Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,795,768 | G→T | 5.6% | E12* (GAG→TAG) | lpxD → | UDP‑3‑O‑acylglucosamine N‑acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,795,768 | 0 | G | T | 5.6% | 227.2 / 2.4 | 71 | E12* (GAG→TAG) | lpxD | UDP‑3‑O‑acylglucosamine N‑acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/30); new base T (2/2); total (39/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.50e-01 |
TCAAGAAGGGCGGCTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAGGCCGGCGCGGTGCTG > NC_002947/1795624‑1795917 | tCAAGAAGGGCGGCTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTa > 2:1486992/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGGGCGGCTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGCACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTAc < 2:1319409/150‑1 (MQ=255) agGGCGGCTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCGAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGa < 1:975105/150‑1 (MQ=255) cTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTAccc > 2:1585626/1‑150 (MQ=255) aCGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTc > 1:1911452/1‑150 (MQ=255) gACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCaa > 1:350365/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAg < 1:1585626/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAggggacagac > 2:785444/1‑144 (MQ=255) tCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAg < 1:1292278/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAg > 1:1439706/1‑150 (MQ=255) gAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGgc > 2:1696557/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGgcgc < 2:350365/150‑1 (MQ=255) ggtgCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCa < 2:283789/150‑1 (MQ=255) tCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTAcc < 2:1113566/150‑1 (MQ=255) tCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCggg > 1:887806/1‑150 (MQ=255) gATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGtt > 2:497637/1‑150 (MQ=255) ccTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTAcc < 1:505026/136‑1 (MQ=255) ccTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTAcc > 2:505026/1‑136 (MQ=255) cTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTACGCTAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTg > 1:356464/1‑150 (MQ=255) aGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTg > 2:1714921/1‑123 (MQ=255) aGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTg < 1:1714921/123‑1 (MQ=255) aGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCag < 2:1911452/150‑1 (MQ=255) gTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCa > 1:1115171/1‑141 (MQ=255) gTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCa < 2:1115171/141‑1 (MQ=255) gTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCa < 2:1115172/141‑1 (MQ=255) gTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCa > 1:1115172/1‑141 (MQ=255) gTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCagg > 1:1224934/1‑150 (MQ=255) tACGACATCACCCGCCAAGTCATAGAGCGCATGCACCAAGCCCGTTTATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCagga < 2:1669349/150‑1 (MQ=255) aTCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTgg > 2:167682/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAg > 2:1439188/1‑86 (MQ=255) aCCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAg < 1:1439188/86‑1 (MQ=255) ccGGCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGAAGGAGGCTGGCCCGa < 1:497637/150‑1 (MQ=255) cAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCa > 2:278948/1‑150 (MQ=255) aaGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAg < 1:278948/150‑1 (MQ=255) tCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCagga < 1:369990/131‑1 (MQ=255) tCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCagga > 2:369990/1‑131 (MQ=255) tCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTg > 1:518325/1‑150 (MQ=255) gAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCtt > 2:1275856/1‑150 (MQ=255) aGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTc < 2:1224934/150‑1 (MQ=255) gcgcATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTcc > 1:451209/1‑150 (MQ=255) attaaCCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCTCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGc > 2:1047659/4‑150 (MQ=255) aTGAACCAAGCCTGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGc < 2:1871443/150‑1 (MQ=255) aTGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGc > 1:986381/1‑150 (MQ=255) aTGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGc > 2:1228883/1‑150 (MQ=255) aaCCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGtt < 2:616048/102‑1 (MQ=255) aaCCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGtt > 1:616048/1‑102 (MQ=255) aCCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAAc > 1:761027/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGc > 1:1822599/1‑111 (MQ=255) ccAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGc < 2:1822599/111‑1 (MQ=255) ccGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGgcg < 2:1364422/77‑1 (MQ=255) ccGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGgcg > 1:1364422/1‑77 (MQ=255) atGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAg > 2:624890/1‑150 (MQ=255) gtgtGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTAcc > 1:570719/1‑150 (MQ=255) tgACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTgg < 1:548219/150‑1 (MQ=255) tgACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTgg > 1:266284/1‑150 (MQ=255) aCCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGAt > 2:799612/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCCAGTACCTGGATaa > 2:627297/1‑150 (MQ=255) cATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATaa > 1:135500/1‑150 (MQ=255) tGACGCTAGGCAAGCTGGCAGGGATACGCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCACCCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAAcc < 2:451209/150‑2 (MQ=255) acctcggCCAGCTGGCCTAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGcc > 1:613686/6‑150 (MQ=255) acctcggCCAGCTGGCCTAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGcc > 2:1347431/6‑150 (MQ=255) gCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGATCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCa < 1:785444/150‑1 (MQ=255) gCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCa < 1:167682/150‑1 (MQ=255) gCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCa > 1:1402663/1‑150 (MQ=255) gCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCa < 1:627297/150‑1 (MQ=255) ctcggCCAGCTGGCCTAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAg < 2:613686/147‑1 (MQ=255) ctcggCCAGCTGGCCTAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAg < 1:1347431/147‑1 (MQ=255) cTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCa < 2:1697755/56‑1 (MQ=255) cTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCa > 1:1697755/1‑56 (MQ=255) ggCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAGGCCGGCGCGGt < 1:175437/150‑1 (MQ=255) cGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAGGCCGGCGCGGtgct < 2:1439706/150‑1 (MQ=255) gAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAGGCCGGCGCGGtgctg < 1:1416642/150‑1 (MQ=255) | TCAAGAAGGGCGGCTACGACCTGGTCCTCGAGCGTGGTGCGGTCATCGATGTCAAACCTCAGTACGACATCACCCGCCAAGTCATCGAGCGCATGAACCAAGCCCGTTGATATGAGTGTGACCATGACGCTAGGCCAGCTGGCCGAGGTACTCGGAGCTACCCTCAAGGGGCCCGAGGCGCTGCAGATTACCGGGTTGGCCACCTTGCAGGAGGCTGGCCCGACGCAGTTGAGCTTCCTCGCCAACCCGCAGTACCGCAAGTACCTGGATAACAGCCAGGCCGGCGCGGTGCTG > NC_002947/1795624‑1795917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |