| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,442,663 | G→C | 6.0% | P136R (CCG→CGG) | ghrB ← | 2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,442,663 | 0 | G | C | 6.0% | 203.4 / 5.0 | 67 | P136R (CCG→CGG) | ghrB | 2‑ketoaldonate reductase/hydroxypyruvate/glyoxylate reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/30); new base C (2/2); total (35/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
CTTCTCCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAGGGCGATGCCGCGC > NC_002947/1442515‑1442809 | cTTCTCCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccgg < 2:1647397/150‑1 (MQ=255)cTTCTCCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccgg > 1:254004/1‑150 (MQ=255) ttCTCCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccggg > 1:633773/1‑150 (MQ=255) tctcCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccgggc < 2:891179/150‑1 (MQ=255) cAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCAc > 2:300623/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACg < 1:300623/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACg < 1:1617094/150‑1 (MQ=255) gcgcGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCCAGGCGACTATGCACCGGGCCCTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACgg < 2:67356/150‑1 (MQ=255) cgcgGTCTTGCGGCTGTTGACGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCCGGCCCActtc < 1:1177185/150‑4 (MQ=255) ggTCTTGCGGCTGTGGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCGCAGGGTCTTGCCATGCACAGCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGc < 2:421239/150‑1 (MQ=255) ttGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGc > 2:495987/1‑150 (MQ=255) cGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAg > 1:1388482/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGcc < 1:684274/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCg > 2:759500/1‑150 (MQ=255) ccGCTGTACAGGATCGGCCTGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAGTGTTGCCCCTGCCGACGAGGCCCAGGGTCTTGCCCTGCACATCGCTGCCGAAGTTGGCCGGGCCCGCGGTGGCCTGCCAGATgggaaga > 2:1065692/1‑144 (MQ=255) cGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCt > 2:164075/1‑150 (MQ=255) cGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCt < 2:99961/150‑1 (MQ=255) gCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCtt > 1:1284776/1‑150 (MQ=255) cTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTg < 1:773944/150‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGACAAGGCGTGCTACTGGGTCACCAAGGTGGCCCATGCCGACGATGAGCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCa < 1:1884974/150‑1 (MQ=255) cAGGAGCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCa < 1:1031870/150‑1 (MQ=255) gATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccggg > 1:1932308/1‑112 (MQ=255) gATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTgggccggg < 2:1932308/112‑1 (MQ=255) gATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAg < 2:149637/148‑1 (MQ=255) gATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAg > 1:149637/1‑148 (MQ=255) gATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGCCCCACGGTTGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGc > 1:1655874/1‑150 (MQ=255) ggCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATcc > 1:1193939/1‑150 (MQ=255) ggaTGTTGACGTCGAAGTTGCCACGGCGTACCACTGCTGCACCAATGGTGTCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCa > 2:1044352/3‑150 (MQ=255) gCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGc > 1:280784/1‑118 (MQ=255) gCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGc < 2:280784/118‑1 (MQ=255) tGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTcgg < 1:164075/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATGCCGGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTcggc > 1:1393045/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTcggc > 1:162226/1‑150 (MQ=255) aGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCAAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCCGGCATCCAGCTcggccg > 1:342885/1‑148 (MQ=255) ccGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCa > 1:442335/1‑131 (MQ=255) ccGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCa < 2:442335/131‑1 (MQ=255) ccGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTg < 2:564391/150‑1 (MQ=255) cGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCgg < 2:1284776/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGgcg < 1:461378/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGCGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCCGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCATCTCGGCGGTGGCCCGGCCGCAg < 2:565512/150‑1 (MQ=255) gTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTTGGCGGTGCGCCGGGGGCCGcatc > 2:1288043/1‑147 (MQ=255) aCTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATc > 1:461407/1‑150 (MQ=255) gctgcACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGc < 1:759500/150‑1 (MQ=255) cAATGTTGCCGATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGc > 2:519032/1‑150 (MQ=255) cAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGGAGAGGGCCGGGCCCCCGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCCGAGAGAAGc > 2:1665238/1‑150 (MQ=255) aaTGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGcc < 1:41380/150‑1 (MQ=255) aaTGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGACTTTCAGTTGCCGGAATAGGTCCACGTAACGTGGTTTGCGGTTCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGcc > 1:918499/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGCTCAGCGAGAAGccc < 2:1393045/150‑1 (MQ=255) ccATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTcga > 1:424252/1‑149 (MQ=255) tGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTcggcgg < 2:1193939/150‑1 (MQ=255) ccGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTg < 2:1618300/150‑1 (MQ=255) cgacgaTGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTcggcg > 2:1490860/1‑146 (MQ=255) cgacgaTGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTcggcg < 1:1490860/146‑1 (MQ=255) cgacgaTGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGc > 2:583183/1‑150 (MQ=255) aTGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCg < 1:479837/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCTTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAg > 1:721817/1‑130 (MQ=255) ccAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAg < 2:721817/130‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCa > 1:694466/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAg > 2:1809157/1‑150 (MQ=255) cAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAg > 2:1095230/1‑150 (MQ=255) ttGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAg < 1:134648/117‑1 (MQ=255) ttGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAg > 2:134648/1‑117 (MQ=255) ccATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCgggg < 2:1388482/150‑1 (MQ=255) aTGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGgt > 1:531622/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGaa < 2:416858/102‑1 (MQ=255) gCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGaa > 1:416858/1‑102 (MQ=255) tGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCtt > 1:271030/1‑119 (MQ=255) tGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCtt < 2:271030/119‑1 (MQ=255) tGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAggg > 1:371551/1‑150 (MQ=255) tGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTAGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAggg < 1:1095230/150‑1 (MQ=255) caccgTGGGCCCGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCa < 2:1341661/119‑1 (MQ=255) caccgTGGGCCCGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCa > 1:1341661/5‑123 (MQ=255) caccgTGGGCCCGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAGGGCGa > 2:743993/5‑150 (MQ=255) gccgggccCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAGGGCGATGCCgcgc > 2:1706701/1‑150 (MQ=255) | CTTCTCCAGCGCGGTCTTGCGGCTGTTGCCGCTGTACAGGATCGGCATGTTGAAGCCGAAACGGCCACGGCGTGCCACTGCTGCACCAATGTTGCCCATGCCGACGATGCCCAGGGTCTTGCCATGCACATCGCTGCCGAAGTGGGCCGGGCCCACGGTGGCCTGCCAGTTGCCGGCCTTGGTCCAGGCATCCAGCTCGGCGGTGCGCCGGGCGCAGCCCATGATCAGCGAGAAGCCCAGGTCGGCGGTGCTTTCGGTCAGCACGTCGGGGGTGTTGGTCAGGGCGATGCCGCGC > NC_002947/1442515‑1442809 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |