| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,449,147 | G→A | 8.7% | *287* (TGA→TAA) ‡ | PP_1266 → | fusaric acid resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,449,147 | 0 | G | A | 8.7% | 219.3 / 9.0 | 80 | *287* (TGA→TAA) ‡ | PP_1266 | fusaric acid resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/40); new base A (3/4); total (36/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
CGAGCTGATCGCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAA > NC_002947/1448998‑1449295 | cgAGCTGATCGCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTg < 1:920968/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGAcc > 1:253662/1‑150 (MQ=255) gATCGCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGAAGGCGGCAGGGACGACGTGTACGTTGTTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTc < 1:243428/150‑1 (MQ=255) tgcggcGTGAACGCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCTGTGCGCATTCACATCGATGAAGTCCCGGAACGGTTTTTGCTTGCGGCGGTGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGa < 2:85140/145‑1 (MQ=255) gCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTCGCGAAGGTCAACCTTcgcca < 2:146388/150‑3 (MQ=255) ccGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGAc > 2:8876/1‑150 (MQ=255) gTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATcc > 2:72046/1‑150 (MQ=255) gTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTCGCGAAGGTCAACCTTcgc > 1:813813/1‑142 (MQ=255) gTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTCGCGAAGGTCAACCTTcgc < 2:813813/142‑1 (MQ=255) gAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCg < 1:8876/150‑1 (MQ=255) cccGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGGCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGcc > 1:563318/1‑150 (MQ=255) ccGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCt > 2:163475/1‑150 (MQ=255) cGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGGCTc > 2:1310505/1‑150 (MQ=255) cGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTc < 2:498700/150‑1 (MQ=255) gACCTTCAACTGGGTGTGGCTGGCACAGCGGGTGCGGGTGCGCATTGACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTTCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGAGACCATCCCGGCCTcc < 2:39649/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTcgc < 1:1546297/133‑1 (MQ=255) aCCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTcgc > 2:1546297/1‑133 (MQ=255) ccTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATAAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCg > 1:798279/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCt > 1:1617397/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCt < 2:361245/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACTTTCGCGACCATCCCGGCCCACCGCATCATCtgt < 2:74986/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTgg < 1:475331/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGa > 1:848525/1‑150 (MQ=255) gCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCctg > 1:1265807/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCctgct > 2:41669/1‑150 (MQ=255) acaGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCctgc > 2:1118145/1‑149 (MQ=255) acaGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCctgc < 1:1118145/149‑1 (MQ=255) caGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACTATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCctgctg > 2:62386/1‑150 (MQ=255) gCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGAGACCCTCTTTGCTTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGat < 1:1341090/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGcatca < 1:591914/126‑1 (MQ=255) gTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGcatca > 2:591914/1‑126 (MQ=255) tGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGatgcatg < 1:72046/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCg > 1:21773/1‑150 (MQ=255) tGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTAtt < 2:563318/150‑1 (MQ=255) gcgcATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTa < 2:848525/150‑1 (MQ=255) gcgcATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTa < 1:1525845/150‑1 (MQ=255) gcATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTCAACCTTcgc > 1:1678249/1‑93 (MQ=255) gcATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTCAACCTTcgc < 2:1678249/93‑1 (MQ=255) gcATTCACATCGATAAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGc < 2:798279/150‑1 (MQ=255) cATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTCCTGGCGGCGGGGAACACCTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGcc > 1:1494106/1‑150 (MQ=255) ttCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCa > 2:1664286/1‑149 (MQ=255) ttCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCa < 1:1664286/149‑1 (MQ=255) cacaTCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTc < 1:1604417/150‑1 (MQ=255) acaTCGATGAAGTGACGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCg > 2:222164/1‑150 (MQ=255) tCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGa < 1:1642757/126‑1 (MQ=255) tCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGa > 2:1642757/1‑126 (MQ=255) tCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCATGGATAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCt < 1:120319/150‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTa < 2:1303562/137‑1 (MQ=255) gATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTa > 1:1303562/1‑137 (MQ=255) tGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAAt < 1:222164/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCg < 1:1432255/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTAGCGACCATCCCg < 2:166898/81‑1 (MQ=255) ggAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTAGCGACCATCCCg > 1:166898/1‑81 (MQ=255) gAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGcatcat > 1:257819/1‑94 (MQ=255) gAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGcatcat < 2:257819/94‑1 (MQ=255) gAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGa < 1:645492/102‑1 (MQ=255) gAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGa > 2:645492/1‑102 (MQ=255) gAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGc > 1:106964/1‑150 (MQ=255) aaGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGcc > 2:1648676/1‑150 (MQ=255) tttttGCTGGCGGCGGGTACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTg > 2:564952/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAAc < 1:564952/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAAc < 1:1728958/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACt < 1:1301420/150‑1 (MQ=255) gcggcgGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTg > 2:200775/1‑150 (MQ=255) gcggGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTc < 2:106964/150‑1 (MQ=255) ggggACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTccc < 1:185798/150‑1 (MQ=255) ggACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCGACTGGTCCCaa < 2:21773/150‑1 (MQ=255) ggtggtAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGt > 1:181292/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAAt > 2:714420/1‑95 (MQ=255) aaGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAAt < 1:714420/95‑1 (MQ=255) aGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGc < 2:1617397/150‑1 (MQ=255) gCGAAGGTCAACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGc > 1:1456774/1‑83 (MQ=255) gCGAAGGTCAACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGc < 2:1456774/83‑1 (MQ=255) gAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCtt > 2:1622463/1‑150 (MQ=255) aGGTTGACCTTCGCGACCCTCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCtttt < 2:253662/150‑1 (MQ=255) aGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCtttt < 2:181292/150‑1 (MQ=255) aGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCtttt < 2:1265807/150‑1 (MQ=255) gTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATc < 2:65107/116‑1 (MQ=255) gTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATc > 1:65107/1‑116 (MQ=255) gTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCtttttc > 2:1153727/1‑148 (MQ=255) tGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGaaa < 1:1622463/150‑1 (MQ=255) | CGAGCTGATCGCCGACGTGAACCCGACCTTCAACTGGGTGCGGCTGGCACAGCGGGTGCCGGTGCGCATTCACATCGATGAAGTGCCGGAAGGGTTTTTGCTGGCGGCGGGGACGACGTGTACGGTGGTAGTCAAGCCTGGCGAAGGTTGACCTTCGCGACCATCCCGGCCTCCCGCATCATCTGTGGGAGCCCTGCTGATGCATGCGTATTAGCCAGTCGGCTCAATCTGCGGCAGCCTCTTGCAGCAACTGGTCCCAATCGTCCGGTGGGTTGCCGCTATGCAACATCTTTTGAAA > NC_002947/1448998‑1449295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |