCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAAcc > 2:179887/1‑150 (MQ=255) tcaCCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTAGGTTAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAAcc > 1:902239/1‑150 (MQ=255) aaGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAg < 2:1170733/150‑1 (MQ=255) aaGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAg < 1:1572259/150‑1 (MQ=255) gAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGt > 1:198650/1‑150 (MQ=255) aCGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCg > 1:1403845/1‑150 (MQ=255) cacCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCtt > 1:948415/1‑150 (MQ=255) cgccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGc < 2:235419/150‑1 (MQ=255) cgccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGc > 1:39466/1‑150 (MQ=255) cgccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGAATACCGCTGctcacc < 2:934329/109‑6 (MQ=255) cgccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGAATACCGCTGctcacc > 1:934329/1‑104 (MQ=255) ccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGa > 2:581765/1‑139 (MQ=255) ccgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGa < 1:581765/139‑1 (MQ=255) cgAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGa < 2:198650/150‑1 (MQ=255) aaGTGCATCGGGCTCTGGTGGTTTATGGGACGGTCGATCGCAAGGGGATGGACGGGTTGAGGATAGAGATGGACTCGGTGAGCCGCGGTAGTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAgg < 2:110625/150‑1 (MQ=255) aaGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAgg < 2:1403845/150‑1 (MQ=255) cATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCcaca > 1:1110030/1‑150 (MQ=255) tCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGa < 1:1436317/123‑1 (MQ=255) tCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGa > 2:1436317/1‑123 (MQ=255) cGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGGGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGATTCGCCGAGGCCACAGTg > 1:117190/1‑150 (MQ=255) tttCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAg < 2:948415/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAgg < 1:1378739/150‑1 (MQ=255) ggTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGtaca < 2:1529003/150‑1 (MQ=255) gCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGa > 1:1138710/1‑150 (MQ=255) cATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGAc < 2:1138710/150‑1 (MQ=255) aTGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGAcc > 2:1827802/1‑150 (MQ=255) ggCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATgcgc < 2:99387/90‑1 (MQ=255) ggCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATgcgc > 1:99387/1‑90 (MQ=255) gCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCt > 1:1845017/1‑148 (MQ=255) gCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCt < 2:1845017/148‑1 (MQ=255) gCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTAACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAgcgc < 2:465240/113‑1 (MQ=255) gCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTAACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAgcgc > 1:465240/1‑113 (MQ=255) aCGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGa > 1:1579982/1‑119 (MQ=255) aCGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGa < 2:1579982/119‑1 (MQ=255) cGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGc < 2:105943/150‑1 (MQ=255) gATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGcc > 1:1566608/1‑117 (MQ=255) gATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGcc < 2:1566608/117‑1 (MQ=255) cGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAAt < 1:837815/150‑1 (MQ=255) aaGGGTATGGCCGGGTTGAGTATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGAc > 2:248823/1‑150 (MQ=255) gggTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGt < 2:387517/90‑1 (MQ=255) gggTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGt > 1:387517/1‑90 (MQ=255) aaggaTGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCt > 1:67539/5‑150 (MQ=255) tATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGc > 1:268023/1‑150 (MQ=255) tATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGc < 2:865240/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGcc > 1:1363452/1‑150 (MQ=255) gTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGc > 2:1535074/1‑150 (MQ=255) ggATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGa < 2:39466/150‑1 (MQ=255) aTCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATc < 2:1110030/150‑1 (MQ=255) agaTTGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGaa > 2:1781389/1‑149 (MQ=255) agaTGGATTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGaa < 1:1781389/149‑1 (MQ=255) agaTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGa > 1:1010500/1‑117 (MQ=255) agaTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGa < 2:1010500/117‑1 (MQ=255) agaTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAAt > 2:465395/1‑150 (MQ=255) gaTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGAc < 1:1773797/106‑1 (MQ=255) gaTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGAc > 2:1773797/1‑106 (MQ=255) aTGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTg > 2:437251/1‑150 (MQ=255) tGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACGGATCGAATTgc < 2:395456/150‑1 (MQ=255) ggACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAGGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTgcg < 2:67539/150‑1 (MQ=255) ggACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTgcg < 1:179887/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCATAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGcc > 2:1549494/1‑150 (MQ=255) gTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCg < 1:465395/150‑1 (MQ=255) cGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGt > 2:874875/1‑150 (MQ=255) ggTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTc > 1:1753608/1‑150 (MQ=255) gTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGca > 1:1235223/1‑77 (MQ=255) gTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGca < 2:1235223/77‑1 (MQ=255) ttCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATc > 2:1873021/1‑122 (MQ=255) ttCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATc < 1:1873021/122‑1 (MQ=255) | CTGGATGGCGAATCTTCACGGCTGTCGTTCATCACCGGCAAGAACGGCGACACCGCCGAAGTGCATCGCTTTCTGGTGTTGCATGGCACGGTCGATCGCAAGGGTATGGCCGGGTTGAGGATCGAGATGGACTCGGTGAGCAGCGGTATTCCGCTGCGTGACGAGCAAATGCGCGACAACCTGTTCGAGGTCGAGCGCTTCGCCGAGGCCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTC > NC_002947/1033456‑1033749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |