| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,875,398 | T→C | 5.0% | V27A (GTG→GCG) ‡ | cobS → | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,875,398 | 0 | T | C | 5.0% | 304.5 / 3.6 | 99 | V27A (GTG→GCG) ‡ | cobS | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/51); new base C (3/2); total (46/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.34e-01 | |||||||||||
CGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCT > NC_002947/1875249‑1875545 | tgtgGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGt < 2:550012/149‑1 (MQ=255) tgGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGAAGCTCTAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGa < 1:494032/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGTCGGTGAGc < 1:206450/150‑1 (MQ=255) gCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGc > 2:1728227/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGcc > 1:930185/1‑150 (MQ=255) ccAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCg > 2:1026419/1‑150 (MQ=255) aGGTAGCAGTTGCTGCAGGGCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGACCGAATCGCACTGCGAGGTCGCCTTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGGCggg > 1:718666/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGc < 2:1799329‑M2/150‑2 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg > 1:942025‑M2/1‑146 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg < 1:1291472‑M2/150‑5 (MQ=255) ttGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggc < 1:1549291‑M2/150‑6 (MQ=255) ctgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCAcc > 2:1820989/1‑150 (MQ=255) tgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACcg > 2:1078859/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:292423/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:508529/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAg > 1:520130/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 2:1394211/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 1:1202961/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa > 1:1394211/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAgg < 1:1728227/150‑1 (MQ=255) ttGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGa < 2:1167221/115‑1 (MQ=255) ttGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGa > 1:1167221/1‑115 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTCGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 2:1196295/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGATGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGGATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 1:1440722/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa > 2:134779‑M2/1‑107 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa < 1:1103916‑M2/144‑38 (MQ=255) ggTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTgg < 1:1026419/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCg < 1:1139087/150‑1 (MQ=255) gggTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgc < 2:1291472/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgct < 1:95794/150‑1 (MQ=255) gTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGAAACCACGTGAGGTATTGCTTGCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctg > 2:1287994/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctgc > 1:1356928/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctgc < 2:442283/150‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt < 1:615462/115‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt > 2:615462/1‑115 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGtt > 1:1278513/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTATGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTc < 2:1258686/150‑1 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg > 1:74185/1‑150 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg < 1:1130987/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCgg < 1:1078859/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 2:1356928/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 1:1820989/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACTCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCt < 2:560691/150‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa > 1:496740/1‑99 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 2:496740/99‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGACGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCtt < 1:1319510/150‑1 (MQ=255) 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agaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt > 1:1924013/1‑138 (MQ=255) agaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt < 2:1924013/138‑1 (MQ=255) gaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgc < 1:813857/131‑1 (MQ=255) gaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgc > 2:813857/1‑131 (MQ=255) ttGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTg > 1:1262795/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGc < 1:1130186/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt > 2:1809710/1‑130 (MQ=255) ccGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt < 1:1809710/130‑1 (MQ=255) tCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAgg < 2:1262795/150‑1 (MQ=255) cTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtg < 2:1940541/118‑1 (MQ=255) cTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtg > 1:1940541/1‑118 (MQ=255) tGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgtg > 1:369276/1‑125 (MQ=255) tGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgtg < 2:369276/125‑1 (MQ=255) ggATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCCGCTACAGGGTa > 1:1451614/1‑150 (MQ=255) gATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTAc < 1:518294/150‑1 (MQ=255) ttGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTcg > 2:1342847/1‑150 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCAt < 2:905728/124‑1 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCAt > 1:905728/1‑124 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCt < 1:862820/150‑1 (MQ=255) agcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGt < 2:279663/106‑1 (MQ=255) agcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGt > 1:279663/1‑106 (MQ=255) gcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGTGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCgg < 2:1340330/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCttt < 1:1287994/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagca < 1:420315‑M2/150‑128 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc < 2:1056431/142‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc > 1:1056431/1‑142 (MQ=255) gCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagcaa > 2:420315‑M2/1‑22 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc < 1:1114654/67‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc > 2:1114654/1‑67 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTTGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct < 2:74185/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct > 2:1108982/1‑150 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg < 1:204081/39‑1 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg > 2:204081/1‑39 (MQ=255) | CGTGGCTTGCCCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCT > NC_002947/1875249‑1875545 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |