| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,051,108 | T→A | 6.2% | intergenic (‑63/+23) | PP_1825 ← / ← PP_1826 | hypothetical protein/isochorismatase family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,051,108 | 0 | T | A | 6.2% | 292.1 / 8.8 | 96 | intergenic (‑63/+23) | PP_1825/PP_1826 | hypothetical protein/isochorismatase family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/49); new base A (3/3); total (44/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
GGCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAC > NC_002947/2050964‑2051254 | ggccggccGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCgg < 2:495385/150‑1 (MQ=255) gccggccgCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCggg > 1:1674389/1‑150 (MQ=255) gccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGGTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTGTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCggg > 2:1875401/1‑149 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTc < 2:1569628/150‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTc > 1:607577/1‑150 (MQ=255) ccgccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa < 2:866805/150‑3 (MQ=255) gccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa > 1:1384238/1‑146 (MQ=255) gccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa < 2:1384238/148‑3 (MQ=255) gccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCCTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt > 2:501811/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCtt < 1:67709/150‑2 (MQ=255) ccAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTg > 1:864148/1‑150 (MQ=255) ggcgggcgCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCaa < 1:500143/150‑1 (MQ=255) ggcgCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCg > 1:151271/1‑150 (MQ=255) cccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTTCGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAg > 2:1927614/1‑150 (MQ=255) cccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAg > 2:1886204/1‑150 (MQ=255) ccAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGa > 1:1700482/1‑150 (MQ=255) aGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATc < 2:880207/150‑1 (MQ=255) aGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCCCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATc < 2:278451/150‑1 (MQ=255) tACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCAGCAAGCCGCTCAGATCAgg < 1:1035215/150‑1 (MQ=255) gcgcgGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGCAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTgg < 2:1700482/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTggg < 2:607577/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGCgggg < 2:1176585/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGcc < 1:1813018/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCa < 1:1420162/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGc > 2:1223657/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATGCCGCTCTCCTCGGTGGATACCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCAGCCCGGCTGCCGTGCGGTCCTGCAAGCCGCTTAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa < 2:840679/150‑1 (MQ=255) gAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAg > 2:367880/1‑150 (MQ=255) aCTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCCCGCAAGCGAAGTTGTCAGCCa > 1:166104/1‑150 (MQ=255) tGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg > 2:274384/1‑87 (MQ=255) tGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg < 1:274384/87‑1 (MQ=255) tGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGt < 1:30871/142‑1 (MQ=255) tGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGt > 2:30871/1‑142 (MQ=255) tGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATc > 1:935776/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGtcatca > 1:178616/1‑150 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt < 2:1743451/88‑1 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCt > 1:1743451/1‑88 (MQ=255) tttAAGCTTCATTCCACTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACgg < 2:1347997/150‑1 (MQ=255) ttAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGc < 2:935776/150‑1 (MQ=255) tAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGcc < 1:1223657/150‑1 (MQ=255) gCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCAtt < 1:1746265/150‑1 (MQ=255) cTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTgggg < 1:988287/113‑1 (MQ=255) cTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTgggg > 2:988287/1‑113 (MQ=255) aTTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCa < 2:39759/150‑1 (MQ=255) cGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg < 2:254739/69‑1 (MQ=255) cGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCg > 1:254739/1‑69 (MQ=255) cGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTgg > 1:241560/1‑150 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGt < 1:113419/150‑1 (MQ=255) gCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGt < 2:1252600/150‑1 (MQ=255) ctcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCt > 1:462275/1‑150 (MQ=255) tcGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTg > 1:246162/1‑150 (MQ=255) cGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTgc < 1:501811/150‑1 (MQ=255) ggTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTgcg > 1:1286490/1‑150 (MQ=255) gTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACgg < 1:699726/125‑1 (MQ=255) gTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACgg > 2:699726/1‑125 (MQ=255) gTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTgcgc < 2:1816218/150‑1 (MQ=255) gATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGc < 1:367880/150‑1 (MQ=255) atCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGt > 1:412873/1‑104 (MQ=255) atCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGt < 2:412873/104‑1 (MQ=255) atCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCgg > 1:1778826/1‑150 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa > 2:343580/1‑101 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa < 1:343580/101‑1 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATc > 1:1250616/1‑114 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATc < 2:1250616/114‑1 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGa > 2:1597155/1‑150 (MQ=255) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa > 2:1858175/1‑52 (MQ=38) tCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCAGCCGGGCggaa < 1:1858175/54‑3 (MQ=255) cGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCAt > 2:570876/1‑111 (MQ=255) cGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCAt < 1:570876/111‑1 (MQ=255) ggAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATg > 2:1334946/1‑150 (MQ=255) ggAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCCGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATg > 2:1242716/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGc > 2:1703144/1‑38 (MQ=255) ccTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGc < 1:1703144/38‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTggggg > 2:815846/1‑76 (MQ=255) ccTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTggggg < 1:815846/76‑1 (MQ=255) ctgctgctgCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCt < 2:1122215/150‑1 (MQ=255) tgctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAg > 2:1862942/1‑85 (MQ=255) tgctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAg < 1:1862942/85‑1 (MQ=255) tgctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGaa < 2:1840290/150‑1 (MQ=255) gctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAAt < 2:864148/150‑1 (MQ=255) ctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa < 2:58233/82‑1 (MQ=255) ctgcCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGaa > 1:58233/1‑82 (MQ=255) tgcCCATCGGGTTGCGCCCGGCTGCCGGGCGCTAGCCCGTGGCTCATAGGGGCTGGTCGCGGTGGAGGCCACGCAAGCTAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGc < 1:1886204/150‑1 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa < 2:241560/150‑1 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa < 1:1811900/150‑1 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa > 1:1786868/1‑150 (MQ=255) cccATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCa < 2:1786868/150‑1 (MQ=255) cATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAgg > 1:1311757/1‑150 (MQ=255) tCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTAGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCGATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCAAGGTc > 2:465063/1‑150 (MQ=255) ggTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGa > 2:145884/1‑106 (MQ=255) ggTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGa < 1:145884/106‑1 (MQ=255) ggTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACg > 2:698246/1‑150 (MQ=255) aggaccGCCCGGCAGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACg > 1:1176908/5‑150 (MQ=255) gTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTAAACGTTGTTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACgg < 1:1107326/150‑1 (MQ=255) ccGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTg < 1:1927614/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGc < 1:1242716/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAc < 2:151271/150‑1 (MQ=255) | GGCCGGCCGCCAGGCGGGCGCCCCAGTTACGCGGTTCGCGCGGGCGCAGGCGCTTGGCGTCGAAACTGCCTTTAAGCTTCATTCCGCTCTCCTCGGTGGATATCCGGAATTCGACCTGCTGCTGCCCATCGGGTTCCGCCCGGCTGCCGGGCGGTCCTGCAAGCCGCTCAGATCAGGCTGGCGGTGGGGGCCACGCAAGCGAAGTTGTCAGCCATCACGGCCATTTCGCACTGGTGAATCTGCGCGGCCGGAATGACGCCGTCCTTGAATGCCAGGTCACGGGTGGCCGAC > NC_002947/2050964‑2051254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |