Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,779,105 | G→A | 6.0% | L241L (CTG→CTA) | PP_1587 → | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,779,105 | 0 | G | A | 6.0% | 195.1 / 2.2 | 67 | L241L (CTG→CTA) | PP_1587 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/30); new base A (2/2); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 |
GCTGACGCCAGCTTCAGCTTCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGTTGC > NC_002947/1778959‑1779253 | gCTGACGCCAGCTTCAGCTTCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTtgctgctg < 2:102074/150‑1 (MQ=255) aCGCCAGCTTCAGCTTCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGt < 2:1618493/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCTTCAGGTTCGTGTTGGTCGAACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTGGTGAGTTGGTTGATCGGTGGCCTGCGTAGGTGGGTGATCACCGGGGGCTGGGACGATCCGGCTGCCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGtt < 2:746194/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTTCAGCTTCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTc > 2:774613/1‑150 (MQ=255) cagcttcagcttCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGc > 1:295884/1‑150 (MQ=255) cttcagcttcGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCCACGAGGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGc < 1:1019620/150‑1 (MQ=255) cttcGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGt < 2:1275560/150‑1 (MQ=255) cttcGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACACATGTGGTGTTCGTTTTTTTTCGGCCTTGCTCAGCCTACGt > 2:1870672/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGcc < 1:225384/131‑1 (MQ=255) gtgtTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTg > 2:1161347/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGTCGCACTGGACGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGcc > 2:225384/1‑131 (MQ=255) gTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAg > 1:1712546/1‑150 (MQ=255) gTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAg > 2:1592227/1‑150 (MQ=255) gTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCAGCTGCCCTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAg < 2:1193824/150‑1 (MQ=255) tCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGc < 2:295884/150‑1 (MQ=255) gCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGt > 2:289614/1‑150 (MQ=255) aCTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGttt < 2:1046281/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTg < 2:23362/150‑1 (MQ=255) gggCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTggg < 1:165682/150‑1 (MQ=255) ggcggcCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGc < 2:1712546/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCg > 2:245591/1‑150 (MQ=255) ttGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCgg < 2:1165662/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTCACGTTCCCGTGATAGGTGCTGTCCGATCGTTTGGGCGCTTCGGGTAt > 2:1772561/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTAtt < 1:1870672/150‑1 (MQ=255) gTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATtctctct > 1:668983/1‑149 (MQ=255) tGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCgg > 2:636155/1‑150 (MQ=255) cTGAGTGGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTg < 1:275047/150‑1 (MQ=255) gttggttgATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTggcgg < 1:1772561/150‑1 (MQ=255) gttgATCGGTCCCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTACTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGcggccgg > 2:1443456/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCAGGCatg > 2:108/1‑150 (MQ=255) tCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCatga > 2:296931/1‑150 (MQ=255) gTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGc > 1:695798/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCa < 1:296931/150‑1 (MQ=255) cTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGc < 1:245591/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTg < 1:1161347/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTg > 1:1176022/1‑150 (MQ=255) cgcATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCTTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTgg < 1:930910/150‑1 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGc < 2:949936/136‑1 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGc > 1:949936/1‑136 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGAc < 1:186045/150‑1 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTACTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCgg > 2:1056594/1‑103 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTACTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCgg < 1:1056594/103‑1 (MQ=255) tgGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTACTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGNGTATTCNCTCGGCAGTGGCNGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGAc < 1:1443456/150‑1 (MQ=255) ggATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGc > 1:407441/1‑87 (MQ=255) ggATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGc < 2:407441/87‑1 (MQ=255) gatgatCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACct > 1:970507/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGCTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTc > 2:376493/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGCTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTc < 1:376493/150‑1 (MQ=255) gggCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCa < 1:774613/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCgg > 2:257054/1‑133 (MQ=255) ggCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGa < 1:257054/134‑1 (MQ=255) cTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGAc < 2:1055452/150‑1 (MQ=255) tGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGAcc > 2:986718/1‑150 (MQ=255) tGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGAcc > 2:1055189/1‑150 (MQ=255) tGGGACGATCCGGATACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTCCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCCGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGCCAGAcc > 2:562206/1‑150 (MQ=255) aCGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTa < 1:1055189/150‑1 (MQ=255) aCGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTa < 2:1176022/150‑1 (MQ=255) gATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGCGCGTTTGGGGGTTTGAGCGCCTCATGTATCACTGTCGGGGGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTAcc > 1:1406377/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTAcc > 2:1657599/1‑150 (MQ=255) gCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCatgatg > 2:996472/1‑105 (MQ=255) gCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCatgatg < 1:996472/105‑1 (MQ=255) aCCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGGCGTTCGAAGAATAAGTGCAGGGCGAGTGGTTGGGCGTTTCGGGTGTTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCAACCTGCGGCCGGGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTc > 1:1306622/1‑150 (MQ=255) ccATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCaa > 1:1598097/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCg > 2:1646988/1‑150 (MQ=255) gtgtTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAgt < 1:636155/150‑1 (MQ=255) gtgtTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTCGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAgt > 1:630274/1‑150 (MQ=255) ttCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGAGGTTCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTc > 1:1477985/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTgg > 1:275808/1‑150 (MQ=255) tgttgctgttgcGGCTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTTTCGGCAGTGGCGGCCGGCATCATGCAGAGCTGGCTCGCCCTGCTGCGGAGTCACTCCAGTACCCTCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGt < 1:1592227/150‑1 (MQ=255) gctgctgcCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGtt < 2:1306622/150‑1 (MQ=255) ctgctgcCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGtt < 2:679700/149‑1 (MQ=255) ctgctgcCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGtt > 1:679700/1‑149 (MQ=255) tgctgcCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGTTGc > 2:1148857/1‑150 (MQ=255) | GCTGACGCCAGCTTCAGCTTCGTGTTGGTCGCACTGGGCGGCCTTGCGGTGGGCGTGGTACTGAGTTGGTTGATCGGTCGCCTGCGCATGTGGATGATCACCCGGGGCTGGGACGATCCGGCTACCCATGTGGTGTTCATGTTGCTGCTGCCGTTCGCAGCCTACGTGCTGGCCGAGCGTTTGGGCGTTTCGGGTATTCTCTCGGCAGTGGCGGCCGGCATGATGCAGAGCTGGCTCGACCTGCTGCCGCGTCAGACCAGTACCCGCCTGCTCAACCGCAGTGTCTGGTCGTTGC > NC_002947/1778959‑1779253 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |