| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,875,404 | T→C | 5.4% | L29P (CTG→CCG) | cobS → | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,875,404 | 0 | T | C | 5.4% | 279.0 / 3.9 | 93 | L29P (CTG→CCG) | cobS | adenosylcobinamide‑GDP ribazoletransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/48); new base C (3/2); total (43/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
CCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGT > NC_002947/1875259‑1875553 | ccAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCg > 2:1026419/1‑150 (MQ=255) aGGTAGCAGTTGCTGCAGGGCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGACCGAATCGCACTGCGAGGTCGCCTTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGGCggg > 1:718666/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGc < 2:1799329‑M2/150‑2 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg > 1:942025‑M2/1‑146 (MQ=255) gTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccgg < 1:1291472‑M2/150‑5 (MQ=255) ttGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggc < 1:1549291‑M2/150‑6 (MQ=255) ctgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCAcc > 2:1820989/1‑150 (MQ=255) tgcAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACcg > 2:1078859/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:292423/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 1:508529/150‑1 (MQ=255) tCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAg > 1:520130/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 2:1394211/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa < 1:1202961/150‑1 (MQ=255) aGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTa > 1:1394211/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAgg < 1:1728227/150‑1 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTCGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 2:1196295/1‑150 (MQ=255) ccATGGCGCGTTGATGCGGATGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGGATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGtt > 1:1440722/1‑150 (MQ=255) gcgcGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCgctg < 1:1196295/150‑1 (MQ=255) gcgTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatc > 1:1259414‑M2/1‑118 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGc > 2:590067/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa > 2:1103916‑M2/1‑107 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa < 1:1103916‑M2/144‑38 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa > 2:134779‑M2/1‑107 (MQ=255) gCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGCATGCCCGGCAGGCTCAccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaa < 1:134779‑M2/144‑38 (MQ=255) ggTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTgg < 1:1026419/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCg < 1:1139087/150‑1 (MQ=255) gggTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgc < 2:1291472/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgct < 1:95794/150‑1 (MQ=255) gTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGAAACCACGTGAGGTATTGCTTGCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctg > 2:1287994/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctgc > 1:1356928/1‑150 (MQ=255) tGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGgctgc < 2:442283/150‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt > 2:615462/1‑115 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGt < 1:615462/115‑1 (MQ=255) gATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGtt > 1:1278513/1‑150 (MQ=255) aTGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTATGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTc < 2:1258686/150‑1 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg > 1:74185/1‑150 (MQ=255) tGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCg < 1:1130987/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCgg < 1:1078859/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 2:1356928/150‑1 (MQ=255) ggCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGc < 1:1820989/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACTCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCt < 2:560691/150‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa > 1:496740/1‑99 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGa < 2:496740/99‑1 (MQ=255) cAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGACGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCtt < 1:1319510/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCAc > 1:226197/1‑91 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCAc < 2:226197/91‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGCGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTGACTGCTGTATTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGATtg > 1:916279/1‑150 (MQ=255) aCTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgc > 1:1341794/1‑150 (MQ=255) tGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgctg > 1:1524630/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTgctgct > 2:1757156/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTgctgct > 2:862820/1‑150 (MQ=255) ggCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGt < 1:185015/150‑1 (MQ=255) gcgcCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGtt < 2:1524630/150‑1 (MQ=255) cgcCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCCGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTg < 1:1696054/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTTCCCGCGGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTgg < 2:718666/147‑1 (MQ=255) gcCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTgg < 1:1201649/150‑1 (MQ=255) ccTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGcc > 1:1622195/1‑150 (MQ=255) cTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTGGTTGTTGGACTACTCGCTGGTCGCGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCa < 2:520130/150‑1 (MQ=255) cTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCa > 1:1000865/1‑150 (MQ=255) tGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAg > 1:1269040/1‑150 (MQ=255) agaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt < 2:1924013/138‑1 (MQ=255) agaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt > 1:1924013/1‑138 (MQ=255) gaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgc < 1:813857/131‑1 (MQ=255) gaTGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtgc > 2:813857/1‑131 (MQ=255) ttGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTg > 1:1262795/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGc < 1:1130186/150‑1 (MQ=255) ccGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt < 1:1809710/130‑1 (MQ=255) ccGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgt > 2:1809710/1‑130 (MQ=255) tCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAgg < 2:1262795/150‑1 (MQ=255) cTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtg > 1:1940541/1‑118 (MQ=255) cTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTtg < 2:1940541/118‑1 (MQ=255) tGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgtg > 1:369276/1‑125 (MQ=255) tGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCtgtg < 2:369276/125‑1 (MQ=255) ggATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCCGCTACAGGGTa > 1:1451614/1‑150 (MQ=255) gATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTAc < 1:518294/150‑1 (MQ=255) ttGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTcg > 2:1342847/1‑150 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCAt < 2:905728/124‑1 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCAt > 1:905728/1‑124 (MQ=255) gTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCt < 1:862820/150‑1 (MQ=255) agcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGt > 1:279663/1‑106 (MQ=255) agcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGt < 2:279663/106‑1 (MQ=255) gcagcCTGCCGGTGAGCCTGCCGTGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCgg < 2:1340330/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCttt < 1:1287994/150‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagca < 1:420315‑M2/150‑128 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc < 2:1056431/142‑1 (MQ=255) tGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGc > 1:1056431/1‑142 (MQ=255) gCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGccggcaggctgctgagaaactgcaaggcgatccagaacggcaacatctcagggcgcctcgaccagttgcccatcgccacccggcaccagccgcatcaacgcgccatggccaacctcgacctgcagcaa > 2:420315‑M2/1‑22 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc < 1:1114654/67‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTc > 2:1114654/1‑67 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTTGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct < 2:74185/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTgctgct > 2:1108982/1‑150 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg > 2:204081/1‑39 (MQ=255) gTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAggg < 1:204081/39‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGTCTTTGCTGCTGACGTtgt < 1:1799329/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTtgt < 1:1342847/150‑1 (MQ=255) | CCAGGGAGCAGTTGCTGCAGGTCGAGGTTGGCCATGGCGCGTTGATGCGGCTGGTGCCGGGTGGCGATGGGCAACTGGTCGAGGCGCCCTGAGATGTTGCCGTTCTGGATCGCCTTGCAGTTTCTCAGCAGCCTGCCGGTGAGCCTGCCGGGCATGCCGGCACCGCGTGAGGTAGGGCGTTCGCTGCTGTACTACCCGCTGGTCGGGCTGCTGTTCGGCTTGCTGCTGTGGTTGGCCAGTCATCTGCTACAGGGTACGCCGTCGCCGCTGCATGCGGCTTTGCTGCTGACGTTGT > NC_002947/1875259‑1875553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |