| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 165,932 | A→C | 7.4% | D325E (GAT→GAG) | pntAA ← | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 165,932 | 0 | A | C | 7.4% | 226.0 / 8.9 | 81 | D325E (GAT→GAG) | pntAA | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/37); new base C (3/3); total (41/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
CTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTCATCTGCGCCA > NC_002947/165784‑166080 | cTTAGCCGTTTTTTTTTTTGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCAt > 2:1443813/1‑150 (MQ=255) ttAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCACACGCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATc > 1:1477627/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGc > 2:200371/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGc > 1:1350100/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa < 2:1491887/150‑1 (MQ=255) tttttGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTc < 1:200321/150‑1 (MQ=255) cGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTgg < 2:769473/150‑1 (MQ=255) ggACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTggg < 2:1502314/150‑1 (MQ=255) gacCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCgg > 1:957539/1‑150 (MQ=255) gacCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCgg < 1:200371/150‑1 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCCCATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa < 2:1350100/150‑1 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTgg > 2:590783/1‑143 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTgg < 1:590783/143‑1 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa > 1:309146/1‑150 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCATGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTAGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTTCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATGGGCACTCACCTGGGCCGGCAg > 2:364435/1‑150 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAg > 1:1241354/1‑150 (MQ=255) tGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAgg > 2:202103/1‑150 (MQ=255) aCCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGATGCCTCGGCACtgta < 1:199413/135‑4 (MQ=255) aCCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGATGCCTCGGCACtgta > 2:199413/1‑132 (MQ=255) tCACGTCACACCAGCCAGGCCGCGACTATGTCGTCTTCGAGGTGGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCTTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTc < 2:661892/150‑1 (MQ=255) tCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATTCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTAAAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTc < 2:1524826/150‑1 (MQ=255) cacaTCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCcg > 1:738815/1‑150 (MQ=255) caTCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCcgac > 1:216006/1‑150 (MQ=255) aggcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGAGTACAGTGCGGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGTGCCGACggtg > 2:303207/1‑150 (MQ=255) ggcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACgatga > 1:1798493/1‑150 (MQ=255) gcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGtt < 1:1158813/132‑1 (MQ=255) gcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGtt > 2:1158813/1‑132 (MQ=255) gcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACgatgat < 2:365385/150‑1 (MQ=255) gcaggcCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACgatgat < 2:365655/150‑1 (MQ=255) cgcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGcc < 1:1603131/150‑1 (MQ=255) cgcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGcc < 1:1883199/150‑1 (MQ=255) gcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCTAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTg > 2:1223306/1‑126 (MQ=255) gcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCTAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTg < 1:1223306/126‑1 (MQ=255) gcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCg < 1:1513470/102‑1 (MQ=255) gcgACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCg > 2:1513470/1‑102 (MQ=255) acgaTGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCTCGCATTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTtc > 1:1392948/1‑150 (MQ=255) tGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCt > 2:519256/1‑150 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa < 2:1216779/112‑1 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa > 1:1216779/1‑112 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGc > 1:1065996/1‑150 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGc < 2:957539/150‑1 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGc < 2:1798493/150‑1 (MQ=255) tcgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGc > 1:305846/1‑150 (MQ=255) cgtcTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGGGAGTTTCA‑GCCGGCTAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGca > 2:477247/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCCTAGGACCTCACCTGGGCCGGCAGTTTAGTCGTTCTGACGATTGTCTTGCTGTTCGCTTTCACCACCTg < 2:1477627/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTg < 1:2700/150‑1 (MQ=255) gatgatCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGc < 1:519256/150‑1 (MQ=255) gatCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACCCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTc < 2:375088/103‑1 (MQ=255) gatCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACCCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTc > 1:375088/1‑103 (MQ=255) cATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGc < 2:1065996/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGGCCGGCGGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCGCTCTCCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAg < 1:562569/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGtt > 1:1076142/1‑150 (MQ=255) gTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTgcc > 1:134366/1‑150 (MQ=255) gAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTTCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTgccgcc > 2:1160938/1‑150 (MQ=255) gAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa > 2:1410660/1‑58 (MQ=255) gAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa < 1:1410660/58‑1 (MQ=255) aCA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCtt < 2:1518630/150‑1 (MQ=255) ca‑gcagCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTg < 2:1038178/150‑1 (MQ=255) a‑gcagcTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACATGGCCGATGCAGCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTgg < 1:364435/150‑1 (MQ=255) a‑gcagcTTCATGAAGTCCAGCACGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTgg < 2:309146/150‑1 (MQ=255) gcagcTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTggg < 2:1241354/150‑1 (MQ=255) gcagcTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTggg < 2:1076142/150‑1 (MQ=255) agcTTCATGACGTACAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCt > 2:1249734/1‑150 (MQ=255) agcTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGAGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCt < 1:303207/150‑1 (MQ=255) ttCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCcga < 2:1681159/79‑1 (MQ=255) ttCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCcga > 1:1681159/1‑79 (MQ=255) aTGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTAGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGcc > 1:1612927/1‑150 (MQ=255) gAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAg > 2:1805681/1‑150 (MQ=255) aaGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAgg > 2:813985/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGATGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGACGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTc > 1:315559/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGa < 2:216006/150‑1 (MQ=255) cagcagGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGAt > 1:1764477/1‑150 (MQ=255) agGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGacc < 2:738815/150‑1 (MQ=255) gtACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCggg > 2:175757/1‑150 (MQ=255) gtgaGTGCCGATGCCTCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGc > 1:91261/4‑150 (MQ=255) cAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCGGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCtt > 2:1491414/1‑150 (MQ=255) aGTGCCGATGCCTCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCa < 2:1111399/58‑1 (MQ=38) aGTGCCGATGCCTCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCa > 1:1111399/1‑58 (MQ=38) gCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTCATc < 1:1805681/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGACTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTCATCt > 1:17677/1‑150 (MQ=255) cATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTCATCTGCGCCa < 1:202103/150‑1 (MQ=255) | CTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACA‑GCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTCATCTGCGCCA > NC_002947/165784‑166080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |